MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 35611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012668	CTG	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606123
2	NC_012668	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606123
3	NC_012668	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606123
4	NC_012668	AAG	2	6	479	484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606123
5	NC_012668	TTC	2	6	798	803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606124
6	NC_012668	CGC	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606124
7	NC_012668	CGT	3	9	919	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606124
8	NC_012668	AGA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
9	NC_012668	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
10	NC_012668	TTG	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606124
11	NC_012668	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
12	NC_012668	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606124
13	NC_012668	GTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606124
14	NC_012668	GAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606124
15	NC_012668	CAG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606124
16	NC_012668	GAA	3	9	1643	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606124
17	NC_012668	AAT	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606125
18	NC_012668	CCA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
19	NC_012668	GCA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606125
20	NC_012668	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
21	NC_012668	GCG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606125
22	NC_012668	ATC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606125
23	NC_012668	ACC	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606125
24	NC_012668	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606125
25	NC_012668	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606125
26	NC_012668	CGC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606125
27	NC_012668	CAT	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606125
28	NC_012668	GAT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606125
29	NC_012668	TTG	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606126
30	NC_012668	CCA	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606126
31	NC_012668	CTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606126
32	NC_012668	TGG	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606126
33	NC_012668	CGC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606126
34	NC_012668	ATG	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606126
35	NC_012668	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606126
36	NC_012668	TCA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606126
37	NC_012668	CAG	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606126
38	NC_012668	ATC	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606126
39	NC_012668	GCC	2	6	2995	3000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606126
40	NC_012668	TGC	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606126
41	NC_012668	TGG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606126
42	NC_012668	CAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606126
43	NC_012668	GTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606126
44	NC_012668	ATC	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
45	NC_012668	CTG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606127
46	NC_012668	ATC	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
47	NC_012668	CAG	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
48	NC_012668	CAT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
49	NC_012668	ATG	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606127
50	NC_012668	CCA	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
51	NC_012668	ACC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
52	NC_012668	TGG	2	6	4538	4543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
53	NC_012668	AAT	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606127
54	NC_012668	GAC	2	6	4746	4751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
55	NC_012668	ATC	2	6	4794	4799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
56	NC_012668	ACG	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606127
57	NC_012668	CCA	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
58	NC_012668	GTG	2	6	5012	5017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
59	NC_012668	CAT	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606127
60	NC_012668	CGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606127
61	NC_012668	CCA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
62	NC_012668	GGA	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606127
63	NC_012668	GGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606127
64	NC_012668	ATG	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606127
65	NC_012668	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606127
66	NC_012668	CCA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606127
67	NC_012668	AAC	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606128
68	NC_012668	AAC	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606128
69	NC_012668	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606128
70	NC_012668	TGC	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606128
71	NC_012668	CAT	2	6	5864	5869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
72	NC_012668	GTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606128
73	NC_012668	GCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606128
74	NC_012668	TGC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606128
75	NC_012668	TAC	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
76	NC_012668	AGA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606128
77	NC_012668	ATC	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606128
78	NC_012668	CAC	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606129
79	NC_012668	ACG	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606129
80	NC_012668	ATA	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606129
81	NC_012668	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606129
82	NC_012668	TCA	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606129
83	NC_012668	TGA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606129
84	NC_012668	GCA	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606129
85	NC_012668	ACT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606129
86	NC_012668	GTG	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606130
87	NC_012668	ACT	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606130
88	NC_012668	CTT	2	6	7394	7399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
89	NC_012668	CCA	2	6	7555	7560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606130
90	NC_012668	CTG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606130
91	NC_012668	TCT	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
92	NC_012668	TCT	2	6	7681	7686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606130
93	NC_012668	AAG	2	6	7711	7716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606130
94	NC_012668	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606131
95	NC_012668	GCA	2	6	8059	8064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606131
96	NC_012668	TGC	2	6	8128	8133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606131
97	NC_012668	ATC	2	6	8190	8195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606131
98	NC_012668	CCA	2	6	8290	8295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606131
99	NC_012668	GAC	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606131
100	NC_012668	CTG	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606131
101	NC_012668	TAA	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606131
102	NC_012668	TAT	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606131
103	NC_012668	ACC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606132
104	NC_012668	GCC	2	6	9129	9134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606132
105	NC_012668	CAG	2	6	9207	9212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
106	NC_012668	CTG	2	6	9225	9230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606132
107	NC_012668	TTA	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606132
108	NC_012668	AAG	2	6	9265	9270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606132
109	NC_012668	GCA	2	6	9323	9328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
110	NC_012668	CAA	2	6	9419	9424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606132
111	NC_012668	AAG	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606132
112	NC_012668	ACT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606132
113	NC_012668	GCA	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
114	NC_012668	ATG	2	6	9771	9776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606132
115	NC_012668	ATC	2	6	9813	9818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606132
116	NC_012668	TGT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606132
117	NC_012668	GCA	2	6	9920	9925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
118	NC_012668	CAA	2	6	9930	9935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606132
119	NC_012668	ACG	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
120	NC_012668	AAG	2	6	10030	10035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606132
121	NC_012668	GCG	2	6	10044	10049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606132
122	NC_012668	CGT	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606132
123	NC_012668	CAA	2	6	10242	10247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606132
124	NC_012668	GCC	2	6	10303	10308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606132
125	NC_012668	CCA	2	6	10401	10406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606132
126	NC_012668	GGT	2	6	10437	10442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606132
127	NC_012668	CTG	2	6	10488	10493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606132
128	NC_012668	AGC	2	6	10519	10524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606132
129	NC_012668	CGC	2	6	10560	10565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606132
130	NC_012668	TGG	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606132
131	NC_012668	TCG	2	6	10624	10629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606132
132	NC_012668	TGA	2	6	10670	10675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606132
133	NC_012668	GGC	2	6	10761	10766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606133
134	NC_012668	CGC	2	6	10777	10782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606133
135	NC_012668	ACA	2	6	10889	10894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606133
136	NC_012668	CGC	2	6	10908	10913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606133
137	NC_012668	TTG	2	6	10962	10967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606133
138	NC_012668	CAA	2	6	10977	10982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606133
139	NC_012668	TCA	2	6	11028	11033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606133
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141	NC_012668	TGG	2	6	11186	11191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606134
142	NC_012668	CTG	2	6	11220	11225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606134
143	NC_012668	TCG	2	6	11239	11244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606134
144	NC_012668	CAA	2	6	11254	11259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606134
145	NC_012668	ACG	2	6	11335	11340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606134
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149	NC_012668	CTT	2	6	11694	11699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606135
150	NC_012668	GCA	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606135
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152	NC_012668	ACC	2	6	12057	12062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606135
153	NC_012668	GTG	2	6	12117	12122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606135
154	NC_012668	CGT	2	6	12134	12139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606135
155	NC_012668	CAT	2	6	12439	12444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606136
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159	NC_012668	ACG	2	6	12686	12691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606136
160	NC_012668	GCG	2	6	12696	12701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606136
161	NC_012668	GTG	2	6	12756	12761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606136
162	NC_012668	TTA	2	6	13036	13041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606137
163	NC_012668	ACT	2	6	13075	13080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606137
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239	NC_012668	GCC	2	6	19951	19956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606145
240	NC_012668	AGG	2	6	19974	19979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606145
241	NC_012668	ATG	2	6	20080	20085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606145
242	NC_012668	TGC	2	6	20235	20240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606145
243	NC_012668	CAT	2	6	20268	20273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606145
244	NC_012668	TGC	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606145
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247	NC_012668	GAC	2	6	20563	20568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606145
248	NC_012668	GTT	2	6	20689	20694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606145
249	NC_012668	GTT	2	6	20912	20917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606146
250	NC_012668	ATT	2	6	20931	20936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606146
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252	NC_012668	GCC	2	6	21036	21041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606146
253	NC_012668	CGT	2	6	21047	21052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606146
254	NC_012668	CAT	2	6	21146	21151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606146
255	NC_012668	CGT	2	6	21164	21169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606146
256	NC_012668	GCA	3	9	21216	21224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606146
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259	NC_012668	GGT	2	6	21477	21482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606146
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265	NC_012668	GTA	2	6	22113	22118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606147
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273	NC_012668	CTT	2	6	22621	22626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606148
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375	NC_012668	AAT	2	6	30447	30452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
376	NC_012668	GCC	2	6	30481	30486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606156
377	NC_012668	TGC	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
378	NC_012668	TTG	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606156
379	NC_012668	ATG	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
380	NC_012668	GAT	2	6	30939	30944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
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384	NC_012668	ATA	2	6	31223	31228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
385	NC_012668	TGC	2	6	31297	31302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
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497	NC_012668	CAT	2	6	41672	41677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606165
498	NC_012668	GCA	2	6	41749	41754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606165
499	NC_012668	ACC	2	6	41757	41762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606165
500	NC_012668	GAT	2	6	41769	41774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606165

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