MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	TCCATC	2	12	14881	14892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012667	AAAAAT	2	12	71561	71572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012667	CATCAA	2	12	77096	77107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012667	TCACTT	2	12	78295	78306	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012667	CATACC	2	12	93225	93236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012667	AATATG	2	12	225197	225208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012667	ATACCG	2	12	265178	265189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012667	AGCGGA	2	12	306299	306310	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012667	CATTTT	2	12	317728	317739	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012667	TTGTTT	2	12	319016	319027	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012667	AATTTT	2	12	329944	329955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012667	TTTTAA	2	12	351272	351283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012667	TTTCTA	2	12	359332	359343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012667	TTGTGA	2	12	405202	405213	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012667	ATTTTG	2	12	437385	437396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012667	CAATAA	2	12	500793	500804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012667	TTAATT	2	12	513390	513401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012667	GTTATT	2	12	534064	534075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012667	GCTTAG	2	12	562027	562038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012667	ATTCCT	2	12	626174	626185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012667	TGGTTT	2	12	641261	641272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012667	CAGTGT	2	12	658099	658110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012667	GGGTTG	2	12	668159	668170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012667	GTTTGT	2	12	710772	710783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012667	GAAAAT	2	12	711081	711092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012667	TCAGAA	2	12	711701	711712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012667	GCTTTA	2	12	712251	712262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012667	AAAAAT	2	12	722095	722106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012667	TATTTG	2	12	729415	729426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012667	AAAAGA	2	12	765553	765564	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012667	TTGATC	2	12	767257	767268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012667	ATAACC	2	12	775673	775684	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012667	CCACTA	2	12	883244	883255	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012667	TCACTA	2	12	912410	912421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012667	CAAAGC	2	12	939274	939285	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012667	AAAAAC	2	12	945097	945108	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012667	CAATAA	2	12	950090	950101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012667	TAGTGG	2	12	957883	957894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012667	AATAGG	2	12	958578	958589	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012667	TTAAAA	2	12	969896	969907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012667	CTCAAC	2	12	992435	992446	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012667	ACAACC	2	12	1001782	1001793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012667	CAAAAA	2	12	1005769	1005780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012667	AAACTC	2	12	1022804	1022815	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012667	CAACTA	2	12	1033660	1033671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012667	CTCAAC	2	12	1036554	1036565	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012667	AAGTCA	2	12	1048849	1048860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.