MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 2897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	CGTG	2	8	66	73	0 %	25 %	50 %	25 %	229605063
2	NC_012667	GCTG	2	8	230	237	0 %	25 %	50 %	25 %	229605063
3	NC_012667	TCAA	2	8	466	473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012667	AGCT	2	8	519	526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012667	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012667	GCTG	2	8	668	675	0 %	25 %	50 %	25 %	229605064
7	NC_012667	TCAA	2	8	904	911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012667	AGCT	2	8	957	964	25 %	25 %	25 %	25 %	229605065
9	NC_012667	GCTT	2	8	1002	1009	0 %	50 %	25 %	25 %	229605065
10	NC_012667	AATG	2	8	2176	2183	50 %	25 %	25 %	0 %	229605066
11	NC_012667	GCAT	2	8	2702	2709	25 %	25 %	25 %	25 %	229605066
12	NC_012667	AAGG	2	8	3205	3212	50 %	0 %	50 %	0 %	229605066
13	NC_012667	GTTA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012667	CTAT	2	8	3652	3659	25 %	50 %	0 %	25 %	229605067
15	NC_012667	TGAT	2	8	4050	4057	25 %	50 %	25 %	0 %	229605067
16	NC_012667	TCAT	2	8	4186	4193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012667	ATGC	2	8	4268	4275	25 %	25 %	25 %	25 %	229605068
18	NC_012667	TCAA	2	8	4617	4624	50 %	25 %	0 %	25 %	229605068
19	NC_012667	GCTC	2	8	4635	4642	0 %	25 %	25 %	50 %	229605068
20	NC_012667	CGAA	2	8	4714	4721	50 %	0 %	25 %	25 %	229605068
21	NC_012667	TTCA	2	8	5246	5253	25 %	50 %	0 %	25 %	229605068
22	NC_012667	AGTG	2	8	5377	5384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012667	TTCA	2	8	6137	6144	25 %	50 %	0 %	25 %	229605069
24	NC_012667	TCAA	2	8	6643	6650	50 %	25 %	0 %	25 %	229605070
25	NC_012667	ACCG	2	8	7047	7054	25 %	0 %	25 %	50 %	229605070
26	NC_012667	CCAC	2	8	7295	7302	25 %	0 %	0 %	75 %	229605070
27	NC_012667	CTCG	2	8	9479	9486	0 %	25 %	25 %	50 %	229605072
28	NC_012667	CCAT	2	8	9637	9644	25 %	25 %	0 %	50 %	229605073
29	NC_012667	ACAA	2	8	9832	9839	75 %	0 %	0 %	25 %	229605073
30	NC_012667	GGAA	2	8	10531	10538	50 %	0 %	50 %	0 %	229605074
31	NC_012667	TTGG	2	8	10845	10852	0 %	50 %	50 %	0 %	229605074
32	NC_012667	AAGC	2	8	11679	11686	50 %	0 %	25 %	25 %	229605075
33	NC_012667	TGTT	2	8	12082	12089	0 %	75 %	25 %	0 %	229605076
34	NC_012667	TTGA	2	8	12329	12336	25 %	50 %	25 %	0 %	229605077
35	NC_012667	GATG	2	8	12382	12389	25 %	25 %	50 %	0 %	229605077
36	NC_012667	TCAA	2	8	13199	13206	50 %	25 %	0 %	25 %	229605078
37	NC_012667	AATT	2	8	13985	13992	50 %	50 %	0 %	0 %	229605079
38	NC_012667	CAGC	2	8	14146	14153	25 %	0 %	25 %	50 %	229605079
39	NC_012667	AAGG	2	8	15079	15086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012667	GCAA	2	8	15370	15377	50 %	0 %	25 %	25 %	229605080
41	NC_012667	GGAA	2	8	15469	15476	50 %	0 %	50 %	0 %	229605080
42	NC_012667	CACT	2	8	15520	15527	25 %	25 %	0 %	50 %	229605080
43	NC_012667	AAGA	2	8	15594	15601	75 %	0 %	25 %	0 %	229605080
44	NC_012667	GATT	2	8	15723	15730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012667	GTAA	2	8	16436	16443	50 %	25 %	25 %	0 %	229605082
46	NC_012667	TTGT	2	8	16841	16848	0 %	75 %	25 %	0 %	229605082
47	NC_012667	AATC	2	8	17284	17291	50 %	25 %	0 %	25 %	229605082
48	NC_012667	ACAA	2	8	17737	17744	75 %	0 %	0 %	25 %	229605083
49	NC_012667	GCCA	2	8	18211	18218	25 %	0 %	25 %	50 %	229605084
50	NC_012667	AGCG	2	8	18680	18687	25 %	0 %	50 %	25 %	229605084
51	NC_012667	TACA	2	8	18835	18842	50 %	25 %	0 %	25 %	229605084
52	NC_012667	CTTG	2	8	19131	19138	0 %	50 %	25 %	25 %	229605084
53	NC_012667	GTGA	2	8	19448	19455	25 %	25 %	50 %	0 %	229605084
54	NC_012667	GGTT	2	8	19701	19708	0 %	50 %	50 %	0 %	229605084
55	NC_012667	AAAG	2	8	22391	22398	75 %	0 %	25 %	0 %	229605087
56	NC_012667	TGCG	2	8	23192	23199	0 %	25 %	50 %	25 %	229605088
57	NC_012667	TGAA	2	8	23413	23420	50 %	25 %	25 %	0 %	229605088
58	NC_012667	TTCC	2	8	24739	24746	0 %	50 %	0 %	50 %	229605089
59	NC_012667	AGTG	2	8	24977	24984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012667	ATAG	2	8	25068	25075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012667	TGAC	2	8	25153	25160	25 %	25 %	25 %	25 %	229605090
62	NC_012667	GAAC	2	8	25637	25644	50 %	0 %	25 %	25 %	229605090
63	NC_012667	AGCC	2	8	25882	25889	25 %	0 %	25 %	50 %	229605090
64	NC_012667	TTTA	2	8	26258	26265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012667	CTAA	2	8	26272	26279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012667	GCCA	2	8	26447	26454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012667	TAGT	2	8	26571	26578	25 %	50 %	25 %	0 %	229605091
68	NC_012667	TTGA	2	8	26582	26589	25 %	50 %	25 %	0 %	229605091
69	NC_012667	AATT	2	8	26955	26962	50 %	50 %	0 %	0 %	229605092
70	NC_012667	GGGC	2	8	27939	27946	0 %	0 %	75 %	25 %	229605092
71	NC_012667	GGCT	2	8	28787	28794	0 %	25 %	50 %	25 %	229605092
72	NC_012667	GCAG	2	8	29276	29283	25 %	0 %	50 %	25 %	229605092
73	NC_012667	GATG	2	8	29554	29561	25 %	25 %	50 %	0 %	229605092
74	NC_012667	CACC	2	8	29902	29909	25 %	0 %	0 %	75 %	229605093
75	NC_012667	ATCA	2	8	30968	30975	50 %	25 %	0 %	25 %	229605094
76	NC_012667	CTCA	2	8	31013	31020	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
77	NC_012667	ATCC	2	8	31322	31329	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
78	NC_012667	TTAA	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012667	TGCT	2	8	31808	31815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012667	GTTG	2	8	31938	31945	0 %	50 %	50 %	0 %	229605095
81	NC_012667	GCGA	2	8	32106	32113	25 %	0 %	50 %	25 %	229605095
82	NC_012667	GCTT	2	8	32471	32478	0 %	50 %	25 %	25 %	229605095
83	NC_012667	TGAA	2	8	32847	32854	50 %	25 %	25 %	0 %	229605095
84	NC_012667	TAAA	2	8	33691	33698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012667	ACCA	2	8	33804	33811	50 %	0 %	0 %	50 %	229605096
86	NC_012667	GTTT	2	8	34260	34267	0 %	75 %	25 %	0 %	229605096
87	NC_012667	GGTA	2	8	34828	34835	25 %	25 %	50 %	0 %	229605096
88	NC_012667	ACCC	2	8	35684	35691	25 %	0 %	0 %	75 %	229605096
89	NC_012667	CTGA	2	8	35747	35754	25 %	25 %	25 %	25 %	229605096
90	NC_012667	CAAA	2	8	36052	36059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012667	CGTT	2	8	36326	36333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012667	TACT	2	8	36433	36440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012667	AATT	2	8	36618	36625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012667	TAGC	2	8	37005	37012	25 %	25 %	25 %	25 %	229605097
95	NC_012667	AAAC	2	8	37097	37104	75 %	0 %	0 %	25 %	229605097
96	NC_012667	CGGT	2	8	37578	37585	0 %	25 %	50 %	25 %	229605097
97	NC_012667	AGCA	2	8	37926	37933	50 %	0 %	25 %	25 %	229605097
98	NC_012667	CAAG	2	8	38113	38120	50 %	0 %	25 %	25 %	229605097
99	NC_012667	ATCC	2	8	38256	38263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012667	ACTC	2	8	38366	38373	25 %	25 %	0 %	50 %	229605098
101	NC_012667	TTTC	2	8	38458	38465	0 %	75 %	0 %	25 %	229605098
102	NC_012667	CTAT	2	8	38556	38563	25 %	50 %	0 %	25 %	229605098
103	NC_012667	CCAG	2	8	38741	38748	25 %	0 %	25 %	50 %	229605098
104	NC_012667	ATGT	2	8	38828	38835	25 %	50 %	25 %	0 %	229605098
105	NC_012667	CAAC	2	8	39464	39471	50 %	0 %	0 %	50 %	229605099
106	NC_012667	AGCC	2	8	39572	39579	25 %	0 %	25 %	50 %	229605099
107	NC_012667	ATGT	2	8	40015	40022	25 %	50 %	25 %	0 %	229605101
108	NC_012667	TTGG	2	8	40415	40422	0 %	50 %	50 %	0 %	229605101
109	NC_012667	GGCG	2	8	40713	40720	0 %	0 %	75 %	25 %	229605101
110	NC_012667	TGAT	2	8	42339	42346	25 %	50 %	25 %	0 %	229605102
111	NC_012667	TTCT	2	8	43128	43135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012667	TTTC	2	8	43725	43732	0 %	75 %	0 %	25 %	229605103
113	NC_012667	ACAA	2	8	43766	43773	75 %	0 %	0 %	25 %	229605103
114	NC_012667	GAAG	2	8	44365	44372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012667	AGTA	2	8	45291	45298	50 %	25 %	25 %	0 %	229605104
116	NC_012667	TTTC	2	8	46704	46711	0 %	75 %	0 %	25 %	229605105
117	NC_012667	TACA	2	8	47128	47135	50 %	25 %	0 %	25 %	229605105
118	NC_012667	TCAA	2	8	47489	47496	50 %	25 %	0 %	25 %	229605105
119	NC_012667	AGAA	2	8	47788	47795	75 %	0 %	25 %	0 %	229605105
120	NC_012667	AATT	2	8	47800	47807	50 %	50 %	0 %	0 %	229605105
121	NC_012667	ATGA	2	8	48183	48190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012667	TTGC	2	8	48849	48856	0 %	50 %	25 %	25 %	229605107
123	NC_012667	TCGA	2	8	48909	48916	25 %	25 %	25 %	25 %	229605107
124	NC_012667	ACTC	2	8	49170	49177	25 %	25 %	0 %	50 %	229605107
125	NC_012667	CAAG	2	8	50557	50564	50 %	0 %	25 %	25 %	229605108
126	NC_012667	CTCG	2	8	51480	51487	0 %	25 %	25 %	50 %	229605109
127	NC_012667	GTCT	2	8	51488	51495	0 %	50 %	25 %	25 %	229605109
128	NC_012667	GGCT	2	8	51624	51631	0 %	25 %	50 %	25 %	229605109
129	NC_012667	TCAG	2	8	52087	52094	25 %	25 %	25 %	25 %	229605109
130	NC_012667	GCAC	2	8	52309	52316	25 %	0 %	25 %	50 %	229605109
131	NC_012667	ACCA	2	8	52597	52604	50 %	0 %	0 %	50 %	229605109
132	NC_012667	AAAC	2	8	52707	52714	75 %	0 %	0 %	25 %	229605109
133	NC_012667	AAAG	2	8	53180	53187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012667	TAAG	2	8	53307	53314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012667	AAAT	2	8	53898	53905	75 %	25 %	0 %	0 %	229605111
136	NC_012667	TATC	2	8	54640	54647	25 %	50 %	0 %	25 %	229605111
137	NC_012667	CCAT	2	8	55212	55219	25 %	25 %	0 %	50 %	229605112
138	NC_012667	TCAG	2	8	55256	55263	25 %	25 %	25 %	25 %	229605112
139	NC_012667	TAAA	2	8	55430	55437	75 %	25 %	0 %	0 %	229605112
140	NC_012667	CTTT	2	8	55522	55529	0 %	75 %	0 %	25 %	229605112
141	NC_012667	TACT	2	8	57148	57155	25 %	50 %	0 %	25 %	229605113
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143	NC_012667	AAGC	2	8	59246	59253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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