MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 13465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	CCA	2	6	21	26	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012667	AGC	2	6	155	160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605063
3	NC_012667	CAA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605063
4	NC_012667	CAA	2	6	256	261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605063
5	NC_012667	AGG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605063
6	NC_012667	CAT	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012667	GCC	2	6	576	581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605064
8	NC_012667	AGC	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605064
9	NC_012667	CAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605064
10	NC_012667	CAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605064
11	NC_012667	AGG	2	6	762	767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605064
12	NC_012667	CGC	2	6	779	784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605064
13	NC_012667	CAT	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605065
14	NC_012667	GCC	2	6	1014	1019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605065
15	NC_012667	CGG	2	6	1064	1069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605065
16	NC_012667	AGC	2	6	1092	1097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605065
17	NC_012667	GCC	2	6	1197	1202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605065
18	NC_012667	ATG	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605065
19	NC_012667	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605065
20	NC_012667	GCA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605065
21	NC_012667	GTG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012667	TAA	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012667	GCG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012667	ACA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012667	TTC	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012667	ATG	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012667	ATC	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605066
28	NC_012667	TGT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605066
29	NC_012667	GCA	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
30	NC_012667	AGC	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
31	NC_012667	GCA	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
32	NC_012667	CGC	3	9	2121	2129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605066
33	NC_012667	CAA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605066
34	NC_012667	TTA	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605066
35	NC_012667	CAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605066
36	NC_012667	TCT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605066
37	NC_012667	TCA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605066
38	NC_012667	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605066
39	NC_012667	ATG	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
40	NC_012667	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605066
41	NC_012667	ATG	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
42	NC_012667	TGG	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605066
43	NC_012667	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
44	NC_012667	TGC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605066
45	NC_012667	TAA	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605066
46	NC_012667	GAC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
47	NC_012667	ATA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012667	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605067
49	NC_012667	AAG	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605067
50	NC_012667	TTG	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605067
51	NC_012667	CGG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605067
52	NC_012667	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605067
53	NC_012667	TGC	3	9	4014	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605067
54	NC_012667	CGG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605067
55	NC_012667	CAT	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605067
56	NC_012667	TGT	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012667	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012667	CCA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012667	TGG	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012667	AGA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605068
61	NC_012667	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605068
62	NC_012667	TAG	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605068
63	NC_012667	AGT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605068
64	NC_012667	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605068
65	NC_012667	GCA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605068
66	NC_012667	GCA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605068
67	NC_012667	CAT	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605068
68	NC_012667	TCA	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605068
69	NC_012667	CCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605068
70	NC_012667	AAC	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012667	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
72	NC_012667	TGA	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605069
73	NC_012667	CCA	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
74	NC_012667	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605069
75	NC_012667	ATG	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605069
76	NC_012667	CAT	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605069
77	NC_012667	CTG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605069
78	NC_012667	CAC	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
79	NC_012667	TCA	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605069
80	NC_012667	AAT	2	6	6068	6073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605069
81	NC_012667	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012667	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012667	AAT	2	6	6385	6390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012667	CAC	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012667	AAC	2	6	6492	6497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012667	ACG	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605070
87	NC_012667	TGC	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
88	NC_012667	GCT	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
89	NC_012667	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
90	NC_012667	GAT	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
91	NC_012667	CCA	2	6	6785	6790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
92	NC_012667	TGC	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
93	NC_012667	CGC	2	6	6874	6879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605070
94	NC_012667	CAT	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
95	NC_012667	CAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
96	NC_012667	CAT	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
97	NC_012667	CGG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
98	NC_012667	TCT	2	6	7027	7032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
99	NC_012667	CAT	2	6	7035	7040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
100	NC_012667	AAG	2	6	7055	7060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605070
101	NC_012667	GGC	2	6	7066	7071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
102	NC_012667	CCA	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
103	NC_012667	CCA	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
104	NC_012667	TGA	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
105	NC_012667	TTC	2	6	7237	7242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
106	NC_012667	CAT	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
107	NC_012667	GCG	2	6	7456	7461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
108	NC_012667	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605070
109	NC_012667	ATC	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
110	NC_012667	TTC	2	6	7591	7596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
111	NC_012667	CGG	2	6	7632	7637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
112	NC_012667	TGA	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
113	NC_012667	CAA	2	6	7720	7725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605070
114	NC_012667	CTT	3	9	7812	7820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
115	NC_012667	GAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605070
116	NC_012667	GTA	2	6	7895	7900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
117	NC_012667	GAT	3	9	8016	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
118	NC_012667	ACC	2	6	8116	8121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
119	NC_012667	CAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
120	NC_012667	AAG	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012667	AAC	2	6	8396	8401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
122	NC_012667	ATC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605071
123	NC_012667	AGC	2	6	8523	8528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605071
124	NC_012667	TCC	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605071
125	NC_012667	GAT	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605071
126	NC_012667	CAA	2	6	8834	8839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
127	NC_012667	CAA	2	6	8849	8854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
128	NC_012667	AGG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605071
129	NC_012667	GCG	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605072
130	NC_012667	GTG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605072
131	NC_012667	CGG	2	6	9150	9155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605072
132	NC_012667	TCG	2	6	9326	9331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605072
133	NC_012667	GTG	2	6	9442	9447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605072
134	NC_012667	TAC	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605072
135	NC_012667	CAG	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605073
136	NC_012667	GTC	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
137	NC_012667	TAC	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605073
138	NC_012667	CAT	2	6	9761	9766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605073
139	NC_012667	CCG	2	6	9987	9992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
140	NC_012667	GTC	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
141	NC_012667	GCC	2	6	10158	10163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
142	NC_012667	CGC	2	6	10217	10222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
143	NC_012667	TGC	2	6	10267	10272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
144	NC_012667	AAC	2	6	10353	10358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605073
145	NC_012667	ACC	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605074
146	NC_012667	ACC	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605074
147	NC_012667	CGG	2	6	10915	10920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605074
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149	NC_012667	CAA	2	6	11006	11011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605074
150	NC_012667	CGG	2	6	11016	11021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605074
151	NC_012667	AGG	2	6	11058	11063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012667	GGA	2	6	11136	11141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605075
153	NC_012667	GCC	2	6	11216	11221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605075
154	NC_012667	GAT	2	6	11230	11235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605075
155	NC_012667	CCA	2	6	11237	11242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605075
156	NC_012667	GAG	2	6	11266	11271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605075
157	NC_012667	TCA	2	6	11463	11468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605075
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159	NC_012667	TGA	2	6	11787	11792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605075
160	NC_012667	GTG	2	6	11824	11829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605075
161	NC_012667	CAG	2	6	11984	11989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_012667	GGC	2	6	12076	12081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605076
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165	NC_012667	CTG	2	6	12302	12307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605077
166	NC_012667	GCG	2	6	12414	12419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605077
167	NC_012667	CCA	2	6	12448	12453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605077
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235	NC_012667	ATT	2	6	17415	17420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_012667	AAT	2	6	17422	17427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_012667	AAG	2	6	17494	17499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_012667	GAT	2	6	17605	17610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_012667	GGT	2	6	17779	17784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605083
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256	NC_012667	TGC	2	6	18897	18902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605084
257	NC_012667	TCA	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605084
258	NC_012667	CAT	2	6	19266	19271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605084
259	NC_012667	CCG	2	6	19484	19489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605084
260	NC_012667	CAC	2	6	19512	19517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605084
261	NC_012667	CCA	2	6	19518	19523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605084
262	NC_012667	ACC	2	6	19561	19566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605084
263	NC_012667	GTT	2	6	19588	19593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605084
264	NC_012667	GCA	2	6	19782	19787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605084
265	NC_012667	GTG	2	6	19829	19834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605084
266	NC_012667	GCT	2	6	19846	19851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605084
267	NC_012667	CAC	2	6	19873	19878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605084
268	NC_012667	CTT	2	6	19960	19965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605084
269	NC_012667	TTG	2	6	20185	20190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605085
270	NC_012667	TGA	2	6	20302	20307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605085
271	NC_012667	CCA	2	6	20308	20313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605085
272	NC_012667	TCA	2	6	20329	20334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605085
273	NC_012667	ATG	2	6	20368	20373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605085
274	NC_012667	AGC	2	6	20431	20436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605085
275	NC_012667	CAA	2	6	20556	20561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605085
276	NC_012667	CGT	2	6	20628	20633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605085
277	NC_012667	TGC	2	6	20776	20781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605085
278	NC_012667	CTG	2	6	21118	21123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_012667	CGA	2	6	21269	21274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605086
280	NC_012667	CAC	4	12	21315	21326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605086
281	NC_012667	TCG	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605086
282	NC_012667	ACC	2	6	21474	21479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605086
283	NC_012667	TGA	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605086
284	NC_012667	GCT	2	6	21704	21709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605086
285	NC_012667	AGC	2	6	21760	21765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605086
286	NC_012667	CCG	2	6	21936	21941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605087
287	NC_012667	CAC	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605087
288	NC_012667	GGT	2	6	21965	21970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605087
289	NC_012667	GAT	2	6	21992	21997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605087
290	NC_012667	AGC	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
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292	NC_012667	AGC	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
293	NC_012667	CAG	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
294	NC_012667	AGC	2	6	22284	22289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
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298	NC_012667	CAC	2	6	22580	22585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605087
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318	NC_012667	CTC	2	6	23809	23814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
319	NC_012667	TGG	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605089
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348	NC_012667	TTA	2	6	26534	26539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605091
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375	NC_012667	TTC	2	6	29606	29611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_012667	CGC	2	6	29721	29726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605093
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