MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	CG	3	6	450	455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012667	CG	3	6	888	893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012667	CA	3	6	1783	1788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012667	AG	3	6	1977	1982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012667	CT	3	6	8297	8302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012667	AC	3	6	14900	14905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012667	AG	3	6	24798	24803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012667	TG	3	6	24840	24845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012667	AT	3	6	26206	26211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012667	AG	3	6	36041	36046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012667	AT	3	6	36094	36099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012667	CT	3	6	36130	36135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012667	CA	3	6	36343	36348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012667	CT	3	6	36374	36379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012667	TA	3	6	36412	36417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012667	GT	3	6	41251	41256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012667	GC	3	6	41308	41313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012667	GT	3	6	41438	41443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012667	TG	4	8	48076	48083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012667	CG	3	6	48132	48137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012667	CT	4	8	51349	51356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012667	GA	3	6	58978	58983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012667	GT	3	6	77040	77045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012667	AT	4	8	89278	89285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012667	AC	3	6	91932	91937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012667	CT	3	6	98075	98080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012667	CT	3	6	98187	98192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012667	GC	3	6	98700	98705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012667	AT	3	6	109734	109739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012667	TA	3	6	118407	118412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012667	GC	3	6	118437	118442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012667	CT	3	6	119988	119993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012667	CT	3	6	120470	120475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012667	GT	3	6	122195	122200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012667	CT	4	8	122272	122279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012667	AG	3	6	125120	125125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012667	AC	3	6	125131	125136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012667	TC	3	6	125755	125760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012667	TA	3	6	132544	132549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012667	TA	3	6	132634	132639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012667	AC	3	6	132769	132774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012667	TG	3	6	136040	136045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012667	AT	3	6	156879	156884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012667	AT	3	6	157067	157072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012667	AT	3	6	158474	158479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012667	CT	3	6	162708	162713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012667	CA	3	6	163535	163540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012667	TG	3	6	171162	171167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012667	TC	3	6	171658	171663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012667	AT	3	6	171829	171834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012667	AC	3	6	172965	172970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012667	CA	3	6	176053	176058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012667	TA	3	6	176776	176781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012667	GA	4	8	176816	176823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012667	AG	3	6	179944	179949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012667	TC	3	6	181022	181027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012667	AG	3	6	181126	181131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012667	TG	3	6	184500	184505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012667	TC	3	6	184942	184947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012667	CA	3	6	187026	187031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012667	GT	3	6	187261	187266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012667	AG	3	6	211355	211360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012667	TC	3	6	211375	211380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012667	AC	3	6	218662	218667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012667	TC	3	6	224779	224784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012667	TA	3	6	225001	225006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012667	AG	3	6	226369	226374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012667	TA	3	6	230378	230383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012667	GA	4	8	237673	237680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012667	CT	3	6	237884	237889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012667	TC	4	8	240493	240500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012667	AG	3	6	240577	240582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012667	TA	3	6	254112	254117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012667	CT	3	6	258713	258718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012667	GA	3	6	261814	261819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012667	CT	3	6	265001	265006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012667	TC	3	6	268718	268723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012667	CT	3	6	269556	269561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012667	CA	3	6	272728	272733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012667	AG	3	6	272821	272826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012667	TG	3	6	273523	273528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012667	CT	3	6	284329	284334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012667	GA	3	6	292602	292607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012667	GA	3	6	302645	302650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012667	TA	3	6	328039	328044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012667	AT	4	8	329864	329871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012667	AT	4	8	329907	329914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012667	CA	3	6	330061	330066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012667	GA	4	8	334372	334379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012667	AC	3	6	334387	334392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012667	GC	3	6	335872	335877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012667	TA	3	6	336891	336896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012667	AC	3	6	341434	341439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012667	CA	3	6	342113	342118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012667	TC	3	6	346038	346043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012667	TC	3	6	348936	348941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012667	CA	3	6	351048	351053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012667	AG	3	6	352803	352808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012667	TC	3	6	352814	352819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012667	AT	3	6	352836	352841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012667	GC	3	6	368517	368522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012667	CT	3	6	368795	368800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012667	AG	3	6	380647	380652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012667	TG	3	6	387355	387360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012667	TG	3	6	387943	387948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012667	CT	3	6	388646	388651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012667	AC	3	6	392181	392186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012667	AG	3	6	400469	400474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012667	AG	3	6	403457	403462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012667	AG	3	6	405284	405289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012667	CT	3	6	405308	405313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012667	GT	3	6	416913	416918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012667	CT	4	8	424043	424050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012667	GC	3	6	426338	426343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012667	TA	3	6	428369	428374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012667	TG	3	6	435928	435933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012667	AG	3	6	441096	441101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012667	TC	3	6	444503	444508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012667	TC	3	6	446655	446660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012667	AG	3	6	446692	446697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012667	TC	3	6	448197	448202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012667	CT	3	6	448298	448303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012667	AC	3	6	453623	453628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012667	AG	3	6	454598	454603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012667	TC	3	6	458419	458424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012667	TG	4	8	458513	458520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012667	AG	4	8	459117	459124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012667	TC	3	6	459405	459410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012667	AG	3	6	461598	461603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012667	GC	3	6	471450	471455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012667	TG	3	6	471536	471541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012667	TG	4	8	471850	471857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012667	CA	3	6	471877	471882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012667	TG	3	6	474021	474026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012667	CT	3	6	474564	474569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012667	GA	3	6	474665	474670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012667	GA	3	6	475617	475622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_012667	CT	3	6	482874	482879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012667	CT	3	6	488957	488962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012667	AT	3	6	491384	491389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012667	CT	4	8	491561	491568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012667	CT	3	6	498951	498956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_012667	AC	3	6	504938	504943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012667	TA	3	6	505028	505033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012667	AG	3	6	505314	505319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_012667	GC	3	6	507476	507481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012667	TC	3	6	507948	507953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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153	NC_012667	AC	3	6	518639	518644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012667	TG	3	6	518799	518804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.