MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 2563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	TAGCAG	2	12	564	575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	237793321
2	NC_012658	AAAAAT	2	12	1503	1514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793321
3	NC_012658	TCTATT	2	12	1724	1735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012658	GATAAT	2	12	2322	2333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793322
5	NC_012658	AAGTTA	2	12	3005	3016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793323
6	NC_012658	CAAATA	2	12	3238	3249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237793324
7	NC_012658	ATAAAG	2	12	3334	3345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793324
8	NC_012658	ATAAAA	2	12	3468	3479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793324
9	NC_012658	ATACTA	2	12	6257	6268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	237793326
10	NC_012658	GATTAG	2	12	6663	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793327
11	NC_012658	TTTAAA	2	12	7528	7539	50 %	50 %	0 %	0 %	237793327
12	NC_012658	CAAGCT	2	12	7754	7765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	237793327
13	NC_012658	GATATA	2	12	7973	7984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793327
14	NC_012658	ATAGAT	2	12	17858	17869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793331
15	NC_012658	ACAAAT	2	12	18767	18778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237793331
16	NC_012658	AATAAA	2	12	19740	19751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793332
17	NC_012658	AGATTT	2	12	24434	24445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012658	ATTTAG	2	12	25453	25464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237793336
19	NC_012658	AGCTAC	2	12	26611	26622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	237793337
20	NC_012658	ATATAG	2	12	26769	26780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793337
21	NC_012658	TAAAAG	2	12	28088	28099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012658	AGATGA	2	12	33981	33992	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	237793343
23	NC_012658	CTATAG	2	12	34162	34173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	237793344
24	NC_012658	AATATA	2	12	35176	35187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012658	AGAAAA	2	12	35985	35996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793347
26	NC_012658	CAGTTG	2	12	62143	62154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012658	AATATG	2	12	63121	63132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012658	TAAAAA	2	12	78586	78597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012658	TAACTA	2	12	78618	78629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012658	ATTTAA	2	12	79008	79019	50 %	50 %	0 %	0 %	237793364
31	NC_012658	ATTATA	2	12	82131	82142	50 %	50 %	0 %	0 %	237793367
32	NC_012658	AATATG	2	12	82151	82162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793367
33	NC_012658	TAGAGG	2	12	83449	83460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	237793369
34	NC_012658	AATTAT	2	12	84173	84184	50 %	50 %	0 %	0 %	237793370
35	NC_012658	GAAAAA	2	12	84714	84725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793371
36	NC_012658	TGTAGA	2	12	85549	85560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793372
37	NC_012658	AAAATA	2	12	87166	87177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793375
38	NC_012658	GTTTTA	2	12	87399	87410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	237793375
39	NC_012658	AGAAAA	2	12	87434	87445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793375
40	NC_012658	ATCACA	2	12	88378	88389	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	237793376
41	NC_012658	GTAAGA	2	12	88838	88849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	237793376
42	NC_012658	AAGATA	2	12	97323	97334	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793387
43	NC_012658	TAAAAA	2	12	97375	97386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793387
44	NC_012658	TAAATA	2	12	97827	97838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793387
45	NC_012658	TAAATT	2	12	102054	102065	50 %	50 %	0 %	0 %	237793392
46	NC_012658	ATAAAT	2	12	106000	106011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793394
47	NC_012658	AGTTAA	2	12	107864	107875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793396
48	NC_012658	TAAATA	2	12	109955	109966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793398
49	NC_012658	AATATA	2	12	113165	113176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793401
50	NC_012658	AGGACA	2	12	113913	113924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	237793402
51	NC_012658	GTAGAT	2	12	114181	114192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793402
52	NC_012658	TCTGGT	2	12	114560	114571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	237793403
53	NC_012658	TACTGA	2	12	116838	116849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	237793405
54	NC_012658	TTTATA	2	12	117309	117320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012658	TATTAA	2	12	117963	117974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012658	ATAGAT	2	12	119249	119260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793409
57	NC_012658	AATAAA	2	12	120024	120035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793410
58	NC_012658	TTAAAT	2	12	125131	125142	50 %	50 %	0 %	0 %	237793416
59	NC_012658	TCAAAA	2	12	127647	127658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237793417
60	NC_012658	TTTGCT	2	12	128673	128684	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	237793417
61	NC_012658	GAAAAA	2	12	130809	130820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793419
62	NC_012658	AGGAAA	2	12	131071	131082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793419
63	NC_012658	AAATGA	2	12	131612	131623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793419
64	NC_012658	AATGTA	2	12	131881	131892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793419
65	NC_012658	GATATG	2	12	132114	132125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793419
66	NC_012658	TGGATA	2	12	134932	134943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793420
67	NC_012658	CATGAA	2	12	136105	136116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	237793421
68	NC_012658	ATAAAT	2	12	136183	136194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793421
69	NC_012658	GTAAGA	2	12	137762	137773	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	237793422
70	NC_012658	ATAAGA	2	12	141781	141792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793425
71	NC_012658	CACAAC	2	12	142112	142123	50 %	0 %	0 %	50 %	237793426
72	NC_012658	ATATAA	2	12	144462	144473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793429
73	NC_012658	TATAGA	2	12	144967	144978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793429
74	NC_012658	ATTTTT	2	12	147203	147214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	237793431
75	NC_012658	GTAAGT	2	12	147437	147448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793431
76	NC_012658	TTGAAA	2	12	147635	147646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793432
77	NC_012658	AAAGAA	2	12	152048	152059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793437
78	NC_012658	AATATA	2	12	153127	153138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793438
79	NC_012658	ATTAGT	2	12	155992	156003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237793439
80	NC_012658	TTAAAG	2	12	160891	160902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793444
81	NC_012658	TACCTA	2	12	161978	161989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793445
82	NC_012658	ACATTA	2	12	162699	162710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012658	TAAAAA	2	12	162882	162893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012658	GTAGAA	2	12	164965	164976	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	237793447
85	NC_012658	AAGGAA	2	12	165457	165468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012658	AAAAGA	2	12	165524	165535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793448
87	NC_012658	ATAAAT	2	12	165765	165776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793448
88	NC_012658	ATAGAA	2	12	166184	166195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793449
89	NC_012658	AAACTT	2	12	166515	166526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012658	AGATTT	2	12	166776	166787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237793450
91	NC_012658	AAAGAA	2	12	166963	166974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793450
92	NC_012658	AGACAT	2	12	167944	167955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	237793450
93	NC_012658	ATGAAT	2	12	168532	168543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793451
94	NC_012658	TTTATT	2	12	168804	168815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012658	GTGGTA	2	12	172762	172773	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	237793456
96	NC_012658	ATATAA	2	12	173968	173979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793457
97	NC_012658	AGGTAT	2	12	177623	177634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793462
98	NC_012658	TTGAAA	2	12	178047	178058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793463
99	NC_012658	AGTTAT	2	12	180427	180438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237793466
100	NC_012658	TACAAC	2	12	181520	181531	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	237793467
101	NC_012658	ATATTT	2	12	182531	182542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012658	AAAAAT	2	12	183062	183073	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793468
103	NC_012658	ATGGTA	2	12	187070	187081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793474
104	NC_012658	AACATA	2	12	187138	187149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237793474
105	NC_012658	AATTAA	2	12	189520	189531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793476
106	NC_012658	TAATTT	2	12	190239	190250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793477
107	NC_012658	AATAAA	2	12	191217	191228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793478
108	NC_012658	ATAAAA	2	12	191290	191301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793478
109	NC_012658	TTTAAT	2	12	193167	193178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012658	TAAAGT	2	12	194043	194054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793480
111	NC_012658	AATGGT	2	12	198245	198256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793486
112	NC_012658	TTAAAA	2	12	199377	199388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012658	TTAAAA	2	12	199608	199619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793487
114	NC_012658	TAAATA	2	12	200368	200379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793487
115	NC_012658	AAAGAT	2	12	200985	200996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793487
116	NC_012658	AGAGAT	2	12	204987	204998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	237793491
117	NC_012658	TGTAAT	2	12	205745	205756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237793491
118	NC_012658	GAAATA	2	12	207860	207871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793493
119	NC_012658	AATTAA	2	12	208701	208712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793494
120	NC_012658	GAAAAA	2	12	210537	210548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	237793495
121	NC_012658	AATATT	2	12	212030	212041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012658	ATTAAT	2	12	212082	212093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012658	TAATAC	2	12	213156	213167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	237793497
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365	NC_012658	TTTATT	2	12	575939	575950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_012658	GCTTTA	2	12	763775	763786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	237793982
485	NC_012658	TATATC	2	12	764971	764982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	237793983
486	NC_012658	TTATAT	2	12	765453	765464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793983
487	NC_012658	TAAAAT	2	12	767222	767233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_012658	TTAATA	2	12	767808	767819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_012658	TGAATA	2	12	768304	768315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
490	NC_012658	GCTCAT	2	12	770208	770219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	237793986
491	NC_012658	CAGTAT	2	12	773102	773113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	237793990
492	NC_012658	TTAAAT	2	12	774517	774528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_012658	AATTTA	2	12	775779	775790	50 %	50 %	0 %	0 %	237793992
494	NC_012658	ATAACA	2	12	777123	777134	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
495	NC_012658	CAGATA	2	12	777375	777386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	237793994
496	NC_012658	AATTAA	2	12	777597	777608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793994
497	NC_012658	TTTTGA	2	12	777610	777621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	237793994
498	NC_012658	GAATTA	2	12	780472	780483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793996
499	NC_012658	AAATAT	2	12	784017	784028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237794002
500	NC_012658	CTTATG	2	12	784574	784585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	237794002

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