MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	GTTT	2	8	217	224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012657	ATTT	2	8	397	404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012657	TAAT	2	8	606	613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012657	CTAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012657	AAAT	2	8	963	970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012657	ATTT	2	8	985	992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012657	AGTA	2	8	1105	1112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012657	TCTA	2	8	1138	1145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012657	ATAA	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012657	ATTT	2	8	1557	1564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012657	TTAT	2	8	1842	1849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012657	ATTT	2	8	1911	1918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012657	GTCT	2	8	2088	2095	0 %	50 %	25 %	25 %	229599880
14	NC_012657	TAAA	2	8	2197	2204	75 %	25 %	0 %	0 %	229599877
15	NC_012657	TTTA	2	8	2264	2271	25 %	75 %	0 %	0 %	229599877
16	NC_012657	TACT	2	8	2278	2285	25 %	50 %	0 %	25 %	229599877
17	NC_012657	TAAT	2	8	2293	2300	50 %	50 %	0 %	0 %	229599877
18	NC_012657	CTCC	3	12	2533	2544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_012657	CAAC	2	8	2652	2659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012657	TACT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012657	ACCA	2	8	2814	2821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012657	TAAT	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012657	TTAA	2	8	3347	3354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012657	TAAA	2	8	3416	3423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012657	ATTT	2	8	3440	3447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012657	TTTC	2	8	3495	3502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012657	AAAT	2	8	3594	3601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012657	AACT	2	8	3610	3617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012657	AATA	2	8	3950	3957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012657	CAAA	2	8	4060	4067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012657	TTTA	2	8	4593	4600	25 %	75 %	0 %	0 %	229599878
32	NC_012657	TTTA	2	8	4855	4862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012657	TATT	2	8	5107	5114	25 %	75 %	0 %	0 %	229599882
34	NC_012657	CTTC	2	8	5358	5365	0 %	50 %	0 %	50 %	229599882
35	NC_012657	CTGA	2	8	5367	5374	25 %	25 %	25 %	25 %	229599882
36	NC_012657	ATTT	2	8	5418	5425	25 %	75 %	0 %	0 %	229599882
37	NC_012657	AAAT	2	8	5989	5996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012657	TTAT	2	8	6429	6436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012657	AATA	2	8	6654	6661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012657	TATT	2	8	6683	6690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012657	TTAT	2	8	6980	6987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012657	AATA	2	8	7003	7010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012657	ACAA	2	8	8114	8121	75 %	0 %	0 %	25 %	229599879
44	NC_012657	TTTC	2	8	8123	8130	0 %	75 %	0 %	25 %	229599879
45	NC_012657	TATC	2	8	8523	8530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012657	ATTT	2	8	8703	8710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012657	ATGA	2	8	8858	8865	50 %	25 %	25 %	0 %	229599881
48	NC_012657	ATTT	2	8	9197	9204	25 %	75 %	0 %	0 %	229599881
49	NC_012657	TAAT	2	8	9289	9296	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
50	NC_012657	AAAT	2	8	9369	9376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012657	ATTT	2	8	9617	9624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.