MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	ATG	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012657	CTT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012657	TAA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012657	ACA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012657	TTC	2	6	575	580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012657	TCC	2	6	600	605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012657	TTA	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012657	ATA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012657	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012657	TGA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012657	ATA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012657	ACA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012657	TTA	2	6	998	1003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012657	ATA	2	6	1059	1064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012657	TAC	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012657	TAT	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012657	CTT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012657	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012657	TAT	2	6	1813	1818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012657	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012657	CCT	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012657	TTC	2	6	2438	2443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012657	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012657	TAA	2	6	2558	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012657	CTA	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012657	ATT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012657	CAT	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012657	ATT	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012657	ATT	2	6	3012	3017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012657	TCA	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012657	CTT	2	6	3520	3525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012657	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012657	TCC	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012657	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012657	ATC	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012657	TAA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012657	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012657	TTA	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012657	TTA	2	6	3766	3771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012657	ATT	2	6	3832	3837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012657	TAT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012657	ATA	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012657	TTA	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012657	CTT	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012657	ATA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012657	TTA	3	9	4816	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012657	TAT	2	6	4917	4922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012657	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012657	TAA	2	6	4990	4995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012657	ATT	2	6	5003	5008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012657	CTT	2	6	5042	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012657	ATA	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012657	ATT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012657	TAA	2	6	5983	5988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012657	TAA	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012657	TTA	2	6	6041	6046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012657	TAA	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012657	TTA	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012657	TAA	2	6	6213	6218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012657	TTA	2	6	6264	6269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012657	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012657	ATT	3	9	6688	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012657	GTA	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012657	ATT	2	6	6781	6786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012657	TAT	2	6	6834	6839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012657	GGT	2	6	6897	6902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012657	GTG	2	6	6929	6934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012657	TAT	2	6	6993	6998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012657	ATT	2	6	7013	7018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012657	ACT	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012657	GAA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012657	TAA	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012657	ATT	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012657	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012657	AGG	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012657	ATT	2	6	8195	8200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012657	GTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012657	ATT	2	6	8325	8330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012657	TTA	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012657	ATT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012657	CTA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012657	CTA	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012657	TTA	3	9	8677	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012657	AAT	2	6	9470	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012657	ATT	2	6	9594	9599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012657	CCT	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012657	ATT	2	6	9655	9660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012657	TAT	2	6	9693	9698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012657	TAA	2	6	9781	9786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012657	TAA	2	6	9828	9833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012657	TAC	2	6	9834	9839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012657	ATA	2	6	9908	9913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012657	TAT	2	6	9941	9946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.