MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	ACC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229599880
2	NC_012657	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599877
3	NC_012657	CTG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229599877
4	NC_012657	TAT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599877
5	NC_012657	TAA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
6	NC_012657	ATT	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
7	NC_012657	TTA	2	6	4249	4254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
8	NC_012657	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
9	NC_012657	TTA	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
10	NC_012657	TAT	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
11	NC_012657	TAA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
12	NC_012657	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
13	NC_012657	TAT	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
14	NC_012657	TAT	3	9	4499	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
15	NC_012657	TGT	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229599878
16	NC_012657	TAA	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
17	NC_012657	CAC	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229599878
18	NC_012657	ATT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
19	NC_012657	GTA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599882
20	NC_012657	TTA	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
21	NC_012657	TAT	2	6	5230	5235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
22	NC_012657	CTT	2	6	5280	5285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599882
23	NC_012657	GTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229599882
24	NC_012657	TAA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
25	NC_012657	TAT	2	6	5469	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
26	NC_012657	TAA	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
27	NC_012657	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
28	NC_012657	AAT	2	6	5549	5554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
29	NC_012657	CTT	2	6	5574	5579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599882
30	NC_012657	TAA	2	6	5644	5649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
31	NC_012657	TAT	3	9	5701	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
32	NC_012657	ATT	2	6	7268	7273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
33	NC_012657	GGT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229599879
34	NC_012657	TAC	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
35	NC_012657	TGA	2	6	7417	7422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599879
36	NC_012657	GAT	2	6	7430	7435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599879
37	NC_012657	ATT	2	6	7500	7505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
38	NC_012657	GGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229599879
39	NC_012657	AAC	2	6	7746	7751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229599879
40	NC_012657	TAT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
41	NC_012657	AAG	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229599879
42	NC_012657	AAT	2	6	7922	7927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
43	NC_012657	ATC	2	6	7933	7938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
44	NC_012657	TAA	2	6	7941	7946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
45	NC_012657	AGG	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229599879
46	NC_012657	AAT	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
47	NC_012657	CTA	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
48	NC_012657	TAT	2	6	8939	8944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
49	NC_012657	TAT	2	6	9048	9053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
50	NC_012657	TAA	2	6	9123	9128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599881
51	NC_012657	ATT	3	9	9163	9171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
52	NC_012657	CAT	2	6	9236	9241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599881
53	NC_012657	AAT	2	6	9310	9315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.