MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	TG	3	6	243	248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012657	AT	3	6	349	354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012657	AT	3	6	469	474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012657	AT	4	8	692	699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012657	TA	3	6	723	728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012657	AT	3	6	764	769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012657	TA	4	8	897	904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012657	TA	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012657	TA	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012657	TA	3	6	2003	2008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012657	TA	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012657	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012657	TA	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012657	TA	3	6	3770	3775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012657	TA	3	6	3780	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012657	TA	3	6	3805	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012657	AT	3	6	3822	3827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012657	TA	4	8	4744	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012657	TA	4	8	4755	4762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012657	TA	3	6	4789	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012657	TA	4	8	4806	4813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012657	TA	3	6	4823	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012657	AT	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012657	TA	3	6	4883	4888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012657	TA	3	6	4977	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012657	CT	3	6	5119	5124	0 %	50 %	0 %	50 %	229599882
27	NC_012657	AT	3	6	5730	5735	50 %	50 %	0 %	0 %	229599882
28	NC_012657	AT	3	6	5865	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012657	AT	6	12	6124	6135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012657	TA	3	6	6268	6273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012657	TA	3	6	6423	6428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012657	AT	3	6	6435	6440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012657	TA	3	6	6494	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012657	AT	3	6	6525	6530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012657	AT	5	10	7174	7183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012657	AT	3	6	7187	7192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012657	TA	3	6	8337	8342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012657	AT	3	6	8493	8498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012657	AT	3	6	8642	8647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012657	TA	3	6	8714	8719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012657	TA	3	6	8768	8773	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
42	NC_012657	AT	3	6	9052	9057	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
43	NC_012657	TA	3	6	9152	9157	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
44	NC_012657	CT	3	6	9363	9368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012657	AT	3	6	9533	9538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012657	TA	3	6	9662	9667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.