MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012656	CTAATG	2	12	2147	2158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229599859
2	NC_012656	TTTCAT	2	12	4578	4589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	229599760
3	NC_012656	TCAATT	2	12	4598	4609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229599760
4	NC_012656	CTCTTT	2	12	9636	9647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599722
5	NC_012656	CGTCTG	2	12	10919	10930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229599722
6	NC_012656	ACAAAA	2	12	15303	15314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	229599776
7	NC_012656	TTTCTT	2	12	16064	16075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229599808
8	NC_012656	TTTTAA	2	12	17013	17024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599808
9	NC_012656	TTAATT	2	12	17183	17194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599808
10	NC_012656	ATGAAT	2	12	18852	18863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	229599808
11	NC_012656	ACGCCA	2	12	20061	20072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229599839
12	NC_012656	AGTGAT	2	12	25861	25872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599794
13	NC_012656	GTCTAC	2	12	32784	32795	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229599723
14	NC_012656	CTATTT	2	12	35422	35433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012656	TTTTGA	2	12	36525	36536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	229599751
16	NC_012656	ATGTAA	2	12	41312	41323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	229599717
17	NC_012656	TTTTTC	2	12	50618	50629	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229599766
18	NC_012656	ATTCTA	2	12	50854	50865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229599840
19	NC_012656	TTATTT	2	12	52418	52429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229599767
20	NC_012656	CCGAAT	2	12	55577	55588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229599767
21	NC_012656	GTTCCT	2	12	58902	58913	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	229599836
22	NC_012656	ATAAAA	2	12	62174	62185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012656	TGAATT	2	12	64704	64715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229599735
24	NC_012656	ATTGAT	2	12	65678	65689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229599828
25	NC_012656	ACAGCA	2	12	67970	67981	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229599770
26	NC_012656	TTTGGT	2	12	68147	68158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229599770
27	NC_012656	TTTTGA	2	12	69524	69535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	229599754
28	NC_012656	ATCCAG	2	12	70306	70317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229599754
29	NC_012656	TATAAA	2	12	70332	70343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599754
30	NC_012656	TAAAGG	2	12	70838	70849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229599754
31	NC_012656	AAAAAG	2	12	71774	71785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229599825
32	NC_012656	ACGTGT	2	12	73172	73183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012656	CAGTTG	2	12	73356	73367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012656	GTTATT	2	12	77566	77577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012656	ACAGAT	2	12	79222	79233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	229599736
36	NC_012656	ATTTGT	2	12	79905	79916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	229599736
37	NC_012656	AGAAAT	2	12	80565	80576	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012656	CAGAAG	2	12	81002	81013	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012656	GATTGT	2	12	82122	82133	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229599737
40	NC_012656	ATTTAG	2	12	83786	83797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012656	AATGAA	2	12	83869	83880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012656	AATAAA	2	12	87638	87649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	229599746
43	NC_012656	TCAAAT	2	12	87710	87721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229599746
44	NC_012656	CAAAAG	2	12	89960	89971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012656	AGCCAG	2	12	91001	91012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012656	AAGAGA	2	12	93437	93448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012656	AAGAGG	2	12	98123	98134	50 %	0 %	50 %	0 %	229599718
48	NC_012656	TAGAAA	2	12	103074	103085	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229599762
49	NC_012656	TCATTA	2	12	103896	103907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012656	TATCAA	2	12	105166	105177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012656	ATTATA	2	12	110343	110354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012656	ATTTTT	2	12	110593	110604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229599821
53	NC_012656	ATCATT	2	12	111641	111652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012656	AAGTGC	2	12	111724	111735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012656	ATGAAA	2	12	117562	117573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012656	ATAAAT	2	12	118852	118863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012656	ATTTTT	2	12	119301	119312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229599764
58	NC_012656	ATTTTT	2	12	119848	119859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012656	GAAAAA	2	12	119866	119877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012656	TGATAT	2	12	120063	120074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012656	TTATTT	2	12	120413	120424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012656	TAACTT	2	12	120973	120984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229599768
63	NC_012656	GAAAAA	2	12	123034	123045	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229599815
64	NC_012656	TTTTTG	2	12	126330	126341	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012656	TTCCTT	2	12	129252	129263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599851
66	NC_012656	AAATTA	2	12	130786	130797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599759
67	NC_012656	GTATGG	2	12	131994	132005	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229599797
68	NC_012656	TCTACT	2	12	134601	134612	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229599870
69	NC_012656	TACAAC	2	12	138635	138646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229599865
70	NC_012656	GTTAGA	2	12	138794	138805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599865
71	NC_012656	AACAAA	2	12	143351	143362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012656	GAATCA	2	12	144160	144171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	229599856
73	NC_012656	TTCTAA	2	12	144429	144440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229599856
74	NC_012656	ATATTA	2	12	147133	147144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012656	TAGATA	2	12	147747	147758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012656	CTTTTT	2	12	150832	150843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229599780
77	NC_012656	TCTCTT	2	12	151906	151917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599780
78	NC_012656	ACTATA	2	12	153443	153454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012656	ATGCCC	2	12	156467	156478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229599814
80	NC_012656	TAAGGG	2	12	158267	158278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012656	AAAAGA	2	12	158610	158621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012656	ATTTTT	2	12	158777	158788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012656	TGTTAG	2	12	165673	165684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229599810
84	NC_012656	AAGAAA	2	12	168265	168276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229599771
85	NC_012656	TTCCGG	2	12	170384	170395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229599854
86	NC_012656	TAATTT	2	12	170676	170687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599854
87	NC_012656	CACCTA	2	12	171027	171038	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012656	TTTATG	2	12	180993	181004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	229599853

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.