MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012656	AAAGA	2	10	88	97	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012656	ATTAT	2	10	824	833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012656	TTTCC	2	10	1938	1947	0 %	60 %	0 %	40 %	229599790
4	NC_012656	TAAAA	2	10	2097	2106	80 %	20 %	0 %	0 %	229599859
5	NC_012656	ATGAT	2	10	2498	2507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012656	CGGAA	2	10	2746	2755	40 %	0 %	40 %	20 %	229599785
7	NC_012656	AAGAA	2	10	3150	3159	80 %	0 %	20 %	0 %	229599792
8	NC_012656	CATAC	2	10	3168	3177	40 %	20 %	0 %	40 %	229599792
9	NC_012656	TTTAA	2	10	4457	4466	40 %	60 %	0 %	0 %	229599760
10	NC_012656	GCATT	2	10	6615	6624	20 %	40 %	20 %	20 %	229599739
11	NC_012656	TCTTT	2	10	7664	7673	0 %	80 %	0 %	20 %	229599817
12	NC_012656	TCCAT	2	10	7984	7993	20 %	40 %	0 %	40 %	229599817
13	NC_012656	TCTTT	2	10	8376	8385	0 %	80 %	0 %	20 %	229599817
14	NC_012656	CATTC	2	10	10106	10115	20 %	40 %	0 %	40 %	229599722
15	NC_012656	CTTTT	2	10	11373	11382	0 %	80 %	0 %	20 %	229599722
16	NC_012656	AGCAA	2	10	11835	11844	60 %	0 %	20 %	20 %	229599722
17	NC_012656	TAAAA	2	10	11952	11961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012656	ATTTA	2	10	11997	12006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012656	TTCGG	2	10	13683	13692	0 %	40 %	40 %	20 %	229599834
20	NC_012656	TGTTA	2	10	14047	14056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012656	CACAA	2	10	14220	14229	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012656	TTTAA	2	10	16189	16198	40 %	60 %	0 %	0 %	229599808
23	NC_012656	TTCTG	2	10	16638	16647	0 %	60 %	20 %	20 %	229599808
24	NC_012656	AATTA	2	10	18504	18513	60 %	40 %	0 %	0 %	229599808
25	NC_012656	CTCTG	2	10	18931	18940	0 %	40 %	20 %	40 %	229599808
26	NC_012656	CTCTT	2	10	20625	20634	0 %	60 %	0 %	40 %	229599839
27	NC_012656	AAATA	2	10	24285	24294	80 %	20 %	0 %	0 %	229599758
28	NC_012656	CTACT	2	10	24374	24383	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012656	TATAA	2	10	27026	27035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012656	ACACT	2	10	27173	27182	40 %	20 %	0 %	40 %	229599813
31	NC_012656	ATTGC	2	10	27240	27249	20 %	40 %	20 %	20 %	229599813
32	NC_012656	TCCAA	2	10	28175	28184	40 %	20 %	0 %	40 %	229599813
33	NC_012656	GAAAA	2	10	28336	28345	80 %	0 %	20 %	0 %	229599813
34	NC_012656	TTTTC	2	10	31309	31318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012656	TTGTT	2	10	32169	32178	0 %	80 %	20 %	0 %	229599723
36	NC_012656	TATCC	2	10	32943	32952	20 %	40 %	0 %	40 %	229599723
37	NC_012656	CCTTC	2	10	34111	34120	0 %	40 %	0 %	60 %	229599816
38	NC_012656	ATTTA	2	10	34719	34728	40 %	60 %	0 %	0 %	229599761
39	NC_012656	TTTCC	2	10	36565	36574	0 %	60 %	0 %	40 %	229599751
40	NC_012656	AATTA	2	10	37330	37339	60 %	40 %	0 %	0 %	229599799
41	NC_012656	AAATT	2	10	38870	38879	60 %	40 %	0 %	0 %	229599749
42	NC_012656	AGTAA	2	10	39183	39192	60 %	20 %	20 %	0 %	229599749
43	NC_012656	CTTGG	2	10	40919	40928	0 %	40 %	40 %	20 %	229599717
44	NC_012656	ATTTC	2	10	44827	44836	20 %	60 %	0 %	20 %	229599775
45	NC_012656	CATCA	2	10	45097	45106	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012656	TCTTT	2	10	45666	45675	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012656	GAAAT	2	10	46963	46972	60 %	20 %	20 %	0 %	229599795
48	NC_012656	AAAAC	2	10	48008	48017	80 %	0 %	0 %	20 %	229599726
49	NC_012656	GAAAA	2	10	48206	48215	80 %	0 %	20 %	0 %	229599726
50	NC_012656	ATTTT	2	10	50116	50125	20 %	80 %	0 %	0 %	229599822
51	NC_012656	CTAAG	2	10	50960	50969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012656	TTAAC	2	10	51146	51155	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012656	TCATC	2	10	53418	53427	20 %	40 %	0 %	40 %	229599767
54	NC_012656	TACGA	2	10	53647	53656	40 %	20 %	20 %	20 %	229599767
55	NC_012656	AGTAA	2	10	53888	53897	60 %	20 %	20 %	0 %	229599767
56	NC_012656	TGATT	2	10	56151	56160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012656	CTTCT	2	10	56451	56460	0 %	60 %	0 %	40 %	229599741
58	NC_012656	CTCTT	2	10	58415	58424	0 %	60 %	0 %	40 %	229599836
59	NC_012656	TTGAT	2	10	58502	58511	20 %	60 %	20 %	0 %	229599836
60	NC_012656	AAAAT	2	10	59683	59692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012656	AACAA	2	10	60643	60652	80 %	0 %	0 %	20 %	229599802
62	NC_012656	GTATA	2	10	60980	60989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012656	TGAAT	2	10	61456	61465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012656	CTATG	2	10	63788	63797	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012656	AGTAA	2	10	65005	65014	60 %	20 %	20 %	0 %	229599735
66	NC_012656	GTGAT	2	10	65421	65430	20 %	40 %	40 %	0 %	229599828
67	NC_012656	AAAAG	2	10	66753	66762	80 %	0 %	20 %	0 %	229599828
68	NC_012656	TAAAT	2	10	69037	69046	60 %	40 %	0 %	0 %	229599770
69	NC_012656	ATATA	2	10	69175	69184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012656	TAGAT	2	10	70628	70637	40 %	40 %	20 %	0 %	229599754
71	NC_012656	GAAAA	2	10	70806	70815	80 %	0 %	20 %	0 %	229599754
72	NC_012656	AAAAG	2	10	70949	70958	80 %	0 %	20 %	0 %	229599754
73	NC_012656	TTTCA	2	10	71940	71949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012656	ACATG	2	10	71971	71980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_012656	AAATC	2	10	72550	72559	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012656	AAGAA	2	10	73745	73754	80 %	0 %	20 %	0 %	229599811
77	NC_012656	AAAGA	2	10	74584	74593	80 %	0 %	20 %	0 %	229599777
78	NC_012656	GAAAG	2	10	75162	75171	60 %	0 %	40 %	0 %	229599777
79	NC_012656	TAGTA	2	10	75853	75862	40 %	40 %	20 %	0 %	229599847
80	NC_012656	AAAGA	2	10	77135	77144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012656	ATTGC	2	10	77385	77394	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012656	AAATG	2	10	77922	77931	60 %	20 %	20 %	0 %	229599732
83	NC_012656	TCAAA	2	10	79852	79861	60 %	20 %	0 %	20 %	229599736
84	NC_012656	TAACA	2	10	83528	83537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012656	TTGTG	2	10	83617	83626	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012656	TAATT	2	10	86864	86873	40 %	60 %	0 %	0 %	229599733
87	NC_012656	AATGG	2	10	87154	87163	40 %	20 %	40 %	0 %	229599807
88	NC_012656	GATTT	2	10	87558	87567	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012656	TATAA	2	10	87801	87810	60 %	40 %	0 %	0 %	229599745
90	NC_012656	ATTTA	2	10	89268	89277	40 %	60 %	0 %	0 %	229599806
91	NC_012656	GAAAA	2	10	89656	89665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012656	TTTAA	2	10	91531	91540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012656	AAAGA	2	10	92740	92749	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012656	GTTTT	2	10	98936	98945	0 %	80 %	20 %	0 %	229599755
95	NC_012656	TAAAG	2	10	102688	102697	60 %	20 %	20 %	0 %	229599725
96	NC_012656	AGTAA	2	10	103221	103230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012656	TTTAA	2	10	104486	104495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012656	ATTTT	2	10	104536	104545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012656	ACAGT	2	10	105072	105081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012656	GTACT	2	10	105089	105098	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012656	GAATA	2	10	106145	106154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012656	TATTT	2	10	107137	107146	20 %	80 %	0 %	0 %	229599831
103	NC_012656	TGAAT	2	10	107776	107785	40 %	40 %	20 %	0 %	229599831
104	NC_012656	AAAAG	2	10	109459	109468	80 %	0 %	20 %	0 %	229599753
105	NC_012656	GTGAT	2	10	109748	109757	20 %	40 %	40 %	0 %	229599753
106	NC_012656	TTGGT	2	10	110888	110897	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012656	AATAA	2	10	111035	111044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012656	ATTCA	2	10	111072	111081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012656	ATTAT	2	10	111270	111279	40 %	60 %	0 %	0 %	229599848
110	NC_012656	AAAAT	3	15	111481	111495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012656	TATAA	2	10	115412	115421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012656	TCATT	2	10	115426	115435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012656	TAATA	2	10	115829	115838	60 %	40 %	0 %	0 %	229599769
114	NC_012656	ATTTA	2	10	116311	116320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012656	CCTTG	2	10	119030	119039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012656	ATGAA	2	10	120440	120449	60 %	20 %	20 %	0 %	229599835
117	NC_012656	ATTGG	2	10	121934	121943	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012656	TAAAA	2	10	122799	122808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012656	GAAAA	2	10	123301	123310	80 %	0 %	20 %	0 %	229599815
120	NC_012656	TACAA	2	10	124229	124238	60 %	20 %	0 %	20 %	229599815
121	NC_012656	AAAGG	2	10	125127	125136	60 %	0 %	40 %	0 %	229599815
122	NC_012656	TAAAA	2	10	125939	125948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012656	CTTTC	2	10	126846	126855	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012656	CTTTT	2	10	126934	126943	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012656	ATGTA	2	10	128698	128707	40 %	40 %	20 %	0 %	229599851
126	NC_012656	ATTTA	2	10	130178	130187	40 %	60 %	0 %	0 %	229599791
127	NC_012656	AATTC	2	10	130397	130406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012656	TATTT	2	10	130407	130416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012656	TTAAA	2	10	131164	131173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012656	ATTAA	2	10	131691	131700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012656	AATTC	2	10	133435	133444	40 %	40 %	0 %	20 %	229599870
132	NC_012656	TTAAT	2	10	134623	134632	40 %	60 %	0 %	0 %	229599870
133	NC_012656	TATTT	2	10	136037	136046	20 %	80 %	0 %	0 %	229599870
134	NC_012656	CAATT	2	10	136715	136724	40 %	40 %	0 %	20 %	229599803
135	NC_012656	CAAAA	2	10	136895	136904	80 %	0 %	0 %	20 %	229599803
136	NC_012656	AAATT	2	10	138039	138048	60 %	40 %	0 %	0 %	229599786
137	NC_012656	ATTAT	2	10	140135	140144	40 %	60 %	0 %	0 %	229599800
138	NC_012656	ATCTT	2	10	142307	142316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012656	TAAAA	2	10	143098	143107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012656	AAATT	2	10	143514	143523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012656	ACAAA	2	10	143634	143643	80 %	0 %	0 %	20 %	229599861
142	NC_012656	TATAT	2	10	143968	143977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_012656	TTCAA	2	10	148908	148917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_012656	ATTCT	2	10	159324	159333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_012656	GTTTA	2	10	168184	168193	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_012656	AAACA	2	10	174316	174325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_012656	AAATA	2	10	174409	174418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012656	TCATT	2	10	177952	177961	20 %	60 %	0 %	20 %	229599863
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184	NC_012656	CCTAT	2	10	180755	180764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_012656	TCTTT	2	10	181175	181184	0 %	80 %	0 %	20 %	229599853
186	NC_012656	TCACC	2	10	181611	181620	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.