MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012656	TTTCC	2	10	1938	1947	0 %	60 %	0 %	40 %	229599790
2	NC_012656	TAAAA	2	10	2097	2106	80 %	20 %	0 %	0 %	229599859
3	NC_012656	CGGAA	2	10	2746	2755	40 %	0 %	40 %	20 %	229599785
4	NC_012656	AAGAA	2	10	3150	3159	80 %	0 %	20 %	0 %	229599792
5	NC_012656	CATAC	2	10	3168	3177	40 %	20 %	0 %	40 %	229599792
6	NC_012656	TTTAA	2	10	4457	4466	40 %	60 %	0 %	0 %	229599760
7	NC_012656	GCATT	2	10	6615	6624	20 %	40 %	20 %	20 %	229599739
8	NC_012656	TCTTT	2	10	7664	7673	0 %	80 %	0 %	20 %	229599817
9	NC_012656	TCCAT	2	10	7984	7993	20 %	40 %	0 %	40 %	229599817
10	NC_012656	TCTTT	2	10	8376	8385	0 %	80 %	0 %	20 %	229599817
11	NC_012656	CATTC	2	10	10106	10115	20 %	40 %	0 %	40 %	229599722
12	NC_012656	CTTTT	2	10	11373	11382	0 %	80 %	0 %	20 %	229599722
13	NC_012656	AGCAA	2	10	11835	11844	60 %	0 %	20 %	20 %	229599722
14	NC_012656	TTCGG	2	10	13683	13692	0 %	40 %	40 %	20 %	229599834
15	NC_012656	TTTAA	2	10	16189	16198	40 %	60 %	0 %	0 %	229599808
16	NC_012656	TTCTG	2	10	16638	16647	0 %	60 %	20 %	20 %	229599808
17	NC_012656	AATTA	2	10	18504	18513	60 %	40 %	0 %	0 %	229599808
18	NC_012656	CTCTG	2	10	18931	18940	0 %	40 %	20 %	40 %	229599808
19	NC_012656	CTCTT	2	10	20625	20634	0 %	60 %	0 %	40 %	229599839
20	NC_012656	AAATA	2	10	24285	24294	80 %	20 %	0 %	0 %	229599758
21	NC_012656	ACACT	2	10	27173	27182	40 %	20 %	0 %	40 %	229599813
22	NC_012656	ATTGC	2	10	27240	27249	20 %	40 %	20 %	20 %	229599813
23	NC_012656	TCCAA	2	10	28175	28184	40 %	20 %	0 %	40 %	229599813
24	NC_012656	GAAAA	2	10	28336	28345	80 %	0 %	20 %	0 %	229599813
25	NC_012656	TTGTT	2	10	32169	32178	0 %	80 %	20 %	0 %	229599723
26	NC_012656	TATCC	2	10	32943	32952	20 %	40 %	0 %	40 %	229599723
27	NC_012656	CCTTC	2	10	34111	34120	0 %	40 %	0 %	60 %	229599816
28	NC_012656	ATTTA	2	10	34719	34728	40 %	60 %	0 %	0 %	229599761
29	NC_012656	TTTCC	2	10	36565	36574	0 %	60 %	0 %	40 %	229599751
30	NC_012656	AATTA	2	10	37330	37339	60 %	40 %	0 %	0 %	229599799
31	NC_012656	AAATT	2	10	38870	38879	60 %	40 %	0 %	0 %	229599749
32	NC_012656	AGTAA	2	10	39183	39192	60 %	20 %	20 %	0 %	229599749
33	NC_012656	CTTGG	2	10	40919	40928	0 %	40 %	40 %	20 %	229599717
34	NC_012656	ATTTC	2	10	44827	44836	20 %	60 %	0 %	20 %	229599775
35	NC_012656	GAAAT	2	10	46963	46972	60 %	20 %	20 %	0 %	229599795
36	NC_012656	AAAAC	2	10	48008	48017	80 %	0 %	0 %	20 %	229599726
37	NC_012656	GAAAA	2	10	48206	48215	80 %	0 %	20 %	0 %	229599726
38	NC_012656	ATTTT	2	10	50116	50125	20 %	80 %	0 %	0 %	229599822
39	NC_012656	TCATC	2	10	53418	53427	20 %	40 %	0 %	40 %	229599767
40	NC_012656	TACGA	2	10	53647	53656	40 %	20 %	20 %	20 %	229599767
41	NC_012656	AGTAA	2	10	53888	53897	60 %	20 %	20 %	0 %	229599767
42	NC_012656	CTTCT	2	10	56451	56460	0 %	60 %	0 %	40 %	229599741
43	NC_012656	CTCTT	2	10	58415	58424	0 %	60 %	0 %	40 %	229599836
44	NC_012656	TTGAT	2	10	58502	58511	20 %	60 %	20 %	0 %	229599836
45	NC_012656	AACAA	2	10	60643	60652	80 %	0 %	0 %	20 %	229599802
46	NC_012656	AGTAA	2	10	65005	65014	60 %	20 %	20 %	0 %	229599735
47	NC_012656	GTGAT	2	10	65421	65430	20 %	40 %	40 %	0 %	229599828
48	NC_012656	AAAAG	2	10	66753	66762	80 %	0 %	20 %	0 %	229599828
49	NC_012656	TAAAT	2	10	69037	69046	60 %	40 %	0 %	0 %	229599770
50	NC_012656	TAGAT	2	10	70628	70637	40 %	40 %	20 %	0 %	229599754
51	NC_012656	GAAAA	2	10	70806	70815	80 %	0 %	20 %	0 %	229599754
52	NC_012656	AAAAG	2	10	70949	70958	80 %	0 %	20 %	0 %	229599754
53	NC_012656	AAGAA	2	10	73745	73754	80 %	0 %	20 %	0 %	229599811
54	NC_012656	AAAGA	2	10	74584	74593	80 %	0 %	20 %	0 %	229599777
55	NC_012656	GAAAG	2	10	75162	75171	60 %	0 %	40 %	0 %	229599777
56	NC_012656	TAGTA	2	10	75853	75862	40 %	40 %	20 %	0 %	229599847
57	NC_012656	AAATG	2	10	77922	77931	60 %	20 %	20 %	0 %	229599732
58	NC_012656	TCAAA	2	10	79852	79861	60 %	20 %	0 %	20 %	229599736
59	NC_012656	TAATT	2	10	86864	86873	40 %	60 %	0 %	0 %	229599733
60	NC_012656	AATGG	2	10	87154	87163	40 %	20 %	40 %	0 %	229599807
61	NC_012656	TATAA	2	10	87801	87810	60 %	40 %	0 %	0 %	229599745
62	NC_012656	ATTTA	2	10	89268	89277	40 %	60 %	0 %	0 %	229599806
63	NC_012656	GTTTT	2	10	98936	98945	0 %	80 %	20 %	0 %	229599755
64	NC_012656	TAAAG	2	10	102688	102697	60 %	20 %	20 %	0 %	229599725
65	NC_012656	TATTT	2	10	107137	107146	20 %	80 %	0 %	0 %	229599831
66	NC_012656	TGAAT	2	10	107776	107785	40 %	40 %	20 %	0 %	229599831
67	NC_012656	AAAAG	2	10	109459	109468	80 %	0 %	20 %	0 %	229599753
68	NC_012656	GTGAT	2	10	109748	109757	20 %	40 %	40 %	0 %	229599753
69	NC_012656	ATTAT	2	10	111270	111279	40 %	60 %	0 %	0 %	229599848
70	NC_012656	TAATA	2	10	115829	115838	60 %	40 %	0 %	0 %	229599769
71	NC_012656	ATGAA	2	10	120440	120449	60 %	20 %	20 %	0 %	229599835
72	NC_012656	GAAAA	2	10	123301	123310	80 %	0 %	20 %	0 %	229599815
73	NC_012656	TACAA	2	10	124229	124238	60 %	20 %	0 %	20 %	229599815
74	NC_012656	AAAGG	2	10	125127	125136	60 %	0 %	40 %	0 %	229599815
75	NC_012656	ATGTA	2	10	128698	128707	40 %	40 %	20 %	0 %	229599851
76	NC_012656	ATTTA	2	10	130178	130187	40 %	60 %	0 %	0 %	229599791
77	NC_012656	AATTC	2	10	133435	133444	40 %	40 %	0 %	20 %	229599870
78	NC_012656	TTAAT	2	10	134623	134632	40 %	60 %	0 %	0 %	229599870
79	NC_012656	TATTT	2	10	136037	136046	20 %	80 %	0 %	0 %	229599870
80	NC_012656	CAATT	2	10	136715	136724	40 %	40 %	0 %	20 %	229599803
81	NC_012656	CAAAA	2	10	136895	136904	80 %	0 %	0 %	20 %	229599803
82	NC_012656	AAATT	2	10	138039	138048	60 %	40 %	0 %	0 %	229599786
83	NC_012656	ATTAT	2	10	140135	140144	40 %	60 %	0 %	0 %	229599800
84	NC_012656	ACAAA	2	10	143634	143643	80 %	0 %	0 %	20 %	229599861
85	NC_012656	GGATT	2	10	144514	144523	20 %	40 %	40 %	0 %	229599856
86	NC_012656	GATAT	2	10	146105	146114	40 %	40 %	20 %	0 %	229599856
87	NC_012656	ATAAA	2	10	148065	148074	80 %	20 %	0 %	0 %	229599841
88	NC_012656	ATTCC	2	10	150239	150248	20 %	40 %	0 %	40 %	229599780
89	NC_012656	GAAGC	2	10	160713	160722	40 %	0 %	40 %	20 %	229599743
90	NC_012656	AGGGA	2	10	161195	161204	40 %	0 %	60 %	0 %	229599743
91	NC_012656	TTAAA	2	10	161500	161509	60 %	40 %	0 %	0 %	229599743
92	NC_012656	TTGGA	2	10	161801	161810	20 %	40 %	40 %	0 %	229599843
93	NC_012656	GTAAT	2	10	168646	168655	40 %	40 %	20 %	0 %	229599771
94	NC_012656	ATTAT	2	10	170134	170143	40 %	60 %	0 %	0 %	229599854
95	NC_012656	AATTA	2	10	170874	170883	60 %	40 %	0 %	0 %	229599854
96	NC_012656	TAATA	2	10	171163	171172	60 %	40 %	0 %	0 %	229599787
97	NC_012656	AAATT	2	10	171439	171448	60 %	40 %	0 %	0 %	229599787
98	NC_012656	CAAAG	2	10	173036	173045	60 %	0 %	20 %	20 %	229599728
99	NC_012656	TAATT	2	10	173096	173105	40 %	60 %	0 %	0 %	229599728
100	NC_012656	AAAGA	2	10	173190	173199	80 %	0 %	20 %	0 %	229599728
101	NC_012656	TTACA	2	10	174648	174657	40 %	40 %	0 %	20 %	229599849
102	NC_012656	TTTTC	2	10	175540	175549	0 %	80 %	0 %	20 %	229599774
103	NC_012656	TTACT	2	10	175690	175699	20 %	60 %	0 %	20 %	229599866
104	NC_012656	ACTCT	2	10	177264	177273	20 %	40 %	0 %	40 %	229599863
105	NC_012656	AATCG	2	10	177348	177357	40 %	20 %	20 %	20 %	229599863
106	NC_012656	TCATT	2	10	177952	177961	20 %	60 %	0 %	20 %	229599863
107	NC_012656	AATTT	2	10	180303	180312	40 %	60 %	0 %	0 %	229599784
108	NC_012656	TCTTT	2	10	181175	181184	0 %	80 %	0 %	20 %	229599853

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.