MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012656	ACAA	2	8	502	509	75 %	0 %	0 %	25 %	229599798
2	NC_012656	AATG	2	8	605	612	50 %	25 %	25 %	0 %	229599798
3	NC_012656	TAAG	2	8	668	675	50 %	25 %	25 %	0 %	229599798
4	NC_012656	TTTC	2	8	1712	1719	0 %	75 %	0 %	25 %	229599790
5	NC_012656	AATT	2	8	2003	2010	50 %	50 %	0 %	0 %	229599790
6	NC_012656	TTTG	2	8	3493	3500	0 %	75 %	25 %	0 %	229599792
7	NC_012656	GAAA	2	8	3711	3718	75 %	0 %	25 %	0 %	229599792
8	NC_012656	TAAT	2	8	4114	4121	50 %	50 %	0 %	0 %	229599855
9	NC_012656	TGAT	2	8	4219	4226	25 %	50 %	25 %	0 %	229599855
10	NC_012656	TTCG	2	8	4257	4264	0 %	50 %	25 %	25 %	229599855
11	NC_012656	TTAC	2	8	4958	4965	25 %	50 %	0 %	25 %	229599760
12	NC_012656	AAAT	2	8	6124	6131	75 %	25 %	0 %	0 %	229599739
13	NC_012656	CTTT	2	8	6174	6181	0 %	75 %	0 %	25 %	229599739
14	NC_012656	AATT	2	8	6682	6689	50 %	50 %	0 %	0 %	229599739
15	NC_012656	TGGA	2	8	7443	7450	25 %	25 %	50 %	0 %	229599817
16	NC_012656	TTAT	2	8	7459	7466	25 %	75 %	0 %	0 %	229599817
17	NC_012656	TTGG	2	8	7689	7696	0 %	50 %	50 %	0 %	229599817
18	NC_012656	CATA	2	8	7847	7854	50 %	25 %	0 %	25 %	229599817
19	NC_012656	TTGA	2	8	8529	8536	25 %	50 %	25 %	0 %	229599817
20	NC_012656	TTCC	2	8	8679	8686	0 %	50 %	0 %	50 %	229599817
21	NC_012656	TATT	2	8	9348	9355	25 %	75 %	0 %	0 %	229599722
22	NC_012656	GCTT	2	8	9859	9866	0 %	50 %	25 %	25 %	229599722
23	NC_012656	TTGC	2	8	10463	10470	0 %	50 %	25 %	25 %	229599722
24	NC_012656	ATTT	2	8	10475	10482	25 %	75 %	0 %	0 %	229599722
25	NC_012656	CTTC	2	8	10736	10743	0 %	50 %	0 %	50 %	229599722
26	NC_012656	GGTT	2	8	10833	10840	0 %	50 %	50 %	0 %	229599722
27	NC_012656	TGTA	2	8	11165	11172	25 %	50 %	25 %	0 %	229599722
28	NC_012656	ATAG	2	8	11398	11405	50 %	25 %	25 %	0 %	229599722
29	NC_012656	ATTC	2	8	11414	11421	25 %	50 %	0 %	25 %	229599722
30	NC_012656	CTTT	2	8	11615	11622	0 %	75 %	0 %	25 %	229599722
31	NC_012656	CAAT	2	8	12202	12209	50 %	25 %	0 %	25 %	229599721
32	NC_012656	AAGT	2	8	12512	12519	50 %	25 %	25 %	0 %	229599827
33	NC_012656	GTTT	2	8	12622	12629	0 %	75 %	25 %	0 %	229599827
34	NC_012656	TAAA	2	8	12947	12954	75 %	25 %	0 %	0 %	229599827
35	NC_012656	AGCA	2	8	13237	13244	50 %	0 %	25 %	25 %	229599827
36	NC_012656	GCTC	2	8	13248	13255	0 %	25 %	25 %	50 %	229599827
37	NC_012656	GTTT	2	8	13529	13536	0 %	75 %	25 %	0 %	229599740
38	NC_012656	CTTA	2	8	15057	15064	25 %	50 %	0 %	25 %	229599776
39	NC_012656	AAAT	2	8	15456	15463	75 %	25 %	0 %	0 %	229599808
40	NC_012656	TCAC	2	8	15607	15614	25 %	25 %	0 %	50 %	229599808
41	NC_012656	TTAA	2	8	15736	15743	50 %	50 %	0 %	0 %	229599808
42	NC_012656	TATT	2	8	15850	15857	25 %	75 %	0 %	0 %	229599808
43	NC_012656	TTCC	2	8	15864	15871	0 %	50 %	0 %	50 %	229599808
44	NC_012656	ATTT	2	8	16334	16341	25 %	75 %	0 %	0 %	229599808
45	NC_012656	TTTA	2	8	16356	16363	25 %	75 %	0 %	0 %	229599808
46	NC_012656	CGAA	2	8	16948	16955	50 %	0 %	25 %	25 %	229599808
47	NC_012656	ATTA	2	8	17340	17347	50 %	50 %	0 %	0 %	229599808
48	NC_012656	TAAA	3	12	17393	17404	75 %	25 %	0 %	0 %	229599808
49	NC_012656	AGAA	2	8	18116	18123	75 %	0 %	25 %	0 %	229599808
50	NC_012656	CACT	2	8	18461	18468	25 %	25 %	0 %	50 %	229599808
51	NC_012656	ATAA	2	8	18709	18716	75 %	25 %	0 %	0 %	229599808
52	NC_012656	TAAC	2	8	18818	18825	50 %	25 %	0 %	25 %	229599808
53	NC_012656	ATTT	2	8	18944	18951	25 %	75 %	0 %	0 %	229599808
54	NC_012656	CATT	2	8	19052	19059	25 %	50 %	0 %	25 %	229599808
55	NC_012656	TTTC	2	8	19586	19593	0 %	75 %	0 %	25 %	229599839
56	NC_012656	ATGA	2	8	20027	20034	50 %	25 %	25 %	0 %	229599839
57	NC_012656	ATAA	2	8	20364	20371	75 %	25 %	0 %	0 %	229599839
58	NC_012656	ATTT	2	8	21065	21072	25 %	75 %	0 %	0 %	229599839
59	NC_012656	TAGC	2	8	21787	21794	25 %	25 %	25 %	25 %	229599868
60	NC_012656	ATAC	2	8	22716	22723	50 %	25 %	0 %	25 %	229599758
61	NC_012656	ACTC	2	8	23092	23099	25 %	25 %	0 %	50 %	229599758
62	NC_012656	CTTT	2	8	23169	23176	0 %	75 %	0 %	25 %	229599758
63	NC_012656	TTCA	2	8	23612	23619	25 %	50 %	0 %	25 %	229599758
64	NC_012656	TGCA	2	8	23913	23920	25 %	25 %	25 %	25 %	229599758
65	NC_012656	TGAA	2	8	25574	25581	50 %	25 %	25 %	0 %	229599794
66	NC_012656	GAAT	2	8	25683	25690	50 %	25 %	25 %	0 %	229599794
67	NC_012656	ATCA	2	8	25850	25857	50 %	25 %	0 %	25 %	229599794
68	NC_012656	TCTA	2	8	25914	25921	25 %	50 %	0 %	25 %	229599794
69	NC_012656	TAAT	2	8	25985	25992	50 %	50 %	0 %	0 %	229599794
70	NC_012656	AAAT	2	8	26088	26095	75 %	25 %	0 %	0 %	229599794
71	NC_012656	ATCT	2	8	26567	26574	25 %	50 %	0 %	25 %	229599852
72	NC_012656	CTGA	2	8	26594	26601	25 %	25 %	25 %	25 %	229599852
73	NC_012656	CAAT	2	8	26861	26868	50 %	25 %	0 %	25 %	229599714
74	NC_012656	AAAG	2	8	27075	27082	75 %	0 %	25 %	0 %	229599813
75	NC_012656	AATT	2	8	27104	27111	50 %	50 %	0 %	0 %	229599813
76	NC_012656	GAAA	2	8	27288	27295	75 %	0 %	25 %	0 %	229599813
77	NC_012656	ATAG	2	8	27394	27401	50 %	25 %	25 %	0 %	229599813
78	NC_012656	ATTT	2	8	27599	27606	25 %	75 %	0 %	0 %	229599813
79	NC_012656	TGGG	2	8	27701	27708	0 %	25 %	75 %	0 %	229599813
80	NC_012656	ATCA	2	8	28240	28247	50 %	25 %	0 %	25 %	229599813
81	NC_012656	AAAC	2	8	28438	28445	75 %	0 %	0 %	25 %	229599813
82	NC_012656	ATAA	2	8	28557	28564	75 %	25 %	0 %	0 %	229599813
83	NC_012656	GCAC	2	8	30955	30962	25 %	0 %	25 %	50 %	229599864
84	NC_012656	AATG	2	8	31595	31602	50 %	25 %	25 %	0 %	229599723
85	NC_012656	GCTT	2	8	31804	31811	0 %	50 %	25 %	25 %	229599723
86	NC_012656	CTTT	2	8	32246	32253	0 %	75 %	0 %	25 %	229599723
87	NC_012656	TTTA	2	8	32814	32821	25 %	75 %	0 %	0 %	229599723
88	NC_012656	TTCA	2	8	33054	33061	25 %	50 %	0 %	25 %	229599723
89	NC_012656	TTTC	2	8	34257	34264	0 %	75 %	0 %	25 %	229599816
90	NC_012656	TAAT	2	8	37111	37118	50 %	50 %	0 %	0 %	229599799
91	NC_012656	ATCT	2	8	37477	37484	25 %	50 %	0 %	25 %	229599799
92	NC_012656	AATT	2	8	37504	37511	50 %	50 %	0 %	0 %	229599799
93	NC_012656	ATTA	2	8	37646	37653	50 %	50 %	0 %	0 %	229599799
94	NC_012656	ATCT	2	8	38053	38060	25 %	50 %	0 %	25 %	229599873
95	NC_012656	AATT	2	8	38172	38179	50 %	50 %	0 %	0 %	229599873
96	NC_012656	ATTT	2	8	38355	38362	25 %	75 %	0 %	0 %	229599873
97	NC_012656	ATGC	2	8	38613	38620	25 %	25 %	25 %	25 %	229599749
98	NC_012656	AATA	2	8	39239	39246	75 %	25 %	0 %	0 %	229599749
99	NC_012656	AGTA	2	8	39289	39296	50 %	25 %	25 %	0 %	229599749
100	NC_012656	GTTT	2	8	39744	39751	0 %	75 %	25 %	0 %	229599829
101	NC_012656	CGAA	2	8	39884	39891	50 %	0 %	25 %	25 %	229599829
102	NC_012656	GATA	2	8	40063	40070	50 %	25 %	25 %	0 %	229599829
103	NC_012656	TCCT	2	8	40084	40091	0 %	50 %	0 %	50 %	229599829
104	NC_012656	GTTT	2	8	40372	40379	0 %	75 %	25 %	0 %	229599829
105	NC_012656	CTTT	2	8	41264	41271	0 %	75 %	0 %	25 %	229599717
106	NC_012656	ATAA	2	8	41716	41723	75 %	25 %	0 %	0 %	229599805
107	NC_012656	TGCC	2	8	42080	42087	0 %	25 %	25 %	50 %	229599805
108	NC_012656	TTTC	3	12	44833	44844	0 %	75 %	0 %	25 %	229599775
109	NC_012656	CCTC	2	8	45948	45955	0 %	25 %	0 %	75 %	229599730
110	NC_012656	TAAA	2	8	46624	46631	75 %	25 %	0 %	0 %	229599795
111	NC_012656	TCTT	2	8	47641	47648	0 %	75 %	0 %	25 %	229599726
112	NC_012656	TGTA	2	8	48108	48115	25 %	50 %	25 %	0 %	229599726
113	NC_012656	AATT	2	8	49242	49249	50 %	50 %	0 %	0 %	229599822
114	NC_012656	AAAC	2	8	51782	51789	75 %	0 %	0 %	25 %	229599750
115	NC_012656	TTAC	2	8	51837	51844	25 %	50 %	0 %	25 %	229599750
116	NC_012656	GAAT	2	8	52787	52794	50 %	25 %	25 %	0 %	229599767
117	NC_012656	ATGA	2	8	53043	53050	50 %	25 %	25 %	0 %	229599767
118	NC_012656	TTGG	2	8	54728	54735	0 %	50 %	50 %	0 %	229599767
119	NC_012656	TTAT	2	8	54899	54906	25 %	75 %	0 %	0 %	229599767
120	NC_012656	TAAA	2	8	55194	55201	75 %	25 %	0 %	0 %	229599767
121	NC_012656	AGTG	2	8	55237	55244	25 %	25 %	50 %	0 %	229599767
122	NC_012656	GTTT	2	8	55777	55784	0 %	75 %	25 %	0 %	229599862
123	NC_012656	GTAC	2	8	56300	56307	25 %	25 %	25 %	25 %	229599741
124	NC_012656	CGTA	2	8	56825	56832	25 %	25 %	25 %	25 %	229599741
125	NC_012656	CATA	2	8	56871	56878	50 %	25 %	0 %	25 %	229599741
126	NC_012656	TCAC	2	8	58179	58186	25 %	25 %	0 %	50 %	229599836
127	NC_012656	CTCG	2	8	58359	58366	0 %	25 %	25 %	50 %	229599836
128	NC_012656	ATTA	2	8	58550	58557	50 %	50 %	0 %	0 %	229599836
129	NC_012656	TGCC	2	8	59272	59279	0 %	25 %	25 %	50 %	229599836
130	NC_012656	TTAA	2	8	59343	59350	50 %	50 %	0 %	0 %	229599716
131	NC_012656	GAAG	2	8	59460	59467	50 %	0 %	50 %	0 %	229599716
132	NC_012656	TTCA	2	8	59597	59604	25 %	50 %	0 %	25 %	229599716
133	NC_012656	TGAT	2	8	60246	60253	25 %	50 %	25 %	0 %	229599802
134	NC_012656	AGAA	2	8	61225	61232	75 %	0 %	25 %	0 %	229599752
135	NC_012656	GAAA	2	8	62601	62608	75 %	0 %	25 %	0 %	229599765
136	NC_012656	TTTG	2	8	62755	62762	0 %	75 %	25 %	0 %	229599765
137	NC_012656	GAAA	2	8	63065	63072	75 %	0 %	25 %	0 %	229599765
138	NC_012656	AAGA	2	8	64487	64494	75 %	0 %	25 %	0 %	229599735
139	NC_012656	TGCA	2	8	64961	64968	25 %	25 %	25 %	25 %	229599735
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.