MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012655	ACTCA	2	10	644	653	40 %	20 %	0 %	40 %	229599676
2	NC_012655	TTTCT	2	10	3028	3037	0 %	80 %	0 %	20 %	229599648
3	NC_012655	CTTTT	2	10	3577	3586	0 %	80 %	0 %	20 %	229599648
4	NC_012655	TCATT	2	10	3634	3643	20 %	60 %	0 %	20 %	229599648
5	NC_012655	ACTTT	2	10	4444	4453	20 %	60 %	0 %	20 %	229599626
6	NC_012655	GAATC	2	10	6661	6670	40 %	20 %	20 %	20 %	229599655
7	NC_012655	ATCTT	2	10	9250	9259	20 %	60 %	0 %	20 %	229599699
8	NC_012655	GCTTC	2	10	9557	9566	0 %	40 %	20 %	40 %	229599699
9	NC_012655	CGCTT	2	10	9799	9808	0 %	40 %	20 %	40 %	229599699
10	NC_012655	TTCAC	2	10	9920	9929	20 %	40 %	0 %	40 %	229599699
11	NC_012655	TTTTC	2	10	10466	10475	0 %	80 %	0 %	20 %	229599699
12	NC_012655	ATTCA	2	10	16186	16195	40 %	40 %	0 %	20 %	229599696
13	NC_012655	TTTCA	2	10	18909	18918	20 %	60 %	0 %	20 %	229599643
14	NC_012655	AGAAA	2	10	19333	19342	80 %	0 %	20 %	0 %	229599643
15	NC_012655	TCTTG	2	10	20706	20715	0 %	60 %	20 %	20 %	229599636
16	NC_012655	AAAAT	2	10	26983	26992	80 %	20 %	0 %	0 %	229599662
17	NC_012655	AATTT	2	10	27302	27311	40 %	60 %	0 %	0 %	229599624
18	NC_012655	GATGT	2	10	27427	27436	20 %	40 %	40 %	0 %	229599624
19	NC_012655	TGCTT	2	10	29118	29127	0 %	60 %	20 %	20 %	229599683
20	NC_012655	CTTCT	2	10	29242	29251	0 %	60 %	0 %	40 %	229599683
21	NC_012655	CAACA	2	10	32328	32337	60 %	0 %	0 %	40 %	229599625
22	NC_012655	ACTTT	2	10	34547	34556	20 %	60 %	0 %	20 %	229599645
23	NC_012655	CTTAT	2	10	35651	35660	20 %	60 %	0 %	20 %	229599688
24	NC_012655	GGGAT	2	10	36454	36463	20 %	20 %	60 %	0 %	229599661
25	NC_012655	AAACA	2	10	36635	36644	80 %	0 %	0 %	20 %	229599661
26	NC_012655	AAATC	2	10	39768	39777	60 %	20 %	0 %	20 %	229599654
27	NC_012655	TTTTG	2	10	42542	42551	0 %	80 %	20 %	0 %	229599650
28	NC_012655	ATAAG	2	10	42887	42896	60 %	20 %	20 %	0 %	229599674
29	NC_012655	GCAAA	2	10	44374	44383	60 %	0 %	20 %	20 %	229599678
30	NC_012655	TTCTT	2	10	45492	45501	0 %	80 %	0 %	20 %	229599701
31	NC_012655	ATCTT	2	10	50659	50668	20 %	60 %	0 %	20 %	229599687
32	NC_012655	ATTTC	2	10	51193	51202	20 %	60 %	0 %	20 %	229599687
33	NC_012655	TAAAA	2	10	52819	52828	80 %	20 %	0 %	0 %	229599663
34	NC_012655	TTTTA	2	10	54836	54845	20 %	80 %	0 %	0 %	229599667
35	NC_012655	ATTTT	2	10	57453	57462	20 %	80 %	0 %	0 %	229599691
36	NC_012655	TATTT	2	10	66410	66419	20 %	80 %	0 %	0 %	229599680
37	NC_012655	TAAAG	2	10	70117	70126	60 %	20 %	20 %	0 %	229599629
38	NC_012655	GAAAT	2	10	70577	70586	60 %	20 %	20 %	0 %	229599629
39	NC_012655	CTTCA	2	10	74071	74080	20 %	40 %	0 %	40 %	229599640
40	NC_012655	AACAA	2	10	78849	78858	80 %	0 %	0 %	20 %	229599658
41	NC_012655	TAATA	2	10	79069	79078	60 %	40 %	0 %	0 %	229599658
42	NC_012655	ACAAT	2	10	80510	80519	60 %	20 %	0 %	20 %	229599668
43	NC_012655	CAAAA	2	10	83774	83783	80 %	0 %	0 %	20 %	229599710
44	NC_012655	CATTT	2	10	86112	86121	20 %	60 %	0 %	20 %	229599666
45	NC_012655	ATGCA	2	10	90234	90243	40 %	20 %	20 %	20 %	229599679
46	NC_012655	CATTC	2	10	91009	91018	20 %	40 %	0 %	40 %	229599675
47	NC_012655	AAATA	2	10	91048	91057	80 %	20 %	0 %	0 %	229599675
48	NC_012655	TTCCG	2	10	92101	92110	0 %	40 %	20 %	40 %	229599637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.