MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	TTTGT	2	10	60	69	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012654	TCTTT	2	10	182	191	0 %	80 %	0 %	20 %	229587272
3	NC_012654	TTTAA	2	10	1598	1607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012654	CTATA	2	10	2288	2297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012654	TAGCA	2	10	3002	3011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012654	TTAAA	2	10	5821	5830	60 %	40 %	0 %	0 %	229587275
7	NC_012654	TATTG	2	10	9003	9012	20 %	60 %	20 %	0 %	229587276
8	NC_012654	ATTTA	2	10	10899	10908	40 %	60 %	0 %	0 %	229587277
9	NC_012654	ATAAA	2	10	11213	11222	80 %	20 %	0 %	0 %	229587277
10	NC_012654	TAAAA	2	10	11375	11384	80 %	20 %	0 %	0 %	229587277
11	NC_012654	TTTTA	2	10	11800	11809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012654	GTTTA	2	10	11928	11937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012654	TCATG	2	10	12824	12833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012654	TAATT	2	10	14671	14680	40 %	60 %	0 %	0 %	229587280
15	NC_012654	TAATT	2	10	15733	15742	40 %	60 %	0 %	0 %	229587280
16	NC_012654	ATTTT	2	10	16995	17004	20 %	80 %	0 %	0 %	229587281
17	NC_012654	ATTAT	2	10	18048	18057	40 %	60 %	0 %	0 %	229587281
18	NC_012654	CCCAC	2	10	18551	18560	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_012654	TAACT	2	10	18612	18621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012654	CTTTT	2	10	18810	18819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012654	CTTTT	2	10	21392	21401	0 %	80 %	0 %	20 %	229587286
22	NC_012654	TATTT	2	10	21478	21487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012654	CTATT	2	10	21707	21716	20 %	60 %	0 %	20 %	229587287
24	NC_012654	ACTAT	2	10	23309	23318	40 %	40 %	0 %	20 %	229587288
25	NC_012654	CAATA	2	10	25788	25797	60 %	20 %	0 %	20 %	229587290
26	NC_012654	TATTT	2	10	26048	26057	20 %	80 %	0 %	0 %	229587290
27	NC_012654	ACAAA	2	10	26804	26813	80 %	0 %	0 %	20 %	229587290
28	NC_012654	ATTTC	2	10	27685	27694	20 %	60 %	0 %	20 %	229587291
29	NC_012654	TTTCT	2	10	32690	32699	0 %	80 %	0 %	20 %	229587297
30	NC_012654	CTTTA	2	10	32942	32951	20 %	60 %	0 %	20 %	229587298
31	NC_012654	TGAAT	2	10	35489	35498	40 %	40 %	20 %	0 %	229587300
32	NC_012654	TTATT	2	10	36770	36779	20 %	80 %	0 %	0 %	229587302
33	NC_012654	TAATA	2	10	37505	37514	60 %	40 %	0 %	0 %	229587303
34	NC_012654	GTGAT	2	10	38243	38252	20 %	40 %	40 %	0 %	229587304
35	NC_012654	TTTCT	2	10	38292	38301	0 %	80 %	0 %	20 %	229587304
36	NC_012654	TTTTC	2	10	38420	38429	0 %	80 %	0 %	20 %	229587304
37	NC_012654	AAATT	2	10	38969	38978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012654	TAATT	2	10	40724	40733	40 %	60 %	0 %	0 %	229587306
39	NC_012654	TATAT	2	10	41408	41417	40 %	60 %	0 %	0 %	229587306
40	NC_012654	GATAA	2	10	41431	41440	60 %	20 %	20 %	0 %	229587306
41	NC_012654	ATTTA	2	10	41468	41477	40 %	60 %	0 %	0 %	229587306
42	NC_012654	TAATT	2	10	41526	41535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012654	AAATT	2	10	41541	41550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012654	ATTAA	2	10	41951	41960	60 %	40 %	0 %	0 %	229587308
45	NC_012654	AATCC	2	10	41995	42004	40 %	20 %	0 %	40 %	229587308
46	NC_012654	TAAAA	2	10	42202	42211	80 %	20 %	0 %	0 %	229587308
47	NC_012654	TAATA	2	10	43582	43591	60 %	40 %	0 %	0 %	229587310
48	NC_012654	ATATA	2	10	43782	43791	60 %	40 %	0 %	0 %	229587310
49	NC_012654	CCTAT	2	10	43871	43880	20 %	40 %	0 %	40 %	229587310
50	NC_012654	TAATT	2	10	43906	43915	40 %	60 %	0 %	0 %	229587310
51	NC_012654	AAAAC	2	10	45184	45193	80 %	0 %	0 %	20 %	229587311
52	NC_012654	TAGAT	2	10	46649	46658	40 %	40 %	20 %	0 %	229587311
53	NC_012654	ATAAA	2	10	47560	47569	80 %	20 %	0 %	0 %	229587311
54	NC_012654	TAAAT	2	10	48068	48077	60 %	40 %	0 %	0 %	229587311
55	NC_012654	AATAC	2	10	48136	48145	60 %	20 %	0 %	20 %	229587311
56	NC_012654	TAGAA	2	10	48424	48433	60 %	20 %	20 %	0 %	229587311
57	NC_012654	TATAT	2	10	49727	49736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012654	TTTCT	2	10	50001	50010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012654	ATCTA	2	10	50778	50787	40 %	40 %	0 %	20 %	229587312
60	NC_012654	TTATT	2	10	51062	51071	20 %	80 %	0 %	0 %	229587312
61	NC_012654	TAATA	2	10	51867	51876	60 %	40 %	0 %	0 %	229587312
62	NC_012654	TATTT	2	10	52179	52188	20 %	80 %	0 %	0 %	229587312
63	NC_012654	TAACA	2	10	53304	53313	60 %	20 %	0 %	20 %	229587312
64	NC_012654	ACTTA	2	10	53796	53805	40 %	40 %	0 %	20 %	229587312
65	NC_012654	TAATC	2	10	55229	55238	40 %	40 %	0 %	20 %	229587313
66	NC_012654	ATTTT	2	10	57317	57326	20 %	80 %	0 %	0 %	229587315
67	NC_012654	TAATA	2	10	57438	57447	60 %	40 %	0 %	0 %	229587316
68	NC_012654	TAGTA	2	10	58380	58389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	TTACT	2	10	58738	58747	20 %	60 %	0 %	20 %	229587317
70	NC_012654	AAAAG	2	10	58776	58785	80 %	0 %	20 %	0 %	229587317
71	NC_012654	ATATA	2	10	59263	59272	60 %	40 %	0 %	0 %	229587319
72	NC_012654	AGTGG	2	10	59278	59287	20 %	20 %	60 %	0 %	229587319
73	NC_012654	GTGAG	2	10	59521	59530	20 %	20 %	60 %	0 %	229587319
74	NC_012654	AATAA	2	10	59903	59912	80 %	20 %	0 %	0 %	229587320
75	NC_012654	ATATT	2	10	60042	60051	40 %	60 %	0 %	0 %	229587320
76	NC_012654	TAATA	2	10	61391	61400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012654	AAAGA	2	10	62231	62240	80 %	0 %	20 %	0 %	229587323
78	NC_012654	ATAAA	2	10	63042	63051	80 %	20 %	0 %	0 %	229587323
79	NC_012654	TAATT	2	10	63688	63697	40 %	60 %	0 %	0 %	229587323
80	NC_012654	ACAAA	2	10	63770	63779	80 %	0 %	0 %	20 %	229587323
81	NC_012654	TTTTA	2	10	65398	65407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012654	ATTTA	2	10	66151	66160	40 %	60 %	0 %	0 %	229587326
83	NC_012654	TTCCT	2	10	67038	67047	0 %	60 %	0 %	40 %	229587329
84	NC_012654	ACTAT	2	10	67236	67245	40 %	40 %	0 %	20 %	229587330
85	NC_012654	ATTAC	2	10	67793	67802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012654	TTTTA	2	10	68260	68269	20 %	80 %	0 %	0 %	229587333
87	NC_012654	TAAAG	2	10	68742	68751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012654	AAAAT	2	10	69296	69305	80 %	20 %	0 %	0 %	229587335
89	NC_012654	AATTA	2	10	69435	69444	60 %	40 %	0 %	0 %	229587335
90	NC_012654	CTTTT	2	10	69960	69969	0 %	80 %	0 %	20 %	229587335
91	NC_012654	AAATA	2	10	72608	72617	80 %	20 %	0 %	0 %	229587337
92	NC_012654	CTTTT	2	10	73256	73265	0 %	80 %	0 %	20 %	229587337
93	NC_012654	TTTTC	2	10	73413	73422	0 %	80 %	0 %	20 %	229587337
94	NC_012654	AAATA	2	10	73552	73561	80 %	20 %	0 %	0 %	229587337
95	NC_012654	ATAAA	2	10	73901	73910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012654	ATTTA	2	10	74011	74020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012654	AATTC	2	10	74303	74312	40 %	40 %	0 %	20 %	229587338
98	NC_012654	TAATT	2	10	74991	75000	40 %	60 %	0 %	0 %	229587339
99	NC_012654	TATAT	2	10	75675	75684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012654	GATAA	2	10	75698	75707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012654	ATTTA	2	10	75733	75742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012654	TAATT	2	10	75791	75800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012654	AAATT	2	10	75806	75815	60 %	40 %	0 %	0 %	229587340
104	NC_012654	TGTAA	2	10	76613	76622	40 %	40 %	20 %	0 %	229587341
105	NC_012654	TCAAA	2	10	77645	77654	60 %	20 %	0 %	20 %	229587343
106	NC_012654	CAATT	2	10	77770	77779	40 %	40 %	0 %	20 %	229587343
107	NC_012654	AAAGA	2	10	78080	78089	80 %	0 %	20 %	0 %	229587343
108	NC_012654	AAGTT	2	10	79465	79474	40 %	40 %	20 %	0 %	229587346
109	NC_012654	TATAA	2	10	79549	79558	60 %	40 %	0 %	0 %	229587346
110	NC_012654	AAATT	2	10	80447	80456	60 %	40 %	0 %	0 %	229587346
111	NC_012654	TATAT	2	10	81781	81790	40 %	60 %	0 %	0 %	229587347
112	NC_012654	TTTAT	2	10	82102	82111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012654	TAAAA	2	10	82154	82163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012654	AATTA	2	10	82958	82967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012654	ATTTA	2	10	83214	83223	40 %	60 %	0 %	0 %	229587349
116	NC_012654	AAGAG	2	10	85135	85144	60 %	0 %	40 %	0 %	229587351
117	NC_012654	ATATT	2	10	86324	86333	40 %	60 %	0 %	0 %	229587352
118	NC_012654	TTTGA	2	10	87165	87174	20 %	60 %	20 %	0 %	229587354
119	NC_012654	TGCCA	2	10	87240	87249	20 %	20 %	20 %	40 %	229587354
120	NC_012654	TCTTT	2	10	87410	87419	0 %	80 %	0 %	20 %	229587354
121	NC_012654	GTTAA	2	10	88246	88255	40 %	40 %	20 %	0 %	229587355
122	NC_012654	AAATT	2	10	89327	89336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012654	AAATA	2	10	89632	89641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012654	TTATA	2	10	93932	93941	40 %	60 %	0 %	0 %	229587362
125	NC_012654	TATAA	2	10	95693	95702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012654	TATAA	2	10	95936	95945	60 %	40 %	0 %	0 %	229587366
127	NC_012654	AGTTA	2	10	96155	96164	40 %	40 %	20 %	0 %	229587366
128	NC_012654	AAATC	2	10	96669	96678	60 %	20 %	0 %	20 %	229587366
129	NC_012654	ATTTC	2	10	98723	98732	20 %	60 %	0 %	20 %	229587370
130	NC_012654	ATATT	2	10	98849	98858	40 %	60 %	0 %	0 %	229587370
131	NC_012654	TTCCA	2	10	99980	99989	20 %	40 %	0 %	40 %	229587371
132	NC_012654	TTATA	2	10	100373	100382	40 %	60 %	0 %	0 %	229587372
133	NC_012654	CTATA	2	10	100622	100631	40 %	40 %	0 %	20 %	229587372
134	NC_012654	TTTAC	2	10	101673	101682	20 %	60 %	0 %	20 %	229587375
135	NC_012654	TTTGT	2	10	104075	104084	0 %	80 %	20 %	0 %	229587381
136	NC_012654	ATTAA	2	10	104717	104726	60 %	40 %	0 %	0 %	229587382
137	NC_012654	ATTTA	2	10	105157	105166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012654	ATCTT	2	10	106228	106237	20 %	60 %	0 %	20 %	229587383
139	NC_012654	TAAAT	2	10	106521	106530	60 %	40 %	0 %	0 %	229587383
140	NC_012654	TTCTC	2	10	106581	106590	0 %	60 %	0 %	40 %	229587383
141	NC_012654	TTTTA	2	10	108371	108380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.