MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 3789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	TCT	2	6	119	124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
2	NC_012654	TAA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
3	NC_012654	TTC	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
4	NC_012654	TGT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587272
5	NC_012654	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
6	NC_012654	TTA	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587272
7	NC_012654	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
8	NC_012654	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
9	NC_012654	TTG	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587273
10	NC_012654	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
11	NC_012654	TCT	2	6	1123	1128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587273
12	NC_012654	TAG	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
13	NC_012654	ATT	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
14	NC_012654	ATT	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
15	NC_012654	ATT	2	6	1323	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
16	NC_012654	TAT	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
17	NC_012654	TAG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
18	NC_012654	TTA	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
19	NC_012654	ATA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
20	NC_012654	ATC	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
21	NC_012654	AAT	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
22	NC_012654	ATC	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
23	NC_012654	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587274
24	NC_012654	AAT	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
25	NC_012654	ATC	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
26	NC_012654	CTA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
27	NC_012654	TAT	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
28	NC_012654	CTA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
29	NC_012654	TAT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
30	NC_012654	TGA	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
31	NC_012654	ATT	2	6	3269	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
32	NC_012654	TAC	3	9	3332	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
33	NC_012654	TAG	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
34	NC_012654	ACT	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
35	NC_012654	ATT	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
36	NC_012654	ATA	2	6	3513	3518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
37	NC_012654	ATT	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
38	NC_012654	AAT	2	6	3685	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
39	NC_012654	TTA	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
40	NC_012654	TAT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
41	NC_012654	ACT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
42	NC_012654	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
43	NC_012654	ATT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
44	NC_012654	TAT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
45	NC_012654	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
46	NC_012654	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
47	NC_012654	TAC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
48	NC_012654	ATC	3	9	4337	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
49	NC_012654	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
50	NC_012654	TAT	2	6	4468	4473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
51	NC_012654	TAT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
52	NC_012654	TAA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
53	NC_012654	ATC	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
54	NC_012654	ATT	2	6	4715	4720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
55	NC_012654	TAT	2	6	4757	4762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
56	NC_012654	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
57	NC_012654	TCA	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
58	NC_012654	TTA	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
59	NC_012654	GAA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587275
60	NC_012654	TAA	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
61	NC_012654	AAT	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
62	NC_012654	ATA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
63	NC_012654	TTG	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587275
64	NC_012654	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
65	NC_012654	GCT	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
66	NC_012654	TCT	2	6	5559	5564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
67	NC_012654	TCT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
68	NC_012654	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
69	NC_012654	TTA	2	6	5655	5660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
70	NC_012654	TTA	2	6	5692	5697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
71	NC_012654	TTA	3	9	5766	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
72	NC_012654	TGC	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
73	NC_012654	CAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
74	NC_012654	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
75	NC_012654	AGT	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
76	NC_012654	CTA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
77	NC_012654	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
78	NC_012654	TTA	2	6	6132	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
79	NC_012654	TAA	2	6	6138	6143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
80	NC_012654	CAT	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
81	NC_012654	ATA	2	6	6245	6250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
82	NC_012654	CTG	2	6	6343	6348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
83	NC_012654	CTC	2	6	6404	6409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587275
84	NC_012654	CGT	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
85	NC_012654	ACT	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
86	NC_012654	ATA	2	6	6516	6521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
87	NC_012654	TAT	2	6	6536	6541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
88	NC_012654	TTC	2	6	6554	6559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
89	NC_012654	ATC	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
90	NC_012654	TAT	2	6	6584	6589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
91	NC_012654	TAA	2	6	6674	6679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
92	NC_012654	TTC	2	6	6682	6687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
93	NC_012654	AAT	2	6	6714	6719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
94	NC_012654	AAT	2	6	6736	6741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
95	NC_012654	ATA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
96	NC_012654	TGG	3	9	6809	6817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587275
97	NC_012654	CTT	2	6	6829	6834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
98	NC_012654	TAT	2	6	6877	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
99	NC_012654	TTA	2	6	6981	6986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
100	NC_012654	ATT	2	6	7040	7045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
101	NC_012654	CAT	2	6	7076	7081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
102	NC_012654	ATC	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
103	NC_012654	TAA	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
104	NC_012654	TAT	2	6	7232	7237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
105	NC_012654	ATT	2	6	7282	7287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
106	NC_012654	TCA	2	6	7291	7296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
107	NC_012654	TAA	2	6	7332	7337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
108	NC_012654	TAT	2	6	7373	7378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
109	NC_012654	TAT	3	9	7394	7402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
110	NC_012654	TTC	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587276
111	NC_012654	ATT	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
112	NC_012654	AAT	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
113	NC_012654	CTT	2	6	7538	7543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587276
114	NC_012654	GTA	2	6	7549	7554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587276
115	NC_012654	ATT	3	9	7593	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
116	NC_012654	TAA	2	6	7605	7610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
117	NC_012654	ACT	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
118	NC_012654	ATC	2	6	7674	7679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
119	NC_012654	TAA	2	6	7689	7694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
120	NC_012654	TAT	2	6	7739	7744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
121	NC_012654	ATC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
122	NC_012654	TCT	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587276
123	NC_012654	TAC	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
124	NC_012654	ATT	2	6	8076	8081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
125	NC_012654	TTC	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587276
126	NC_012654	AAT	2	6	8250	8255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
127	NC_012654	ATT	2	6	8298	8303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
128	NC_012654	ATT	2	6	8391	8396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
129	NC_012654	TGT	3	9	8439	8447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587276
130	NC_012654	TCA	2	6	8453	8458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
131	NC_012654	GAT	2	6	8473	8478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587276
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