MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 1046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
2	NC_012654	TA	3	6	397	402	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
3	NC_012654	AT	3	6	525	530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012654	AT	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012654	AT	3	6	634	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012654	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012654	TA	3	6	1142	1147	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
8	NC_012654	TA	3	6	1262	1267	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
9	NC_012654	AT	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012654	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
11	NC_012654	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
12	NC_012654	TA	3	6	1724	1729	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
13	NC_012654	TA	3	6	2106	2111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012654	TA	3	6	2143	2148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012654	AT	3	6	2855	2860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012654	TC	3	6	3120	3125	0 %	50 %	0 %	50 %	229587275
17	NC_012654	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
18	NC_012654	TA	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
19	NC_012654	TA	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
20	NC_012654	AT	3	6	3976	3981	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
21	NC_012654	TA	3	6	4300	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
22	NC_012654	TA	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
23	NC_012654	AT	3	6	4389	4394	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
24	NC_012654	AT	4	8	4526	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
25	NC_012654	TA	3	6	4859	4864	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
26	NC_012654	TA	3	6	5053	5058	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
27	NC_012654	TA	3	6	5087	5092	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
28	NC_012654	TA	3	6	5225	5230	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
29	NC_012654	TC	3	6	6707	6712	0 %	50 %	0 %	50 %	229587275
30	NC_012654	TA	3	6	6932	6937	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
31	NC_012654	AT	4	8	7127	7134	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
32	NC_012654	AT	3	6	7172	7177	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
33	NC_012654	AT	3	6	7244	7249	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
34	NC_012654	TA	3	6	7251	7256	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
35	NC_012654	AT	4	8	7389	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
36	NC_012654	AT	3	6	7416	7421	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
37	NC_012654	TA	3	6	7445	7450	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
38	NC_012654	TA	3	6	7497	7502	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
39	NC_012654	TA	3	6	7725	7730	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
40	NC_012654	AT	4	8	7761	7768	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
41	NC_012654	AT	4	8	8337	8344	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
42	NC_012654	AT	3	6	8477	8482	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
43	NC_012654	AT	3	6	8663	8668	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
44	NC_012654	TA	3	6	9167	9172	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
45	NC_012654	AT	4	8	9207	9214	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
46	NC_012654	AT	3	6	9626	9631	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
47	NC_012654	AT	3	6	10519	10524	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
48	NC_012654	TA	3	6	10743	10748	50 %	50 %	0 %	0 %	229587277
49	NC_012654	AT	3	6	11321	11326	50 %	50 %	0 %	0 %	229587277
50	NC_012654	AT	3	6	11820	11825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012654	TA	3	6	11947	11952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012654	AT	3	6	12079	12084	50 %	50 %	0 %	0 %	229587278
53	NC_012654	TA	3	6	12266	12271	50 %	50 %	0 %	0 %	229587278
54	NC_012654	AT	4	8	12387	12394	50 %	50 %	0 %	0 %	229587278
55	NC_012654	TA	3	6	12460	12465	50 %	50 %	0 %	0 %	229587278
56	NC_012654	AT	3	6	12520	12525	50 %	50 %	0 %	0 %	229587278
57	NC_012654	AT	4	8	12568	12575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012654	CA	3	6	12619	12624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012654	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012654	TC	3	6	13714	13719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012654	TA	3	6	14141	14146	50 %	50 %	0 %	0 %	229587279
62	NC_012654	TA	3	6	14889	14894	50 %	50 %	0 %	0 %	229587280
63	NC_012654	AT	3	6	15301	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	229587280
64	NC_012654	AT	3	6	16348	16353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587280
65	NC_012654	TA	4	8	17141	17148	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
66	NC_012654	TA	3	6	17458	17463	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
67	NC_012654	AT	3	6	18089	18094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012654	AT	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	TA	3	6	20255	20260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012654	TG	3	6	20586	20591	0 %	50 %	50 %	0 %	229587284
71	NC_012654	TA	3	6	20905	20910	50 %	50 %	0 %	0 %	229587284
72	NC_012654	AT	4	8	20955	20962	50 %	50 %	0 %	0 %	229587285
73	NC_012654	AT	3	6	21050	21055	50 %	50 %	0 %	0 %	229587285
74	NC_012654	TA	3	6	21136	21141	50 %	50 %	0 %	0 %	229587285
75	NC_012654	TA	3	6	21256	21261	50 %	50 %	0 %	0 %	229587285
76	NC_012654	TA	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	229587286
77	NC_012654	TA	3	6	21412	21417	50 %	50 %	0 %	0 %	229587286
78	NC_012654	AT	3	6	21845	21850	50 %	50 %	0 %	0 %	229587287
79	NC_012654	AT	4	8	22122	22129	50 %	50 %	0 %	0 %	229587287
80	NC_012654	TA	3	6	22198	22203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012654	TA	3	6	22220	22225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012654	TA	3	6	22341	22346	50 %	50 %	0 %	0 %	229587288
83	NC_012654	AT	3	6	22994	22999	50 %	50 %	0 %	0 %	229587288
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85	NC_012654	AT	3	6	23792	23797	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
86	NC_012654	AT	3	6	24487	24492	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
87	NC_012654	AT	3	6	24581	24586	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
88	NC_012654	AT	3	6	24661	24666	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
89	NC_012654	CT	3	6	24856	24861	0 %	50 %	0 %	50 %	229587289
90	NC_012654	CA	3	6	25681	25686	50 %	0 %	0 %	50 %	229587290
91	NC_012654	AT	3	6	26450	26455	50 %	50 %	0 %	0 %	229587290
92	NC_012654	TA	3	6	27046	27051	50 %	50 %	0 %	0 %	229587291
93	NC_012654	AT	3	6	27416	27421	50 %	50 %	0 %	0 %	229587291
94	NC_012654	GT	3	6	27652	27657	0 %	50 %	50 %	0 %	229587291
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98	NC_012654	AT	3	6	28846	28851	50 %	50 %	0 %	0 %	229587293
99	NC_012654	AT	3	6	28977	28982	50 %	50 %	0 %	0 %	229587293
100	NC_012654	AT	3	6	29491	29496	50 %	50 %	0 %	0 %	229587294
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104	NC_012654	AT	3	6	30467	30472	50 %	50 %	0 %	0 %	229587295
105	NC_012654	AT	3	6	31211	31216	50 %	50 %	0 %	0 %	229587296
106	NC_012654	AT	3	6	31267	31272	50 %	50 %	0 %	0 %	229587296
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108	NC_012654	TA	3	6	31527	31532	50 %	50 %	0 %	0 %	229587297
109	NC_012654	TA	4	8	31565	31572	50 %	50 %	0 %	0 %	229587297
110	NC_012654	AT	3	6	31721	31726	50 %	50 %	0 %	0 %	229587297
111	NC_012654	CT	3	6	31980	31985	0 %	50 %	0 %	50 %	229587297
112	NC_012654	CT	3	6	32788	32793	0 %	50 %	0 %	50 %	229587298
113	NC_012654	AT	3	6	32799	32804	50 %	50 %	0 %	0 %	229587298
114	NC_012654	TA	3	6	33665	33670	50 %	50 %	0 %	0 %	229587298
115	NC_012654	AT	3	6	34177	34182	50 %	50 %	0 %	0 %	229587299
116	NC_012654	AT	3	6	34451	34456	50 %	50 %	0 %	0 %	229587299
117	NC_012654	AT	3	6	34641	34646	50 %	50 %	0 %	0 %	229587299
118	NC_012654	CA	3	6	35182	35187	50 %	0 %	0 %	50 %	229587300
119	NC_012654	TA	3	6	35431	35436	50 %	50 %	0 %	0 %	229587300
120	NC_012654	TA	4	8	35549	35556	50 %	50 %	0 %	0 %	229587300
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123	NC_012654	TA	3	6	36266	36271	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
124	NC_012654	AT	3	6	36359	36364	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
125	NC_012654	AT	3	6	36440	36445	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
126	NC_012654	AT	3	6	36524	36529	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
127	NC_012654	AT	3	6	36626	36631	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
128	NC_012654	AT	3	6	37003	37008	50 %	50 %	0 %	0 %	229587302
129	NC_012654	TA	3	6	37891	37896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012654	AT	3	6	38514	38519	50 %	50 %	0 %	0 %	229587304
131	NC_012654	TA	3	6	38866	38871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012654	AT	4	8	39089	39096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012654	TA	4	8	39120	39127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012654	TG	3	6	39589	39594	0 %	50 %	50 %	0 %	229587305
135	NC_012654	AT	3	6	39672	39677	50 %	50 %	0 %	0 %	229587305
136	NC_012654	GA	3	6	39827	39832	50 %	0 %	50 %	0 %	229587305
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138	NC_012654	CA	3	6	40162	40167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012654	TA	3	6	40417	40422	50 %	50 %	0 %	0 %	229587306
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142	NC_012654	TA	3	6	42406	42411	50 %	50 %	0 %	0 %	229587308
143	NC_012654	TA	3	6	43338	43343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012654	AT	3	6	43357	43362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012654	TA	3	6	43448	43453	50 %	50 %	0 %	0 %	229587310
146	NC_012654	AT	3	6	44448	44453	50 %	50 %	0 %	0 %	229587310
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