MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	AT	3	6	525	530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012654	AT	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012654	AT	3	6	634	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012654	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012654	AT	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012654	TA	3	6	2106	2111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012654	TA	3	6	2143	2148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012654	AT	3	6	2855	2860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012654	AT	3	6	11820	11825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012654	TA	3	6	11947	11952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012654	AT	4	8	12568	12575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012654	CA	3	6	12619	12624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012654	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012654	TC	3	6	13714	13719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012654	AT	3	6	18089	18094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012654	AT	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012654	TA	3	6	20255	20260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012654	TA	3	6	22198	22203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012654	TA	3	6	22220	22225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012654	TA	3	6	37891	37896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012654	TA	3	6	38866	38871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012654	AT	4	8	39089	39096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012654	TA	4	8	39120	39127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012654	AT	3	6	40050	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012654	CA	3	6	40162	40167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012654	TA	3	6	43338	43343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012654	AT	3	6	43357	43362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012654	TA	3	6	44758	44763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012654	AT	3	6	44767	44772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012654	TA	3	6	48584	48589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012654	TA	3	6	48712	48717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012654	TC	3	6	48871	48876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012654	TA	3	6	49250	49255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012654	TA	3	6	49281	49286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012654	AT	3	6	49381	49386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012654	TA	4	8	50029	50036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012654	AT	3	6	50041	50046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012654	TC	3	6	50093	50098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012654	TA	3	6	50122	50127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012654	TA	3	6	50281	50286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012654	TA	3	6	50383	50388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012654	TA	3	6	50499	50504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012654	TA	3	6	54318	54323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012654	AT	3	6	54356	54361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012654	TA	4	8	54363	54370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012654	GT	3	6	54445	54450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012654	TA	3	6	55379	55384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012654	TA	3	6	58246	58251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012654	AT	3	6	61185	61190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012654	TA	4	8	64668	64675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012654	TA	4	8	64677	64684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012654	TA	3	6	64792	64797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012654	AT	3	6	65323	65328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012654	AT	3	6	66013	66018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012654	TA	3	6	66019	66024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012654	TA	4	8	66062	66069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012654	TA	3	6	66310	66315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012654	TA	4	8	66370	66377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012654	CT	3	6	67500	67505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012654	AT	3	6	67572	67577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012654	TA	3	6	67671	67676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012654	TA	4	8	68823	68830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012654	AT	3	6	71101	71106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012654	TA	3	6	71389	71394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012654	TA	3	6	73939	73944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012654	AT	3	6	78668	78673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012654	TA	3	6	79427	79432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012654	TA	3	6	80810	80815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	TA	4	8	80887	80894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012654	TA	4	8	82118	82125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012654	AT	3	6	82486	82491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012654	TA	3	6	82585	82590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012654	TA	3	6	82659	82664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012654	TA	3	6	82803	82808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012654	TA	3	6	82886	82891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012654	AT	4	8	82909	82916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012654	AT	3	6	82997	83002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012654	TA	3	6	86021	86026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012654	TA	3	6	86165	86170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012654	AT	3	6	86700	86705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012654	TA	3	6	86715	86720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012654	CT	3	6	87041	87046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012654	AT	3	6	87052	87057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012654	TA	4	8	88172	88179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012654	TA	3	6	88580	88585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012654	AT	3	6	88594	88599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012654	TA	3	6	88697	88702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012654	TA	3	6	89132	89137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012654	AT	3	6	89253	89258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012654	TA	3	6	89355	89360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012654	AT	3	6	89444	89449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012654	TA	3	6	89606	89611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012654	AT	3	6	89683	89688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012654	TA	4	8	91013	91020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012654	AT	3	6	93536	93541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012654	TA	3	6	94387	94392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012654	TA	4	8	94991	94998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012654	AT	3	6	97213	97218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012654	TA	4	8	99349	99356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012654	TA	3	6	100100	100105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012654	TA	4	8	102454	102461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012654	TA	3	6	103354	103359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012654	AT	3	6	103368	103373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012654	TA	3	6	103444	103449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012654	TA	4	8	103845	103852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012654	TA	4	8	103893	103900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012654	AT	3	6	104997	105002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012654	AT	3	6	105039	105044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012654	TA	4	8	105110	105117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012654	AT	4	8	105198	105205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012654	TA	3	6	105237	105242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012654	AT	3	6	105245	105250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012654	TA	3	6	108404	108409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012654	TA	4	8	108530	108537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012654	TA	3	6	109255	109260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012654	AT	3	6	109707	109712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012654	TA	3	6	110558	110563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012654	AT	3	6	110821	110826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012654	TA	4	8	110889	110896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012654	TA	4	8	112143	112150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012654	AT	3	6	114555	114560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012654	CA	3	6	115885	115890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012654	AT	3	6	116505	116510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012654	CT	3	6	118112	118117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012654	AT	3	6	118318	118323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012654	TC	4	8	118350	118357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012654	AT	3	6	118608	118613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012654	CT	3	6	119374	119379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012654	AT	3	6	119618	119623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012654	AT	3	6	119644	119649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012654	TA	3	6	119751	119756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012654	TA	4	8	127384	127391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012654	AT	3	6	128114	128119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012654	AT	3	6	131588	131593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012654	TA	3	6	131619	131624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012654	AT	3	6	132205	132210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012654	AT	3	6	132224	132229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012654	CA	3	6	132237	132242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012654	AT	3	6	132718	132723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012654	TA	4	8	132787	132794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012654	AT	3	6	132968	132973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012654	AT	3	6	134658	134663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012654	AT	3	6	134721	134726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_012654	AT	3	6	135162	135167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012654	AT	3	6	136482	136487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012654	TA	3	6	136631	136636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012654	TA	3	6	136641	136646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012654	TA	3	6	137593	137598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012654	TA	3	6	137602	137607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012654	AT	3	6	138023	138028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012654	TA	3	6	138209	138214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012654	TA	3	6	138323	138328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012654	AT	3	6	138336	138341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012654	AT	3	6	140193	140198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012654	TA	3	6	140205	140210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012654	GT	3	6	140251	140256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.