MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 plasmid pRAF

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012634	AGTA	2	8	453	460	50 %	25 %	25 %	0 %	228478452
2	NC_012634	CTTT	2	8	652	659	0 %	75 %	0 %	25 %	228478452
3	NC_012634	ACTT	2	8	1517	1524	25 %	50 %	0 %	25 %	228478452
4	NC_012634	AGCG	2	8	1735	1742	25 %	0 %	50 %	25 %	228478452
5	NC_012634	GAAA	2	8	1852	1859	75 %	0 %	25 %	0 %	228478452
6	NC_012634	AAAG	2	8	2857	2864	75 %	0 %	25 %	0 %	228478453
7	NC_012634	GTAA	2	8	2961	2968	50 %	25 %	25 %	0 %	228478453
8	NC_012634	GCAG	2	8	3256	3263	25 %	0 %	50 %	25 %	228478454
9	NC_012634	TTTC	2	8	3430	3437	0 %	75 %	0 %	25 %	228478454
10	NC_012634	TAGG	2	8	3639	3646	25 %	25 %	50 %	0 %	228478454
11	NC_012634	TCTT	2	8	5491	5498	0 %	75 %	0 %	25 %	228478456
12	NC_012634	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	228478456
13	NC_012634	CTAA	2	8	5851	5858	50 %	25 %	0 %	25 %	228478457
14	NC_012634	TAGT	2	8	5911	5918	25 %	50 %	25 %	0 %	228478457
15	NC_012634	TAAT	2	8	5950	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	228478457
16	NC_012634	AGAA	2	8	5974	5981	75 %	0 %	25 %	0 %	228478457
17	NC_012634	AAGA	2	8	6015	6022	75 %	0 %	25 %	0 %	228478457
18	NC_012634	ATAG	2	8	6081	6088	50 %	25 %	25 %	0 %	228478457
19	NC_012634	TTCT	2	8	6168	6175	0 %	75 %	0 %	25 %	228478457
20	NC_012634	TTAG	2	8	6417	6424	25 %	50 %	25 %	0 %	228478458
21	NC_012634	AATG	2	8	7320	7327	50 %	25 %	25 %	0 %	228478459
22	NC_012634	TGAA	2	8	7979	7986	50 %	25 %	25 %	0 %	228478460
23	NC_012634	ACTT	2	8	8184	8191	25 %	50 %	0 %	25 %	228478460
24	NC_012634	TGTT	2	8	8584	8591	0 %	75 %	25 %	0 %	228478460
25	NC_012634	GCTA	2	8	8667	8674	25 %	25 %	25 %	25 %	228478460
26	NC_012634	TACA	2	8	9143	9150	50 %	25 %	0 %	25 %	228478460
27	NC_012634	TGCT	2	8	9729	9736	0 %	50 %	25 %	25 %	228478460
28	NC_012634	TATT	2	8	11680	11687	25 %	75 %	0 %	0 %	228478462
29	NC_012634	TTGC	2	8	11829	11836	0 %	50 %	25 %	25 %	228478462

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.