MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 plasmid pRAF

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012634	AT	3	6	110	115	50 %	50 %	0 %	0 %	228478452
2	NC_012634	AT	3	6	719	724	50 %	50 %	0 %	0 %	228478452
3	NC_012634	AT	3	6	729	734	50 %	50 %	0 %	0 %	228478452
4	NC_012634	AT	3	6	830	835	50 %	50 %	0 %	0 %	228478452
5	NC_012634	CT	3	6	930	935	0 %	50 %	0 %	50 %	228478452
6	NC_012634	AG	3	6	964	969	50 %	0 %	50 %	0 %	228478452
7	NC_012634	TA	3	6	1063	1068	50 %	50 %	0 %	0 %	228478452
8	NC_012634	GA	3	6	2001	2006	50 %	0 %	50 %	0 %	228478452
9	NC_012634	AT	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	228478453
10	NC_012634	GA	3	6	3468	3473	50 %	0 %	50 %	0 %	228478454
11	NC_012634	AG	3	6	3910	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	228478455
12	NC_012634	AT	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	228478455
13	NC_012634	AT	3	6	4827	4832	50 %	50 %	0 %	0 %	228478456
14	NC_012634	GT	3	6	5743	5748	0 %	50 %	50 %	0 %	228478456
15	NC_012634	TA	3	6	6769	6774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012634	AT	3	6	7090	7095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012634	TC	3	6	7600	7605	0 %	50 %	0 %	50 %	228478459
18	NC_012634	AT	4	8	7625	7632	50 %	50 %	0 %	0 %	228478459
19	NC_012634	TC	3	6	8013	8018	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
20	NC_012634	AT	3	6	8381	8386	50 %	50 %	0 %	0 %	228478460
21	NC_012634	CT	3	6	9036	9041	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
22	NC_012634	TA	3	6	9478	9483	50 %	50 %	0 %	0 %	228478460
23	NC_012634	CT	3	6	9546	9551	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
24	NC_012634	TC	3	6	9794	9799	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
25	NC_012634	CT	4	8	9888	9895	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
26	NC_012634	CT	3	6	10348	10353	0 %	50 %	0 %	50 %	228478460
27	NC_012634	AT	3	6	10405	10410	50 %	50 %	0 %	0 %	228478460
28	NC_012634	TA	3	6	10787	10792	50 %	50 %	0 %	0 %	228478461
29	NC_012634	AT	3	6	10810	10815	50 %	50 %	0 %	0 %	228478461
30	NC_012634	AT	3	6	10988	10993	50 %	50 %	0 %	0 %	228478461
31	NC_012634	TC	3	6	11185	11190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012634	AT	3	6	11399	11404	50 %	50 %	0 %	0 %	228478462
33	NC_012634	AT	3	6	11734	11739	50 %	50 %	0 %	0 %	228478462
34	NC_012634	TA	3	6	11958	11963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012634	CA	3	6	12184	12189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.