MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 plasmid pRAF

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012634	A	7	7	977	983	100 %	0 %	0 %	0 %	228478452
2	NC_012634	A	7	7	999	1005	100 %	0 %	0 %	0 %	228478452
3	NC_012634	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	228478452
4	NC_012634	T	6	6	1144	1149	0 %	100 %	0 %	0 %	228478452
5	NC_012634	T	6	6	1197	1202	0 %	100 %	0 %	0 %	228478452
6	NC_012634	G	6	6	1711	1716	0 %	0 %	100 %	0 %	228478452
7	NC_012634	A	6	6	2528	2533	100 %	0 %	0 %	0 %	228478453
8	NC_012634	A	7	7	2670	2676	100 %	0 %	0 %	0 %	228478453
9	NC_012634	A	6	6	2766	2771	100 %	0 %	0 %	0 %	228478453
10	NC_012634	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	228478453
11	NC_012634	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	228478453
12	NC_012634	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012634	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012634	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	228478454
15	NC_012634	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	228478454
16	NC_012634	A	7	7	3368	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	228478454
17	NC_012634	A	6	6	3558	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	228478454
18	NC_012634	A	6	6	3771	3776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012634	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	228478455
20	NC_012634	T	7	7	4871	4877	0 %	100 %	0 %	0 %	228478456
21	NC_012634	T	6	6	5422	5427	0 %	100 %	0 %	0 %	228478456
22	NC_012634	T	6	6	5454	5459	0 %	100 %	0 %	0 %	228478456
23	NC_012634	A	6	6	6636	6641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012634	T	7	7	6998	7004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012634	C	6	6	7080	7085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_012634	A	6	6	7407	7412	100 %	0 %	0 %	0 %	228478459
27	NC_012634	T	6	6	7764	7769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012634	T	6	6	8298	8303	0 %	100 %	0 %	0 %	228478460
29	NC_012634	T	6	6	8633	8638	0 %	100 %	0 %	0 %	228478460
30	NC_012634	T	6	6	9535	9540	0 %	100 %	0 %	0 %	228478460
31	NC_012634	T	6	6	9901	9906	0 %	100 %	0 %	0 %	228478460
32	NC_012634	A	6	6	10105	10110	100 %	0 %	0 %	0 %	228478460
33	NC_012634	A	8	8	10508	10515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012634	T	6	6	10557	10562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012634	A	7	7	10948	10954	100 %	0 %	0 %	0 %	228478461
36	NC_012634	T	6	6	11006	11011	0 %	100 %	0 %	0 %	228478461
37	NC_012634	T	9	9	11281	11289	0 %	100 %	0 %	0 %	228478462
38	NC_012634	T	6	6	11442	11447	0 %	100 %	0 %	0 %	228478462
39	NC_012634	T	6	6	11752	11757	0 %	100 %	0 %	0 %	228478462
40	NC_012634	T	6	6	11817	11822	0 %	100 %	0 %	0 %	228478462
41	NC_012634	T	8	8	11978	11985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.