MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	TTTTA	2	10	2495	2504	20 %	80 %	0 %	0 %	229586234
2	NC_012633	ATTTA	2	10	2848	2857	40 %	60 %	0 %	0 %	229586234
3	NC_012633	GGTCA	2	10	4095	4104	20 %	20 %	40 %	20 %	229586235
4	NC_012633	TAAAT	2	10	4804	4813	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
5	NC_012633	TCAAT	2	10	5074	5083	40 %	40 %	0 %	20 %	229586235
6	NC_012633	GTAGT	2	10	5130	5139	20 %	40 %	40 %	0 %	229586235
7	NC_012633	TAATA	2	10	5990	5999	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
8	NC_012633	ACTTT	2	10	6779	6788	20 %	60 %	0 %	20 %	229586238
9	NC_012633	AATAC	2	10	7320	7329	60 %	20 %	0 %	20 %	229586238
10	NC_012633	ATCCA	2	10	7817	7826	40 %	20 %	0 %	40 %	229586239
11	NC_012633	AGCAG	2	10	10705	10714	40 %	0 %	40 %	20 %	229586241
12	NC_012633	TTAAT	2	10	10848	10857	40 %	60 %	0 %	0 %	229586241
13	NC_012633	TAACT	2	10	12138	12147	40 %	40 %	0 %	20 %	229586243
14	NC_012633	ATTTA	2	10	13792	13801	40 %	60 %	0 %	0 %	229586245
15	NC_012633	TTTTA	2	10	14560	14569	20 %	80 %	0 %	0 %	229586245
16	NC_012633	TCAAG	2	10	18356	18365	40 %	20 %	20 %	20 %	229586247
17	NC_012633	ATAAA	2	10	18410	18419	80 %	20 %	0 %	0 %	229586247
18	NC_012633	AGAAA	2	10	18672	18681	80 %	0 %	20 %	0 %	229586247
19	NC_012633	AAAGC	2	10	18928	18937	60 %	0 %	20 %	20 %	229586247
20	NC_012633	TAATA	2	10	19848	19857	60 %	40 %	0 %	0 %	229586247
21	NC_012633	CAAAG	2	10	19940	19949	60 %	0 %	20 %	20 %	229586247
22	NC_012633	AGCAG	2	10	20266	20275	40 %	0 %	40 %	20 %	229586247
23	NC_012633	TACCT	2	10	21624	21633	20 %	40 %	0 %	40 %	229586247
24	NC_012633	ATATT	2	10	24690	24699	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
25	NC_012633	ATATT	2	10	24728	24737	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
26	NC_012633	TTTGT	2	10	26842	26851	0 %	80 %	20 %	0 %	229586251
27	NC_012633	TCATT	2	10	28619	28628	20 %	60 %	0 %	20 %	229586255
28	NC_012633	ATACA	2	10	29615	29624	60 %	20 %	0 %	20 %	229586256
29	NC_012633	AGAAA	2	10	43873	43882	80 %	0 %	20 %	0 %	229586265
30	NC_012633	GTTTC	2	10	44313	44322	0 %	60 %	20 %	20 %	229586265
31	NC_012633	ATTTT	2	10	44862	44871	20 %	80 %	0 %	0 %	229586265
32	NC_012633	AAGAG	2	10	46310	46319	60 %	0 %	40 %	0 %	229586267
33	NC_012633	TTGAT	2	10	51039	51048	20 %	60 %	20 %	0 %	229586269
34	NC_012633	TAAAG	2	10	52066	52075	60 %	20 %	20 %	0 %	229586269
35	NC_012633	ATTAT	2	10	52139	52148	40 %	60 %	0 %	0 %	229586269
36	NC_012633	TCGGT	2	10	57560	57569	0 %	40 %	40 %	20 %	229586276
37	NC_012633	GCTTT	2	10	58983	58992	0 %	60 %	20 %	20 %	229586277
38	NC_012633	TAAAA	2	10	63209	63218	80 %	20 %	0 %	0 %	229586280
39	NC_012633	ACTTT	2	10	66266	66275	20 %	60 %	0 %	20 %	229586284
40	NC_012633	CATTT	2	10	67158	67167	20 %	60 %	0 %	20 %	229586284
41	NC_012633	TTAAA	2	10	67183	67192	60 %	40 %	0 %	0 %	229586284
42	NC_012633	ACATA	2	10	69976	69985	60 %	20 %	0 %	20 %	229586288
43	NC_012633	TTTCT	2	10	73329	73338	0 %	80 %	0 %	20 %	229586292
44	NC_012633	ATTTA	2	10	73743	73752	40 %	60 %	0 %	0 %	229586293
45	NC_012633	AAAAG	2	10	74519	74528	80 %	0 %	20 %	0 %	229586293
46	NC_012633	GGGTT	2	10	74729	74738	0 %	40 %	60 %	0 %	229586293
47	NC_012633	TTTAT	2	10	75105	75114	20 %	80 %	0 %	0 %	229586293
48	NC_012633	GCTTA	2	10	76275	76284	20 %	40 %	20 %	20 %	229586294
49	NC_012633	ACAAT	2	10	76639	76648	60 %	20 %	0 %	20 %	229586295
50	NC_012633	ACCGT	2	10	76892	76901	20 %	20 %	20 %	40 %	229586295
51	NC_012633	GTTAT	2	10	77264	77273	20 %	60 %	20 %	0 %	229586296
52	NC_012633	GTAGA	2	10	77570	77579	40 %	20 %	40 %	0 %	229586296
53	NC_012633	CAATG	2	10	79922	79931	40 %	20 %	20 %	20 %	229586298
54	NC_012633	ATAAA	2	10	80385	80394	80 %	20 %	0 %	0 %	229586299
55	NC_012633	ATTAT	2	10	80820	80829	40 %	60 %	0 %	0 %	229586299
56	NC_012633	ATTAA	2	10	81091	81100	60 %	40 %	0 %	0 %	229586299
57	NC_012633	GAAAA	2	10	81643	81652	80 %	0 %	20 %	0 %	229586300
58	NC_012633	TAAAT	2	10	85103	85112	60 %	40 %	0 %	0 %	229586303
59	NC_012633	CGCAT	3	15	89360	89374	20 %	20 %	20 %	40 %	229586306
60	NC_012633	TGAAA	2	10	92590	92599	60 %	20 %	20 %	0 %	229586309
61	NC_012633	ATTTA	2	10	95865	95874	40 %	60 %	0 %	0 %	229586313
62	NC_012633	TCAAA	2	10	97516	97525	60 %	20 %	0 %	20 %	229586315
63	NC_012633	TTAAT	2	10	98226	98235	40 %	60 %	0 %	0 %	229586316
64	NC_012633	AAACT	2	10	100799	100808	60 %	20 %	0 %	20 %	229586318
65	NC_012633	TTAGT	2	10	101150	101159	20 %	60 %	20 %	0 %	229586319
66	NC_012633	TTGAT	2	10	105590	105599	20 %	60 %	20 %	0 %	229586322
67	NC_012633	ATTAT	2	10	105771	105780	40 %	60 %	0 %	0 %	229586322
68	NC_012633	TTGAA	2	10	108387	108396	40 %	40 %	20 %	0 %	229586322
69	NC_012633	TTTGA	2	10	109897	109906	20 %	60 %	20 %	0 %	229586322
70	NC_012633	GCAAA	2	10	111874	111883	60 %	0 %	20 %	20 %	229586323
71	NC_012633	AACTA	2	10	115730	115739	60 %	20 %	0 %	20 %	229586326
72	NC_012633	TTAGT	2	10	116585	116594	20 %	60 %	20 %	0 %	229586327
73	NC_012633	TTGTC	2	10	117715	117724	0 %	60 %	20 %	20 %	229586327
74	NC_012633	ATAAA	2	10	117802	117811	80 %	20 %	0 %	0 %	229586327
75	NC_012633	AAGTA	2	10	118408	118417	60 %	20 %	20 %	0 %	229586328
76	NC_012633	TAAAA	2	10	120532	120541	80 %	20 %	0 %	0 %	229586330
77	NC_012633	AAAAC	2	10	121228	121237	80 %	0 %	0 %	20 %	229586330
78	NC_012633	TTTAA	2	10	121304	121313	40 %	60 %	0 %	0 %	229586330
79	NC_012633	TGAAA	2	10	122754	122763	60 %	20 %	20 %	0 %	229586332
80	NC_012633	CTTGT	2	10	125830	125839	0 %	60 %	20 %	20 %	229586334
81	NC_012633	ATGAT	2	10	126895	126904	40 %	40 %	20 %	0 %	229586335
82	NC_012633	CTTGT	2	10	127233	127242	0 %	60 %	20 %	20 %	229586336
83	NC_012633	TCTTT	2	10	128803	128812	0 %	80 %	0 %	20 %	229586338
84	NC_012633	AACCT	2	10	129840	129849	40 %	20 %	0 %	40 %	229586339
85	NC_012633	AAATC	2	10	130978	130987	60 %	20 %	0 %	20 %	229586341
86	NC_012633	TTAAC	2	10	132115	132124	40 %	40 %	0 %	20 %	229586342
87	NC_012633	TATAA	2	10	132207	132216	60 %	40 %	0 %	0 %	229586342
88	NC_012633	TTATA	2	10	132581	132590	40 %	60 %	0 %	0 %	229586343
89	NC_012633	TTTTA	2	10	134108	134117	20 %	80 %	0 %	0 %	229586344
90	NC_012633	GCTTT	2	10	135684	135693	0 %	60 %	20 %	20 %	229586345
91	NC_012633	TATGT	2	10	136334	136343	20 %	60 %	20 %	0 %	229586345
92	NC_012633	ACAAG	2	10	143170	143179	60 %	0 %	20 %	20 %	229586346
93	NC_012633	AGTTT	2	10	143508	143517	20 %	60 %	20 %	0 %	229586347
94	NC_012633	TTAGT	2	10	144031	144040	20 %	60 %	20 %	0 %	229586347
95	NC_012633	ATATA	2	10	144937	144946	60 %	40 %	0 %	0 %	229586347
96	NC_012633	TGCAG	2	10	145025	145034	20 %	20 %	40 %	20 %	229586347
97	NC_012633	ATGGT	2	10	146605	146614	20 %	40 %	40 %	0 %	229586348
98	NC_012633	AGGAG	2	10	146860	146869	40 %	0 %	60 %	0 %	229586348
99	NC_012633	TATTT	2	10	147536	147545	20 %	80 %	0 %	0 %	229586348
100	NC_012633	AATTT	2	10	154870	154879	40 %	60 %	0 %	0 %	229586352
101	NC_012633	AGGTG	2	10	154976	154985	20 %	20 %	60 %	0 %	229586352
102	NC_012633	AAATT	2	10	162168	162177	60 %	40 %	0 %	0 %	229586360
103	NC_012633	TATCA	2	10	162545	162554	40 %	40 %	0 %	20 %	229586360
104	NC_012633	TAGCT	2	10	162632	162641	20 %	40 %	20 %	20 %	229586360
105	NC_012633	TGTGA	2	10	162827	162836	20 %	40 %	40 %	0 %	229586361
106	NC_012633	TATAT	2	10	162859	162868	40 %	60 %	0 %	0 %	229586361
107	NC_012633	TTATT	2	10	163494	163503	20 %	80 %	0 %	0 %	229586361
108	NC_012633	AATTT	2	10	163915	163924	40 %	60 %	0 %	0 %	229586362
109	NC_012633	ATTTT	2	10	164302	164311	20 %	80 %	0 %	0 %	229586362
110	NC_012633	AGCCG	2	10	164507	164516	20 %	0 %	40 %	40 %	229586362
111	NC_012633	TGGTG	2	10	168550	168559	0 %	40 %	60 %	0 %	229586366
112	NC_012633	TTAAT	2	10	169436	169445	40 %	60 %	0 %	0 %	229586368
113	NC_012633	AAGAA	2	10	171048	171057	80 %	0 %	20 %	0 %	229586368
114	NC_012633	CAGGG	2	10	171705	171714	20 %	0 %	60 %	20 %	229586369
115	NC_012633	ATATC	2	10	172480	172489	40 %	40 %	0 %	20 %	229586370
116	NC_012633	TATAC	2	10	173200	173209	40 %	40 %	0 %	20 %	229586372
117	NC_012633	TGGAT	2	10	173257	173266	20 %	40 %	40 %	0 %	229586372
118	NC_012633	ACATA	2	10	175789	175798	60 %	20 %	0 %	20 %	229586373
119	NC_012633	TAAAA	2	10	176903	176912	80 %	20 %	0 %	0 %	229586375
120	NC_012633	TATAC	2	10	187425	187434	40 %	40 %	0 %	20 %	229586380
121	NC_012633	GTAGA	2	10	187834	187843	40 %	20 %	40 %	0 %	229586380
122	NC_012633	ACTTC	2	10	189237	189246	20 %	40 %	0 %	40 %	229586381
123	NC_012633	CGATA	2	10	191095	191104	40 %	20 %	20 %	20 %	229586382
124	NC_012633	TAAAA	2	10	197030	197039	80 %	20 %	0 %	0 %	229586386
125	NC_012633	TAGCA	2	10	197141	197150	40 %	20 %	20 %	20 %	229586386
126	NC_012633	TAAAG	2	10	198016	198025	60 %	20 %	20 %	0 %	229586387
127	NC_012633	GAATT	2	10	201648	201657	40 %	40 %	20 %	0 %	229586391
128	NC_012633	ATTTT	2	10	204592	204601	20 %	80 %	0 %	0 %	229586394
129	NC_012633	ATATA	2	10	206782	206791	60 %	40 %	0 %	0 %	229586397
130	NC_012633	AATTT	2	10	206792	206801	40 %	60 %	0 %	0 %	229586397
131	NC_012633	AAAAC	2	10	207212	207221	80 %	0 %	0 %	20 %	229586398
132	NC_012633	AAAGT	2	10	207534	207543	60 %	20 %	20 %	0 %	229586398
133	NC_012633	AATAA	2	10	208100	208109	80 %	20 %	0 %	0 %	229586398
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135	NC_012633	GTGCG	2	10	211585	211594	0 %	20 %	60 %	20 %	229586402
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