MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 3778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012633	ATTT	2	8	1359	1366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012633	TTAT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
4	NC_012633	TTAT	2	8	2878	2885	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
5	NC_012633	AACT	2	8	3261	3268	50 %	25 %	0 %	25 %	229586235
6	NC_012633	CAAA	2	8	3307	3314	75 %	0 %	0 %	25 %	229586235
7	NC_012633	TATT	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	229586235
8	NC_012633	TCGC	2	8	3704	3711	0 %	25 %	25 %	50 %	229586235
9	NC_012633	AATA	2	8	5275	5282	75 %	25 %	0 %	0 %	229586235
10	NC_012633	ATTC	2	8	5312	5319	25 %	50 %	0 %	25 %	229586235
11	NC_012633	TTAA	2	8	5444	5451	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
12	NC_012633	ATTT	2	8	6516	6523	25 %	75 %	0 %	0 %	229586237
13	NC_012633	TAAA	2	8	6603	6610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012633	ATAA	2	8	7060	7067	75 %	25 %	0 %	0 %	229586238
15	NC_012633	ACTT	2	8	7443	7450	25 %	50 %	0 %	25 %	229586239
16	NC_012633	ATTT	2	8	7850	7857	25 %	75 %	0 %	0 %	229586239
17	NC_012633	TTAA	2	8	9509	9516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012633	ATGA	2	8	10202	10209	50 %	25 %	25 %	0 %	229586241
19	NC_012633	TAAA	2	8	11225	11232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012633	TAAA	2	8	11390	11397	75 %	25 %	0 %	0 %	229586242
21	NC_012633	TCAT	2	8	11511	11518	25 %	50 %	0 %	25 %	229586242
22	NC_012633	CTTT	2	8	11645	11652	0 %	75 %	0 %	25 %	229586242
23	NC_012633	TTAG	2	8	11887	11894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012633	GCAA	2	8	11986	11993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012633	TCTT	2	8	12063	12070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012633	AGTA	2	8	12321	12328	50 %	25 %	25 %	0 %	229586243
27	NC_012633	TAAG	2	8	12575	12582	50 %	25 %	25 %	0 %	229586243
28	NC_012633	AATT	2	8	13196	13203	50 %	50 %	0 %	0 %	229586244
29	NC_012633	GCTT	2	8	13467	13474	0 %	50 %	25 %	25 %	229586244
30	NC_012633	AATA	2	8	13820	13827	75 %	25 %	0 %	0 %	229586245
31	NC_012633	TCTA	2	8	14287	14294	25 %	50 %	0 %	25 %	229586245
32	NC_012633	ACGT	2	8	14710	14717	25 %	25 %	25 %	25 %	229586245
33	NC_012633	CTTG	2	8	14825	14832	0 %	50 %	25 %	25 %	229586245
34	NC_012633	ATCA	2	8	15759	15766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012633	AAGA	2	8	15842	15849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012633	AGTA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012633	ATTA	2	8	15914	15921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012633	AATA	2	8	15958	15965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012633	CTTT	2	8	16003	16010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012633	TGAA	2	8	16151	16158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012633	TAAA	2	8	16194	16201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012633	AGAT	2	8	16382	16389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012633	TAAA	2	8	16547	16554	75 %	25 %	0 %	0 %	229586246
44	NC_012633	GATA	2	8	16628	16635	50 %	25 %	25 %	0 %	229586246
45	NC_012633	AGCA	2	8	16696	16703	50 %	0 %	25 %	25 %	229586246
46	NC_012633	AGTA	2	8	16961	16968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012633	AAAC	2	8	17011	17018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012633	TAAA	2	8	17086	17093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012633	TTAT	2	8	17284	17291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012633	GTAA	2	8	18205	18212	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
51	NC_012633	AGAT	2	8	18459	18466	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
52	NC_012633	AGCA	2	8	18578	18585	50 %	0 %	25 %	25 %	229586247
53	NC_012633	AAAT	2	8	18621	18628	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
54	NC_012633	AATG	2	8	18822	18829	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
55	NC_012633	ATTA	2	8	19105	19112	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
56	NC_012633	ATAG	2	8	19153	19160	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
57	NC_012633	ATAG	2	8	19165	19172	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
58	NC_012633	CGTT	2	8	19574	19581	0 %	50 %	25 %	25 %	229586247
59	NC_012633	CAAA	2	8	19891	19898	75 %	0 %	0 %	25 %	229586247
60	NC_012633	TAGT	2	8	20021	20028	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
61	NC_012633	AGTT	2	8	20121	20128	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
62	NC_012633	GTTA	2	8	20566	20573	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
63	NC_012633	TAAA	2	8	21116	21123	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
64	NC_012633	AAGT	2	8	21662	21669	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
65	NC_012633	TTCA	2	8	22220	22227	25 %	50 %	0 %	25 %	229586247
66	NC_012633	AATA	2	8	22713	22720	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
67	NC_012633	TAAA	2	8	22859	22866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
68	NC_012633	ACTA	2	8	22995	23002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012633	TTAT	2	8	23709	23716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012633	AGCA	2	8	23784	23791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012633	AAGT	2	8	24237	24244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012633	TAAT	2	8	24615	24622	50 %	50 %	0 %	0 %	229586249
73	NC_012633	AAGA	2	8	24767	24774	75 %	0 %	25 %	0 %	229586249
74	NC_012633	AAAT	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586249
75	NC_012633	ATTA	2	8	24888	24895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012633	TCTT	2	8	25471	25478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012633	TAAA	2	8	25736	25743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012633	GATA	2	8	25824	25831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012633	TAAA	2	8	26067	26074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012633	GCTA	2	8	26077	26084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012633	TCTA	2	8	26826	26833	25 %	50 %	0 %	25 %	229586251
82	NC_012633	ATTT	2	8	26870	26877	25 %	75 %	0 %	0 %	229586251
83	NC_012633	TGTC	2	8	26934	26941	0 %	50 %	25 %	25 %	229586251
84	NC_012633	TAAT	2	8	27324	27331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012633	ATAC	2	8	27531	27538	50 %	25 %	0 %	25 %	229586253
86	NC_012633	ATAA	2	8	27955	27962	75 %	25 %	0 %	0 %	229586253
87	NC_012633	CACT	2	8	28049	28056	25 %	25 %	0 %	50 %	229586253
88	NC_012633	TATT	2	8	28873	28880	25 %	75 %	0 %	0 %	229586255
89	NC_012633	AATT	2	8	30507	30514	50 %	50 %	0 %	0 %	229586257
90	NC_012633	TACC	2	8	30597	30604	25 %	25 %	0 %	50 %	229586257
91	NC_012633	GTTA	2	8	30979	30986	25 %	50 %	25 %	0 %	229586257
92	NC_012633	AAAC	2	8	32399	32406	75 %	0 %	0 %	25 %	229586258
93	NC_012633	TTAG	2	8	32575	32582	25 %	50 %	25 %	0 %	229586258
94	NC_012633	TTGC	2	8	32870	32877	0 %	50 %	25 %	25 %	229586258
95	NC_012633	ACTA	2	8	33024	33031	50 %	25 %	0 %	25 %	229586258
96	NC_012633	TTCC	2	8	33110	33117	0 %	50 %	0 %	50 %	229586258
97	NC_012633	TGTT	2	8	33578	33585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012633	TTGT	2	8	34181	34188	0 %	75 %	25 %	0 %	229586259
99	NC_012633	TATT	2	8	34260	34267	25 %	75 %	0 %	0 %	229586259
100	NC_012633	GTAA	2	8	34271	34278	50 %	25 %	25 %	0 %	229586259
101	NC_012633	AATG	2	8	35045	35052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012633	GCTT	2	8	35833	35840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012633	ATAA	2	8	36059	36066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012633	AACA	2	8	36156	36163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012633	CTGA	2	8	38126	38133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012633	ATTG	2	8	38296	38303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012633	TAAA	2	8	38453	38460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012633	ATTT	2	8	38560	38567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012633	ATTA	2	8	38784	38791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012633	TGCT	2	8	38907	38914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012633	ATTA	2	8	39445	39452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012633	TAAT	2	8	39740	39747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012633	TAAT	2	8	39800	39807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012633	ATTA	2	8	39810	39817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012633	GAAA	2	8	40116	40123	75 %	0 %	25 %	0 %	229586262
116	NC_012633	ATTT	2	8	40160	40167	25 %	75 %	0 %	0 %	229586262
117	NC_012633	ACAA	2	8	40427	40434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012633	AAAT	2	8	40631	40638	75 %	25 %	0 %	0 %	229586263
119	NC_012633	TACC	2	8	41985	41992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012633	AAAC	2	8	41993	42000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012633	ATGA	2	8	42268	42275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012633	TAAC	2	8	42458	42465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012633	ATTC	2	8	42889	42896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012633	ATGT	2	8	43238	43245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012633	ATTT	2	8	43396	43403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012633	TTAC	2	8	43475	43482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012633	ATCA	2	8	44152	44159	50 %	25 %	0 %	25 %	229586265
128	NC_012633	TGCC	2	8	44462	44469	0 %	25 %	25 %	50 %	229586265
129	NC_012633	TATC	2	8	45021	45028	25 %	50 %	0 %	25 %	229586265
130	NC_012633	TTAA	2	8	45044	45051	50 %	50 %	0 %	0 %	229586265
131	NC_012633	TACT	2	8	45746	45753	25 %	50 %	0 %	25 %	229586267
132	NC_012633	AGTA	2	8	46166	46173	50 %	25 %	25 %	0 %	229586267
133	NC_012633	ATAC	2	8	46384	46391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012633	TTGC	2	8	46529	46536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012633	TGTT	2	8	46900	46907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012633	AAGT	2	8	46937	46944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012633	CTTG	2	8	47414	47421	0 %	50 %	25 %	25 %	229586268
138	NC_012633	ATCT	2	8	47991	47998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012633	TTTA	2	8	48578	48585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012633	TCAC	2	8	48687	48694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012633	TAAA	2	8	48727	48734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012633	ATTA	2	8	49842	49849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012633	TAAA	2	8	50067	50074	75 %	25 %	0 %	0 %	229586269
144	NC_012633	GAGG	2	8	50093	50100	25 %	0 %	75 %	0 %	229586269
145	NC_012633	ATTG	2	8	50476	50483	25 %	50 %	25 %	0 %	229586269
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147	NC_012633	TGCT	2	8	50772	50779	0 %	50 %	25 %	25 %	229586269
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