MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 2678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	TTAT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
2	NC_012633	TTAT	2	8	2878	2885	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
3	NC_012633	AACT	2	8	3261	3268	50 %	25 %	0 %	25 %	229586235
4	NC_012633	CAAA	2	8	3307	3314	75 %	0 %	0 %	25 %	229586235
5	NC_012633	TATT	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	229586235
6	NC_012633	TCGC	2	8	3704	3711	0 %	25 %	25 %	50 %	229586235
7	NC_012633	AATA	2	8	5275	5282	75 %	25 %	0 %	0 %	229586235
8	NC_012633	ATTC	2	8	5312	5319	25 %	50 %	0 %	25 %	229586235
9	NC_012633	TTAA	2	8	5444	5451	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
10	NC_012633	ATTT	2	8	6516	6523	25 %	75 %	0 %	0 %	229586237
11	NC_012633	ATAA	2	8	7060	7067	75 %	25 %	0 %	0 %	229586238
12	NC_012633	ACTT	2	8	7443	7450	25 %	50 %	0 %	25 %	229586239
13	NC_012633	ATTT	2	8	7850	7857	25 %	75 %	0 %	0 %	229586239
14	NC_012633	ATGA	2	8	10202	10209	50 %	25 %	25 %	0 %	229586241
15	NC_012633	TAAA	2	8	11390	11397	75 %	25 %	0 %	0 %	229586242
16	NC_012633	TCAT	2	8	11511	11518	25 %	50 %	0 %	25 %	229586242
17	NC_012633	CTTT	2	8	11645	11652	0 %	75 %	0 %	25 %	229586242
18	NC_012633	AGTA	2	8	12321	12328	50 %	25 %	25 %	0 %	229586243
19	NC_012633	TAAG	2	8	12575	12582	50 %	25 %	25 %	0 %	229586243
20	NC_012633	AATT	2	8	13196	13203	50 %	50 %	0 %	0 %	229586244
21	NC_012633	GCTT	2	8	13467	13474	0 %	50 %	25 %	25 %	229586244
22	NC_012633	AATA	2	8	13820	13827	75 %	25 %	0 %	0 %	229586245
23	NC_012633	TCTA	2	8	14287	14294	25 %	50 %	0 %	25 %	229586245
24	NC_012633	ACGT	2	8	14710	14717	25 %	25 %	25 %	25 %	229586245
25	NC_012633	CTTG	2	8	14825	14832	0 %	50 %	25 %	25 %	229586245
26	NC_012633	TAAA	2	8	16547	16554	75 %	25 %	0 %	0 %	229586246
27	NC_012633	GATA	2	8	16628	16635	50 %	25 %	25 %	0 %	229586246
28	NC_012633	AGCA	2	8	16696	16703	50 %	0 %	25 %	25 %	229586246
29	NC_012633	GTAA	2	8	18205	18212	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
30	NC_012633	AGAT	2	8	18459	18466	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
31	NC_012633	AGCA	2	8	18578	18585	50 %	0 %	25 %	25 %	229586247
32	NC_012633	AAAT	2	8	18621	18628	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
33	NC_012633	AATG	2	8	18822	18829	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
34	NC_012633	ATTA	2	8	19105	19112	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
35	NC_012633	ATAG	2	8	19153	19160	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
36	NC_012633	ATAG	2	8	19165	19172	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
37	NC_012633	CGTT	2	8	19574	19581	0 %	50 %	25 %	25 %	229586247
38	NC_012633	CAAA	2	8	19891	19898	75 %	0 %	0 %	25 %	229586247
39	NC_012633	TAGT	2	8	20021	20028	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
40	NC_012633	AGTT	2	8	20121	20128	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
41	NC_012633	GTTA	2	8	20566	20573	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
42	NC_012633	TAAA	2	8	21116	21123	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
43	NC_012633	AAGT	2	8	21662	21669	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
44	NC_012633	TTCA	2	8	22220	22227	25 %	50 %	0 %	25 %	229586247
45	NC_012633	AATA	2	8	22713	22720	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
46	NC_012633	TAAA	2	8	22859	22866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
47	NC_012633	TAAT	2	8	24615	24622	50 %	50 %	0 %	0 %	229586249
48	NC_012633	AAGA	2	8	24767	24774	75 %	0 %	25 %	0 %	229586249
49	NC_012633	AAAT	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586249
50	NC_012633	TCTA	2	8	26826	26833	25 %	50 %	0 %	25 %	229586251
51	NC_012633	ATTT	2	8	26870	26877	25 %	75 %	0 %	0 %	229586251
52	NC_012633	TGTC	2	8	26934	26941	0 %	50 %	25 %	25 %	229586251
53	NC_012633	ATAC	2	8	27531	27538	50 %	25 %	0 %	25 %	229586253
54	NC_012633	ATAA	2	8	27955	27962	75 %	25 %	0 %	0 %	229586253
55	NC_012633	CACT	2	8	28049	28056	25 %	25 %	0 %	50 %	229586253
56	NC_012633	TATT	2	8	28873	28880	25 %	75 %	0 %	0 %	229586255
57	NC_012633	AATT	2	8	30507	30514	50 %	50 %	0 %	0 %	229586257
58	NC_012633	TACC	2	8	30597	30604	25 %	25 %	0 %	50 %	229586257
59	NC_012633	GTTA	2	8	30979	30986	25 %	50 %	25 %	0 %	229586257
60	NC_012633	AAAC	2	8	32399	32406	75 %	0 %	0 %	25 %	229586258
61	NC_012633	TTAG	2	8	32575	32582	25 %	50 %	25 %	0 %	229586258
62	NC_012633	TTGC	2	8	32870	32877	0 %	50 %	25 %	25 %	229586258
63	NC_012633	ACTA	2	8	33024	33031	50 %	25 %	0 %	25 %	229586258
64	NC_012633	TTCC	2	8	33110	33117	0 %	50 %	0 %	50 %	229586258
65	NC_012633	TTGT	2	8	34181	34188	0 %	75 %	25 %	0 %	229586259
66	NC_012633	TATT	2	8	34260	34267	25 %	75 %	0 %	0 %	229586259
67	NC_012633	GTAA	2	8	34271	34278	50 %	25 %	25 %	0 %	229586259
68	NC_012633	GAAA	2	8	40116	40123	75 %	0 %	25 %	0 %	229586262
69	NC_012633	ATTT	2	8	40160	40167	25 %	75 %	0 %	0 %	229586262
70	NC_012633	AAAT	2	8	40631	40638	75 %	25 %	0 %	0 %	229586263
71	NC_012633	ATCA	2	8	44152	44159	50 %	25 %	0 %	25 %	229586265
72	NC_012633	TGCC	2	8	44462	44469	0 %	25 %	25 %	50 %	229586265
73	NC_012633	TATC	2	8	45021	45028	25 %	50 %	0 %	25 %	229586265
74	NC_012633	TTAA	2	8	45044	45051	50 %	50 %	0 %	0 %	229586265
75	NC_012633	TACT	2	8	45746	45753	25 %	50 %	0 %	25 %	229586267
76	NC_012633	AGTA	2	8	46166	46173	50 %	25 %	25 %	0 %	229586267
77	NC_012633	CTTG	2	8	47414	47421	0 %	50 %	25 %	25 %	229586268
78	NC_012633	TAAA	2	8	50067	50074	75 %	25 %	0 %	0 %	229586269
79	NC_012633	GAGG	2	8	50093	50100	25 %	0 %	75 %	0 %	229586269
80	NC_012633	ATTG	2	8	50476	50483	25 %	50 %	25 %	0 %	229586269
81	NC_012633	TTAT	2	8	50690	50697	25 %	75 %	0 %	0 %	229586269
82	NC_012633	TGCT	2	8	50772	50779	0 %	50 %	25 %	25 %	229586269
83	NC_012633	GTGA	2	8	50879	50886	25 %	25 %	50 %	0 %	229586269
84	NC_012633	CCGC	2	8	51646	51653	0 %	0 %	25 %	75 %	229586269
85	NC_012633	GTTC	2	8	51657	51664	0 %	50 %	25 %	25 %	229586269
86	NC_012633	GACC	2	8	51675	51682	25 %	0 %	25 %	50 %	229586269
87	NC_012633	AAAT	2	8	52395	52402	75 %	25 %	0 %	0 %	229586269
88	NC_012633	CCGT	2	8	52823	52830	0 %	25 %	25 %	50 %	229586270
89	NC_012633	ATAA	2	8	53375	53382	75 %	25 %	0 %	0 %	229586271
90	NC_012633	ATTA	2	8	53666	53673	50 %	50 %	0 %	0 %	229586271
91	NC_012633	CTTT	2	8	54075	54082	0 %	75 %	0 %	25 %	229586271
92	NC_012633	TACT	2	8	54585	54592	25 %	50 %	0 %	25 %	229586272
93	NC_012633	TTGC	2	8	55044	55051	0 %	50 %	25 %	25 %	229586272
94	NC_012633	ATAA	2	8	55076	55083	75 %	25 %	0 %	0 %	229586272
95	NC_012633	ATAA	2	8	55130	55137	75 %	25 %	0 %	0 %	229586272
96	NC_012633	CATC	2	8	55267	55274	25 %	25 %	0 %	50 %	229586272
97	NC_012633	ATTT	3	12	55443	55454	25 %	75 %	0 %	0 %	229586272
98	NC_012633	TTTA	2	8	55793	55800	25 %	75 %	0 %	0 %	229586273
99	NC_012633	AACG	2	8	55815	55822	50 %	0 %	25 %	25 %	229586273
100	NC_012633	GTTT	2	8	56575	56582	0 %	75 %	25 %	0 %	229586274
101	NC_012633	AGAA	2	8	56827	56834	75 %	0 %	25 %	0 %	229586274
102	NC_012633	AAAG	2	8	57207	57214	75 %	0 %	25 %	0 %	229586275
103	NC_012633	TAAA	2	8	57274	57281	75 %	25 %	0 %	0 %	229586275
104	NC_012633	AAGA	2	8	58392	58399	75 %	0 %	25 %	0 %	229586277
105	NC_012633	TAAT	2	8	59043	59050	50 %	50 %	0 %	0 %	229586277
106	NC_012633	ATTA	2	8	59119	59126	50 %	50 %	0 %	0 %	229586277
107	NC_012633	GAAT	2	8	59941	59948	50 %	25 %	25 %	0 %	229586278
108	NC_012633	CAAG	2	8	60172	60179	50 %	0 %	25 %	25 %	229586278
109	NC_012633	ATGG	2	8	60495	60502	25 %	25 %	50 %	0 %	229586278
110	NC_012633	AAGA	2	8	60780	60787	75 %	0 %	25 %	0 %	229586278
111	NC_012633	GAAA	2	8	60866	60873	75 %	0 %	25 %	0 %	229586278
112	NC_012633	TTAA	2	8	62649	62656	50 %	50 %	0 %	0 %	229586280
113	NC_012633	GGAA	2	8	62705	62712	50 %	0 %	50 %	0 %	229586280
114	NC_012633	GCAT	2	8	62757	62764	25 %	25 %	25 %	25 %	229586280
115	NC_012633	TGCT	2	8	62984	62991	0 %	50 %	25 %	25 %	229586280
116	NC_012633	AATT	2	8	63832	63839	50 %	50 %	0 %	0 %	229586282
117	NC_012633	TGTT	2	8	64092	64099	0 %	75 %	25 %	0 %	229586282
118	NC_012633	TGAT	2	8	64641	64648	25 %	50 %	25 %	0 %	229586282
119	NC_012633	AATT	2	8	65022	65029	50 %	50 %	0 %	0 %	229586282
120	NC_012633	AAAC	2	8	65596	65603	75 %	0 %	0 %	25 %	229586283
121	NC_012633	TGTT	2	8	66109	66116	0 %	75 %	25 %	0 %	229586284
122	NC_012633	TTAT	2	8	66242	66249	25 %	75 %	0 %	0 %	229586284
123	NC_012633	AACT	2	8	66631	66638	50 %	25 %	0 %	25 %	229586284
124	NC_012633	GAAT	2	8	67402	67409	50 %	25 %	25 %	0 %	229586285
125	NC_012633	TAAT	2	8	67417	67424	50 %	50 %	0 %	0 %	229586285
126	NC_012633	TAGT	2	8	67783	67790	25 %	50 %	25 %	0 %	229586285
127	NC_012633	ATTT	2	8	67873	67880	25 %	75 %	0 %	0 %	229586285
128	NC_012633	TATT	2	8	67935	67942	25 %	75 %	0 %	0 %	229586285
129	NC_012633	CTTG	2	8	68354	68361	0 %	50 %	25 %	25 %	229586285
130	NC_012633	TGTA	2	8	68743	68750	25 %	50 %	25 %	0 %	229586285
131	NC_012633	TAAT	2	8	69080	69087	50 %	50 %	0 %	0 %	229586285
132	NC_012633	TTAG	2	8	69395	69402	25 %	50 %	25 %	0 %	229586286
133	NC_012633	AAGT	2	8	69750	69757	50 %	25 %	25 %	0 %	229586287
134	NC_012633	ATTT	2	8	70372	70379	25 %	75 %	0 %	0 %	229586289
135	NC_012633	AGAT	2	8	70451	70458	50 %	25 %	25 %	0 %	229586289
136	NC_012633	CAAT	2	8	71083	71090	50 %	25 %	0 %	25 %	229586290
137	NC_012633	TGAT	2	8	72132	72139	25 %	50 %	25 %	0 %	229586291
138	NC_012633	TAAG	2	8	72171	72178	50 %	25 %	25 %	0 %	229586291
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