MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 19874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
2	NC_012633	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
3	NC_012633	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
4	NC_012633	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586231
5	NC_012633	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
6	NC_012633	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
7	NC_012633	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586231
8	NC_012633	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
9	NC_012633	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586231
10	NC_012633	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
11	NC_012633	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
12	NC_012633	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012633	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012633	ATA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586232
15	NC_012633	TGA	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586232
16	NC_012633	GTA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586232
17	NC_012633	CAA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586232
18	NC_012633	TAA	2	6	1342	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586232
19	NC_012633	TCT	2	6	1462	1467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586233
20	NC_012633	ATA	3	9	1726	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586233
21	NC_012633	GTA	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586233
22	NC_012633	TGA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586233
23	NC_012633	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586233
24	NC_012633	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586233
25	NC_012633	AAG	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586233
26	NC_012633	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586233
27	NC_012633	CAA	3	9	2097	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586233
28	NC_012633	CGG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586234
29	NC_012633	ATA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
30	NC_012633	ATA	2	6	2532	2537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
31	NC_012633	TAA	2	6	2563	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
32	NC_012633	ATG	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586234
33	NC_012633	TAT	2	6	2813	2818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586234
34	NC_012633	TTA	2	6	2827	2832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586234
35	NC_012633	CTC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586235
36	NC_012633	ATT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
37	NC_012633	ATT	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
38	NC_012633	ATT	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
39	NC_012633	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
40	NC_012633	AGA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
41	NC_012633	AGC	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
42	NC_012633	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
43	NC_012633	ATT	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
44	NC_012633	GAG	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
45	NC_012633	TAT	2	6	3805	3810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
46	NC_012633	GCA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
47	NC_012633	AGA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
48	NC_012633	CTA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586235
49	NC_012633	TAT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
50	NC_012633	TTA	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
51	NC_012633	TGT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586235
52	NC_012633	ATA	2	6	4302	4307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
53	NC_012633	GGC	2	6	4553	4558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586235
54	NC_012633	GCA	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
55	NC_012633	GGA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
56	NC_012633	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
57	NC_012633	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
58	NC_012633	AAT	2	6	4718	4723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
59	NC_012633	GAA	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
60	NC_012633	TAA	2	6	4744	4749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
61	NC_012633	GAG	2	6	4817	4822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
62	NC_012633	TAG	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
63	NC_012633	AAG	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
64	NC_012633	ACG	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
65	NC_012633	ATA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
66	NC_012633	ATT	2	6	5247	5252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
67	NC_012633	TAA	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
68	NC_012633	GAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
69	NC_012633	TGC	2	6	5326	5331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
70	NC_012633	ATT	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
71	NC_012633	TGC	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
72	NC_012633	CTA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586235
73	NC_012633	AGT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
74	NC_012633	CGC	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586235
75	NC_012633	TTG	2	6	5577	5582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586235
76	NC_012633	TTA	2	6	5606	5611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
77	NC_012633	ATA	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
78	NC_012633	TAA	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
79	NC_012633	ATA	2	6	5720	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
80	NC_012633	GAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
81	NC_012633	ATA	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
82	NC_012633	ATG	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
83	NC_012633	GTT	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012633	CTT	2	6	6061	6066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586236
85	NC_012633	TCA	2	6	6079	6084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586236
86	NC_012633	ATA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586236
87	NC_012633	TAA	2	6	6132	6137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586236
88	NC_012633	GAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586236
89	NC_012633	AAC	3	9	6222	6230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586236
90	NC_012633	CAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586236
91	NC_012633	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586237
92	NC_012633	TTC	2	6	6324	6329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586237
93	NC_012633	TAA	2	6	6378	6383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586237
94	NC_012633	CTT	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586237
95	NC_012633	GTT	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586237
96	NC_012633	TCC	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586237
97	NC_012633	CTA	3	9	6637	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586238
98	NC_012633	ATT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586238
99	NC_012633	TTC	2	6	6750	6755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586238
100	NC_012633	ATC	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586238
101	NC_012633	CCG	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586238
102	NC_012633	ATT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586238
103	NC_012633	TAC	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586238
104	NC_012633	ATT	2	6	7017	7022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586238
105	NC_012633	ATT	3	9	7068	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586238
106	NC_012633	TCA	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586238
107	NC_012633	CCT	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586238
108	NC_012633	TAT	2	6	7142	7147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586238
109	NC_012633	TAC	2	6	7266	7271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586238
110	NC_012633	GTA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586238
111	NC_012633	CTT	2	6	7599	7604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586239
112	NC_012633	TAG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586239
113	NC_012633	CAG	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586239
114	NC_012633	CTA	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586239
115	NC_012633	TCT	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012633	AAT	2	6	7906	7911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012633	GCT	2	6	7988	7993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012633	GAC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012633	CAA	3	9	8019	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012633	ATA	3	9	8090	8098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586240
121	NC_012633	ATA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586240
122	NC_012633	GCC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586240
123	NC_012633	ATA	2	6	8300	8305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586240
124	NC_012633	TAG	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586240
125	NC_012633	ATT	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586240
126	NC_012633	ACG	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586240
127	NC_012633	TCG	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586240
128	NC_012633	TGT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586240
129	NC_012633	CTC	2	6	8607	8612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586240
130	NC_012633	TAT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586240
131	NC_012633	TAA	2	6	8655	8660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586240
132	NC_012633	CAA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586240
133	NC_012633	ATT	2	6	8741	8746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586240
134	NC_012633	TAA	2	6	8824	8829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586240
135	NC_012633	AGC	3	9	8878	8886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586240
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139	NC_012633	CAA	2	6	9144	9149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012633	ATG	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012633	ATA	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012633	TTC	2	6	9280	9285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_012633	TTA	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_012633	TTC	2	6	9970	9975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586241
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263	NC_012633	GAT	2	6	18231	18236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
264	NC_012633	TAA	2	6	18615	18620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
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