MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 5410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012633	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012633	GTT	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012633	TCT	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012633	AAT	2	6	7906	7911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012633	GCT	2	6	7988	7993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012633	GAC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012633	CAA	3	9	8019	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012633	TAT	2	6	9137	9142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012633	CAA	2	6	9144	9149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012633	ATG	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012633	ATA	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012633	TTC	2	6	9280	9285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012633	CAA	2	6	9311	9316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012633	AAG	2	6	9386	9391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012633	TTA	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012633	GTG	2	6	9594	9599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012633	TCG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012633	TTA	2	6	9813	9818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012633	AAT	2	6	11077	11082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012633	TAG	2	6	11102	11107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012633	TCT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012633	CAA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012633	TAA	2	6	11899	11904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012633	GTT	2	6	11920	11925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012633	GAA	2	6	11938	11943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012633	ATG	2	6	12084	12089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012633	TTG	2	6	15020	15025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012633	ATA	2	6	15082	15087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012633	TTA	2	6	15284	15289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012633	TTA	2	6	15294	15299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012633	TTA	2	6	15368	15373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012633	TAT	2	6	15407	15412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012633	CAG	2	6	15713	15718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012633	GGC	2	6	15738	15743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012633	TAT	3	9	15750	15758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012633	ATG	2	6	15936	15941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012633	AAG	2	6	15948	15953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012633	CAA	2	6	16054	16059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012633	ATA	2	6	16063	16068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012633	ATA	2	6	16123	16128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012633	ATA	2	6	16185	16190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012633	GCA	2	6	16206	16211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012633	TAA	2	6	16213	16218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012633	GCT	2	6	16230	16235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012633	AAT	2	6	16324	16329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012633	TAA	2	6	16340	16345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012633	GTA	2	6	16353	16358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012633	ATC	2	6	16368	16373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012633	ATT	2	6	16443	16448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012633	TAC	2	6	16812	16817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012633	TCC	2	6	16821	16826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012633	TGA	2	6	16871	16876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012633	AAT	2	6	16950	16955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012633	TTG	2	6	17036	17041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012633	AAT	2	6	17076	17081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012633	ATT	2	6	17118	17123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012633	AAT	2	6	17213	17218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012633	ACC	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012633	AAT	2	6	23129	23134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012633	CAC	2	6	23148	23153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012633	TAC	2	6	23365	23370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012633	AAC	2	6	23703	23708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012633	TAA	2	6	23754	23759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012633	TTA	2	6	23773	23778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012633	CTT	2	6	23832	23837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012633	AAT	2	6	23911	23916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012633	AAG	2	6	23999	24004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012633	AGT	2	6	24046	24051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012633	TAA	2	6	24111	24116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012633	TAA	2	6	24132	24137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012633	GAT	2	6	24203	24208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012633	GAT	2	6	24912	24917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012633	TAC	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012633	ATT	2	6	24944	24949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012633	GAA	2	6	25031	25036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012633	GAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012633	GAT	2	6	25242	25247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012633	GTA	2	6	25313	25318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012633	ATG	2	6	25329	25334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012633	TTA	2	6	25384	25389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012633	GAA	2	6	25415	25420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012633	TAA	2	6	25495	25500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012633	ATA	2	6	25526	25531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012633	TAT	2	6	25670	25675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012633	AAC	2	6	25842	25847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012633	ATG	2	6	26052	26057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012633	TAA	2	6	27383	27388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012633	CGA	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012633	TTA	2	6	29460	29465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012633	TAA	2	6	29521	29526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012633	ATA	2	6	29553	29558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012633	GGA	2	6	29595	29600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012633	GTC	2	6	30161	30166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012633	CTC	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_012633	ACT	2	6	30312	30317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012633	CAA	2	6	30344	30349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012633	TAA	2	6	32066	32071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012633	ATA	3	9	32106	32114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012633	AAG	2	6	32151	32156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012633	GTT	2	6	32247	32252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012633	ATT	2	6	32393	32398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012633	AAT	2	6	33499	33504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012633	ATT	2	6	33511	33516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012633	TAG	2	6	33551	33556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012633	ATT	2	6	33599	33604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012633	TTC	2	6	33901	33906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012633	TTC	3	9	33913	33921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012633	ATA	2	6	34016	34021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012633	GAT	2	6	34086	34091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012633	AAT	2	6	34709	34714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012633	TAT	2	6	34749	34754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012633	TAA	2	6	35058	35063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012633	ATC	2	6	35101	35106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012633	ATT	2	6	35110	35115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012633	ATT	2	6	35242	35247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012633	TTC	2	6	35260	35265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012633	TAA	2	6	35274	35279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012633	TCT	2	6	35367	35372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012633	TCC	2	6	35387	35392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012633	TTG	2	6	35508	35513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012633	ATT	2	6	35519	35524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012633	ATT	2	6	35639	35644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012633	GTT	2	6	35710	35715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012633	CAC	2	6	35775	35780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012633	TTA	2	6	35899	35904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012633	TAT	2	6	36174	36179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012633	GAG	2	6	36198	36203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012633	GTG	2	6	36244	36249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012633	TTA	2	6	36285	36290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012633	ATA	2	6	36342	36347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012633	CAC	2	6	37110	37115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012633	ATT	2	6	37460	37465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012633	TTC	2	6	37489	37494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012633	ATT	2	6	37607	37612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012633	TAA	2	6	37674	37679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012633	CTT	2	6	37691	37696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012633	AGT	2	6	37713	37718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012633	AGC	2	6	37809	37814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012633	TTG	2	6	37850	37855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012633	TTG	2	6	37881	37886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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