MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012632	TACAAA	2	12	5740	5751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012632	TGGTAT	2	12	17805	17816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012632	TAATAC	2	12	27112	27123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012632	CTTTTC	2	12	32719	32730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012632	TATTTA	2	12	38248	38259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012632	TCTAGT	2	12	48118	48129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012632	AATAAA	2	12	72035	72046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012632	AGTTAA	2	12	90797	90808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012632	TTATCA	2	12	115429	115440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012632	GTATGA	2	12	115484	115495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012632	AAAATA	2	12	129332	129343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012632	AATATT	2	12	174082	174093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012632	GTAAGC	2	12	224626	224637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012632	TTACAT	2	12	226801	226812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012632	ACTTAT	2	12	287083	287094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012632	AATAGA	2	12	307802	307813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012632	CCAATT	2	12	308001	308012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012632	CTCATT	2	12	312268	312279	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012632	CTCTTT	2	12	316920	316931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012632	CCAAAT	2	12	317868	317879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012632	GTAATA	2	12	318385	318396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012632	AAGGAG	2	12	320345	320356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012632	AAATTT	2	12	323234	323245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012632	AAAAGA	2	12	335204	335215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012632	AAAAAT	2	12	340695	340706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012632	TTTTAA	2	12	340874	340885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012632	CCGTTC	2	12	346675	346686	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012632	ATTTTT	2	12	346964	346975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012632	ATATTT	2	12	365437	365448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012632	CAAAGA	2	12	383822	383833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012632	CCAGAT	2	12	384128	384139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012632	ACTAAA	2	12	407352	407363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012632	TTCAAT	2	12	410343	410354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012632	AAGAGG	2	12	412524	412535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012632	ACTCAT	2	12	415075	415086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012632	TATGAT	2	12	417718	417729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012632	CCTCTT	2	12	422794	422805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012632	TTTAAG	2	12	424525	424536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012632	ATTTAT	2	12	426793	426804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012632	CTTAAC	2	12	448908	448919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012632	ATAAAT	2	12	449302	449313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012632	GTTATG	2	12	459417	459428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012632	ACGTTA	2	12	461232	461243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012632	TAAAGC	2	12	462945	462956	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012632	CTCATA	2	12	483254	483265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012632	AAATTT	2	12	490246	490257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012632	AATTTT	2	12	500191	500202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012632	AATATT	2	12	511665	511676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012632	AAGAGG	2	12	512359	512370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012632	AGGGGT	2	12	519558	519569	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012632	TAGGGA	2	12	527320	527331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012632	GTATGA	2	12	559820	559831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012632	TTTTGG	2	12	564696	564707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012632	CTCATA	2	12	593007	593018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012632	TTTATA	2	12	607889	607900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012632	CAAGAA	2	12	612744	612755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012632	TTATAT	2	12	613902	613913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012632	AATTTT	2	12	625232	625243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012632	ACTTTC	2	12	634752	634763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012632	TTGGAA	2	12	641116	641127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012632	TACATC	2	12	706627	706638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012632	ATTAAC	2	12	710209	710220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012632	GAATTG	2	12	716412	716423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012632	ATAATT	2	12	716469	716480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012632	CCTCTT	2	12	723403	723414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012632	ATGAAA	2	12	740347	740358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012632	TAAATA	2	12	750301	750312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012632	AATTTA	2	12	755752	755763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012632	TTAGTT	2	12	765935	765946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012632	AAAATA	2	12	783163	783174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012632	TTCTTT	2	12	796379	796390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012632	TTTTGA	2	12	807119	807130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012632	TAGGAC	2	12	808412	808423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012632	GTATGA	2	12	827846	827857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012632	CCTCTT	2	12	839517	839528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012632	CCTCTT	2	12	842252	842263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012632	TTAGAT	2	12	843291	843302	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012632	TTAAAA	2	12	852043	852054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012632	ATAGTA	2	12	854336	854347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012632	AACTAA	2	12	861527	861538	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012632	TAATGA	2	12	872643	872654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012632	AAATTT	2	12	882215	882226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012632	GTTATA	2	12	884755	884766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012632	AAGAGG	2	12	896581	896592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012632	TTTAAG	2	12	896888	896899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012632	CCTCTT	2	12	905381	905392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012632	TCCCTA	2	12	906126	906137	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012632	TTTCAT	2	12	915019	915030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012632	ATAAAA	2	12	933397	933408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012632	TAGATT	2	12	935604	935615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012632	GATAAT	2	12	947288	947299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012632	TCACTT	2	12	947650	947661	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012632	GAAAGA	2	12	949542	949553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012632	AGTTGA	2	12	950137	950148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012632	AAAGTA	2	12	961876	961887	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012632	TAAAAT	2	12	979654	979665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012632	TAGGAC	2	12	980912	980923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012632	AAAATA	2	12	990530	990541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012632	ATATAA	2	12	996842	996853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012632	ATTAAC	2	12	1007326	1007337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012632	CCTCTT	2	12	1014919	1014930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012632	AGTCCT	2	12	1016562	1016573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012632	ATATTA	2	12	1019060	1019071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012632	CCTCTT	2	12	1023215	1023226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012632	CCTCTT	2	12	1024866	1024877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012632	AAACAT	2	12	1036713	1036724	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012632	TAGGGA	2	12	1037726	1037737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012632	TTTACT	2	12	1039784	1039795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012632	AATAAA	2	12	1041369	1041380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012632	ATCAAA	2	12	1043714	1043725	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012632	ACGACA	2	12	1056522	1056533	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012632	CTCATA	2	12	1057355	1057366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012632	AAAGAA	2	12	1058818	1058829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012632	GAAGTT	2	12	1124051	1124062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012632	AAAACA	2	12	1136221	1136232	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012632	AAAGTA	2	12	1208956	1208967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012632	TAGCTT	2	12	1241710	1241721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_012632	TAAAGA	2	12	1261410	1261421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012632	ACTCTT	2	12	1271956	1271967	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012632	ATAAAA	2	12	1450089	1450100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012632	TTATAT	2	12	1453813	1453824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012632	AAGATA	2	12	1466935	1466946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012632	GAAAAT	2	12	1467608	1467619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012632	GAAAAA	2	12	1468157	1468168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012632	TCATAA	2	12	1495146	1495157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012632	CTCATA	2	12	1515765	1515776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012632	AAGGTA	2	12	1557141	1557152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012632	ATATGA	2	12	1607193	1607204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012632	TAACTT	2	12	1607982	1607993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012632	ACAAAA	2	12	1609126	1609137	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012632	TACAAA	2	12	1631963	1631974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_012632	TAAAAA	2	12	1657098	1657109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012632	TATAAA	2	12	1863302	1863313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012632	AAGAGG	2	12	1969746	1969757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012632	AATATA	2	12	1970050	1970061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012632	ACTATC	2	12	1994778	1994789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012632	GATAAA	2	12	2097325	2097336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012632	TTAGCT	2	12	2097405	2097416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_012632	TAACAT	2	12	2132181	2132192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_012632	TTAATT	2	12	2147481	2147492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012632	TCCTTT	2	12	2179588	2179599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_012632	TAATCA	2	12	2225331	2225342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_012632	TTTATA	2	12	2247645	2247656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_012632	AAGAGG	2	12	2254124	2254135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012632	AAATTT	2	12	2254308	2254319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012632	TATTTT	2	12	2265280	2265291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_012632	ATCATA	2	12	2315092	2315103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_012632	TAATTA	2	12	2344512	2344523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012632	TAAAAT	2	12	2382688	2382699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_012632	TAGGGA	2	12	2408605	2408616	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012632	AAGAGG	2	12	2409317	2409328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012632	GCATTA	2	12	2413110	2413121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_012632	AATTAC	2	12	2563234	2563245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.