MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 2355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012632	TCATT	2	10	94	103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012632	GTCAC	2	10	356	365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012632	GATAA	2	10	1236	1245	60 %	20 %	20 %	0 %	229583575
4	NC_012632	AGAGG	2	10	1306	1315	40 %	0 %	60 %	0 %	229583575
5	NC_012632	TCCTT	2	10	3843	3852	0 %	60 %	0 %	40 %	229583579
6	NC_012632	CGTTA	2	10	4086	4095	20 %	40 %	20 %	20 %	229583579
7	NC_012632	CTGTG	2	10	4517	4526	0 %	40 %	40 %	20 %	229583580
8	NC_012632	GTAAT	2	10	4663	4672	40 %	40 %	20 %	0 %	229583580
9	NC_012632	GTTTT	2	10	4737	4746	0 %	80 %	20 %	0 %	229583580
10	NC_012632	CTAAA	2	10	5080	5089	60 %	20 %	0 %	20 %	229583581
11	NC_012632	CTTAT	2	10	5286	5295	20 %	60 %	0 %	20 %	229583581
12	NC_012632	TTAAA	2	10	5881	5890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012632	ATGTT	2	10	6110	6119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012632	TTTTC	2	10	6765	6774	0 %	80 %	0 %	20 %	229583582
15	NC_012632	TAATT	2	10	6852	6861	40 %	60 %	0 %	0 %	229583582
16	NC_012632	TCTTA	2	10	7160	7169	20 %	60 %	0 %	20 %	229583583
17	NC_012632	ATATA	2	10	8215	8224	60 %	40 %	0 %	0 %	229583585
18	NC_012632	GAAAT	2	10	9801	9810	60 %	20 %	20 %	0 %	229583586
19	NC_012632	TTATA	2	10	10156	10165	40 %	60 %	0 %	0 %	229583587
20	NC_012632	TCTTT	2	10	13133	13142	0 %	80 %	0 %	20 %	229583589
21	NC_012632	TACAC	2	10	13644	13653	40 %	20 %	0 %	40 %	229583589
22	NC_012632	CCATG	2	10	17213	17222	20 %	20 %	20 %	40 %	229583592
23	NC_012632	TTTCC	2	10	17317	17326	0 %	60 %	0 %	40 %	229583592
24	NC_012632	TAATT	2	10	17536	17545	40 %	60 %	0 %	0 %	229583592
25	NC_012632	TGGCT	2	10	21173	21182	0 %	40 %	40 %	20 %	229583595
26	NC_012632	TGAGT	2	10	21704	21713	20 %	40 %	40 %	0 %	229583596
27	NC_012632	AAGAG	2	10	24151	24160	60 %	0 %	40 %	0 %	229583599
28	NC_012632	GAAGA	2	10	26561	26570	60 %	0 %	40 %	0 %	229583602
29	NC_012632	TATTT	2	10	26917	26926	20 %	80 %	0 %	0 %	229583602
30	NC_012632	AAAAT	2	10	27149	27158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012632	CTTTT	2	10	27637	27646	0 %	80 %	0 %	20 %	229583603
32	NC_012632	AGTTA	2	10	28360	28369	40 %	40 %	20 %	0 %	229583604
33	NC_012632	TATCA	2	10	30074	30083	40 %	40 %	0 %	20 %	229583606
34	NC_012632	TTTCC	2	10	30922	30931	0 %	60 %	0 %	40 %	229583606
35	NC_012632	ATATG	2	10	31939	31948	40 %	40 %	20 %	0 %	229583607
36	NC_012632	TGTGG	2	10	32248	32257	0 %	40 %	60 %	0 %	229583608
37	NC_012632	CTTCT	2	10	33574	33583	0 %	60 %	0 %	40 %	229583609
38	NC_012632	GAAGG	2	10	35046	35055	40 %	0 %	60 %	0 %	229583611
39	NC_012632	ATTTT	2	10	36161	36170	20 %	80 %	0 %	0 %	229583613
40	NC_012632	CATAC	2	10	37257	37266	40 %	20 %	0 %	40 %	229583616
41	NC_012632	ATTAG	2	10	38395	38404	40 %	40 %	20 %	0 %	229583618
42	NC_012632	CTTTT	2	10	38422	38431	0 %	80 %	0 %	20 %	229583618
43	NC_012632	TGGTG	2	10	39029	39038	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012632	TTTTA	2	10	39214	39223	20 %	80 %	0 %	0 %	229583619
45	NC_012632	ATTAT	2	10	39391	39400	40 %	60 %	0 %	0 %	229583619
46	NC_012632	AAGGA	2	10	41217	41226	60 %	0 %	40 %	0 %	229583621
47	NC_012632	ATTTG	2	10	42391	42400	20 %	60 %	20 %	0 %	229583623
48	NC_012632	CAAGA	2	10	45008	45017	60 %	0 %	20 %	20 %	229583627
49	NC_012632	TGAAT	2	10	45031	45040	40 %	40 %	20 %	0 %	229583627
50	NC_012632	TCTTT	2	10	46816	46825	0 %	80 %	0 %	20 %	229583629
51	NC_012632	TTTCT	2	10	47063	47072	0 %	80 %	0 %	20 %	229583629
52	NC_012632	TATAG	2	10	47850	47859	40 %	40 %	20 %	0 %	229583629
53	NC_012632	AAAGT	2	10	49833	49842	60 %	20 %	20 %	0 %	229583632
54	NC_012632	GATAA	2	10	51813	51822	60 %	20 %	20 %	0 %	229583634
55	NC_012632	TCTTT	2	10	53442	53451	0 %	80 %	0 %	20 %	229583636
56	NC_012632	TTCAT	2	10	53846	53855	20 %	60 %	0 %	20 %	229583636
57	NC_012632	ATTTA	2	10	54760	54769	40 %	60 %	0 %	0 %	229583636
58	NC_012632	TTTCT	2	10	54812	54821	0 %	80 %	0 %	20 %	229583636
59	NC_012632	TACCT	2	10	57242	57251	20 %	40 %	0 %	40 %	229583638
60	NC_012632	CTGTA	2	10	57501	57510	20 %	40 %	20 %	20 %	229583638
61	NC_012632	ATTTA	2	10	57755	57764	40 %	60 %	0 %	0 %	229583638
62	NC_012632	CATTT	2	10	58417	58426	20 %	60 %	0 %	20 %	229583639
63	NC_012632	TAAAT	2	10	60299	60308	60 %	40 %	0 %	0 %	229583640
64	NC_012632	TAATT	2	10	61013	61022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012632	CAACA	2	10	61116	61125	60 %	0 %	0 %	40 %	229583642
66	NC_012632	AGCTA	2	10	62900	62909	40 %	20 %	20 %	20 %	229583643
67	NC_012632	ATCCC	2	10	64961	64970	20 %	20 %	0 %	60 %	229583645
68	NC_012632	TTAAT	2	10	65341	65350	40 %	60 %	0 %	0 %	229583645
69	NC_012632	AAGCC	2	10	66597	66606	40 %	0 %	20 %	40 %	229583647
70	NC_012632	GTTTT	2	10	72051	72060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012632	AGGAT	2	10	72633	72642	40 %	20 %	40 %	0 %	229583657
72	NC_012632	ATTGA	2	10	73332	73341	40 %	40 %	20 %	0 %	229583658
73	NC_012632	GGAAT	2	10	75093	75102	40 %	20 %	40 %	0 %	229583660
74	NC_012632	ACTTT	2	10	76594	76603	20 %	60 %	0 %	20 %	229583662
75	NC_012632	CTTAT	2	10	78067	78076	20 %	60 %	0 %	20 %	229583664
76	NC_012632	TCTTT	2	10	78611	78620	0 %	80 %	0 %	20 %	229583664
77	NC_012632	ATGTG	2	10	79051	79060	20 %	40 %	40 %	0 %	229583664
78	NC_012632	TTGAG	2	10	79090	79099	20 %	40 %	40 %	0 %	229583664
79	NC_012632	CTCTT	2	10	79999	80008	0 %	60 %	0 %	40 %	229583665
80	NC_012632	TCAGC	2	10	80700	80709	20 %	20 %	20 %	40 %	229583666
81	NC_012632	ATATG	2	10	82181	82190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012632	ATTTT	2	10	84329	84338	20 %	80 %	0 %	0 %	229583669
83	NC_012632	AGATT	2	10	89010	89019	40 %	40 %	20 %	0 %	229583674
84	NC_012632	TAGCA	2	10	89415	89424	40 %	20 %	20 %	20 %	229583675
85	NC_012632	ATATT	2	10	89906	89915	40 %	60 %	0 %	0 %	229583675
86	NC_012632	TTTAA	2	10	91932	91941	40 %	60 %	0 %	0 %	229583676
87	NC_012632	CTAAT	2	10	92633	92642	40 %	40 %	0 %	20 %	229583677
88	NC_012632	AATTA	2	10	92928	92937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012632	CTTTA	2	10	92964	92973	20 %	60 %	0 %	20 %	229583678
90	NC_012632	TTAAG	2	10	94371	94380	40 %	40 %	20 %	0 %	229583680
91	NC_012632	ACGAT	2	10	94515	94524	40 %	20 %	20 %	20 %	229583680
92	NC_012632	AACGT	2	10	94565	94574	40 %	20 %	20 %	20 %	229583680
93	NC_012632	AGTCT	2	10	96091	96100	20 %	40 %	20 %	20 %	229583682
94	NC_012632	AGTTA	2	10	96898	96907	40 %	40 %	20 %	0 %	229583683
95	NC_012632	TCCAT	2	10	97131	97140	20 %	40 %	0 %	40 %	229583683
96	NC_012632	CTATC	2	10	97506	97515	20 %	40 %	0 %	40 %	229583684
97	NC_012632	TTTAG	2	10	97928	97937	20 %	60 %	20 %	0 %	229583684
98	NC_012632	TTTCT	2	10	98087	98096	0 %	80 %	0 %	20 %	229583684
99	NC_012632	CCAAT	2	10	99568	99577	40 %	20 %	0 %	40 %	229583686
100	NC_012632	TAAGT	2	10	99804	99813	40 %	40 %	20 %	0 %	229583686
101	NC_012632	ACTAC	2	10	100589	100598	40 %	20 %	0 %	40 %	229583687
102	NC_012632	TTATC	2	10	101977	101986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012632	AGTTA	2	10	103853	103862	40 %	40 %	20 %	0 %	229583689
104	NC_012632	TATAA	2	10	103944	103953	60 %	40 %	0 %	0 %	229583689
105	NC_012632	ATATC	2	10	104500	104509	40 %	40 %	0 %	20 %	229583690
106	NC_012632	TAAGA	2	10	105896	105905	60 %	20 %	20 %	0 %	229583691
107	NC_012632	TTATC	2	10	105926	105935	20 %	60 %	0 %	20 %	229583691
108	NC_012632	GTTGA	2	10	108265	108274	20 %	40 %	40 %	0 %	229583693
109	NC_012632	TGATA	2	10	109228	109237	40 %	40 %	20 %	0 %	229583695
110	NC_012632	AAATG	2	10	110294	110303	60 %	20 %	20 %	0 %	229583696
111	NC_012632	CTTTT	2	10	110581	110590	0 %	80 %	0 %	20 %	229583696
112	NC_012632	ATATT	2	10	110802	110811	40 %	60 %	0 %	0 %	229583697
113	NC_012632	TTTCC	2	10	111609	111618	0 %	60 %	0 %	40 %	229583698
114	NC_012632	GCTTT	2	10	112436	112445	0 %	60 %	20 %	20 %	229583698
115	NC_012632	TTGTT	2	10	112829	112838	0 %	80 %	20 %	0 %	229583699
116	NC_012632	ATTTT	2	10	113295	113304	20 %	80 %	0 %	0 %	229583700
117	NC_012632	AGTGC	2	10	113748	113757	20 %	20 %	40 %	20 %	229583700
118	NC_012632	ACATT	2	10	114167	114176	40 %	40 %	0 %	20 %	229583701
119	NC_012632	CATGC	2	10	115255	115264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012632	TTTCC	2	10	118784	118793	0 %	60 %	0 %	40 %	229583708
121	NC_012632	AAATT	2	10	120405	120414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012632	GATTA	2	10	120862	120871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012632	GTAGT	2	10	121265	121274	20 %	40 %	40 %	0 %	229583711
124	NC_012632	TGGGT	2	10	121454	121463	0 %	40 %	60 %	0 %	229583711
125	NC_012632	TAGAA	2	10	122581	122590	60 %	20 %	20 %	0 %	229583712
126	NC_012632	AATTT	2	10	122834	122843	40 %	60 %	0 %	0 %	229583712
127	NC_012632	AAAGA	2	10	124281	124290	80 %	0 %	20 %	0 %	229583714
128	NC_012632	TATCT	2	10	127411	127420	20 %	60 %	0 %	20 %	229583718
129	NC_012632	AGTAA	2	10	129115	129124	60 %	20 %	20 %	0 %	229583720
130	NC_012632	AAGCG	2	10	129450	129459	40 %	0 %	40 %	20 %	229583721
131	NC_012632	ATTTC	2	10	131182	131191	20 %	60 %	0 %	20 %	229583724
132	NC_012632	TCGAT	2	10	132802	132811	20 %	40 %	20 %	20 %	229583725
133	NC_012632	GAAAA	2	10	133803	133812	80 %	0 %	20 %	0 %	229583726
134	NC_012632	AAGGT	2	10	134190	134199	40 %	20 %	40 %	0 %	229583726
135	NC_012632	AAATA	2	10	134450	134459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012632	TGGCT	2	10	134964	134973	0 %	40 %	40 %	20 %	229583728
137	NC_012632	CTTAA	2	10	138411	138420	40 %	40 %	0 %	20 %	229583731
138	NC_012632	GAGTC	2	10	142489	142498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_012632	TAGTT	2	10	157293	157302	20 %	60 %	20 %	0 %	229583754
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168	NC_012632	GGAGA	2	10	173737	173746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_012632	TATTC	2	10	287655	287664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_012632	CCTAG	2	10	288526	288535	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
251	NC_012632	TAACT	2	10	290259	290268	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_012632	ATCAT	2	10	295650	295659	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_012632	TTTAG	2	10	307846	307855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_012632	ATACG	2	10	460495	460504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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404	NC_012632	TACTT	2	10	463132	463141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
405	NC_012632	TGATT	2	10	463425	463434	20 %	60 %	20 %	0 %	229584052
406	NC_012632	CCCAT	2	10	467071	467080	20 %	20 %	0 %	60 %	229584055
407	NC_012632	ACTCC	2	10	469270	469279	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
408	NC_012632	CCTTA	2	10	469365	469374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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444	NC_012632	TCCCT	2	10	515973	515982	0 %	40 %	0 %	60 %	229584084
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