MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 32568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012632	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
2	NC_012632	TAT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
3	NC_012632	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
4	NC_012632	GTT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583574
5	NC_012632	GTT	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583574
6	NC_012632	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583574
7	NC_012632	GGT	2	6	864	869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
8	NC_012632	TGC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583575
9	NC_012632	GAG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583575
10	NC_012632	TGG	2	6	1142	1147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
11	NC_012632	TAT	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583575
12	NC_012632	ATA	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
13	NC_012632	TTA	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583575
14	NC_012632	ATC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583575
15	NC_012632	ACG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583575
16	NC_012632	AAC	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583575
17	NC_012632	TAA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
18	NC_012632	ATG	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583575
19	NC_012632	AGC	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583575
20	NC_012632	AAG	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
21	NC_012632	AGA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
22	NC_012632	TAA	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
23	NC_012632	AGA	2	6	1827	1832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
24	NC_012632	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
25	NC_012632	TGG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
26	NC_012632	AAG	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
27	NC_012632	TGA	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583575
28	NC_012632	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
29	NC_012632	AGA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
30	NC_012632	CTA	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583576
31	NC_012632	GGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583576
32	NC_012632	AAG	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
33	NC_012632	AAG	3	9	2238	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
34	NC_012632	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
35	NC_012632	AAG	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
36	NC_012632	ATT	2	6	2287	2292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
37	NC_012632	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
38	NC_012632	ATT	2	6	2318	2323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
39	NC_012632	ATA	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
40	NC_012632	TAT	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583577
41	NC_012632	TAA	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
42	NC_012632	TAA	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
43	NC_012632	AGA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583577
44	NC_012632	AGC	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583577
45	NC_012632	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583577
46	NC_012632	GAT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583577
47	NC_012632	TAA	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
48	NC_012632	TGC	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583577
49	NC_012632	AAT	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
50	NC_012632	TGC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583577
51	NC_012632	GCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583577
52	NC_012632	TAC	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583577
53	NC_012632	AAT	2	6	3126	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
54	NC_012632	GAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583578
55	NC_012632	AAG	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583578
56	NC_012632	ATC	3	9	3435	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583578
57	NC_012632	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583578
58	NC_012632	AAC	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583578
59	NC_012632	GGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583578
60	NC_012632	TGA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583578
61	NC_012632	AAG	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583579
62	NC_012632	CCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583579
63	NC_012632	TCC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583579
64	NC_012632	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583579
65	NC_012632	TTG	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583579
66	NC_012632	TAT	3	9	3954	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583579
67	NC_012632	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583579
68	NC_012632	TAG	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583579
69	NC_012632	TCC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583579
70	NC_012632	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583579
71	NC_012632	AAG	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583580
72	NC_012632	CCA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583580
73	NC_012632	AAT	2	6	4705	4710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583580
74	NC_012632	AGG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583580
75	NC_012632	TCT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
76	NC_012632	CTT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
77	NC_012632	TAA	2	6	5051	5056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583581
78	NC_012632	CCT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583581
79	NC_012632	CAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583581
80	NC_012632	TCT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
81	NC_012632	ATC	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583581
82	NC_012632	TAA	2	6	5591	5596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583581
83	NC_012632	TCA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
84	NC_012632	ATC	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
85	NC_012632	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583582
86	NC_012632	GTT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583582
87	NC_012632	GAA	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583582
88	NC_012632	TAT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583582
89	NC_012632	TCT	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
90	NC_012632	TCT	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
91	NC_012632	TCT	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
92	NC_012632	TGT	2	6	6728	6733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583582
93	NC_012632	TCA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
94	NC_012632	CTA	2	6	6989	6994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
95	NC_012632	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583582
96	NC_012632	GTA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583583
97	NC_012632	TCC	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583583
98	NC_012632	CTT	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583583
99	NC_012632	TGG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583583
100	NC_012632	TTC	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583583
101	NC_012632	CTG	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583583
102	NC_012632	CTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583584
103	NC_012632	ACT	3	9	7381	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583584
104	NC_012632	CTA	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583584
105	NC_012632	CTT	2	6	7460	7465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583584
106	NC_012632	ATC	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583584
107	NC_012632	TTC	2	6	7523	7528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583584
108	NC_012632	AAC	2	6	7542	7547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583584
109	NC_012632	TAA	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583584
110	NC_012632	TAG	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583584
111	NC_012632	TAT	2	6	7599	7604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583584
112	NC_012632	ATA	2	6	7742	7747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583585
113	NC_012632	TTG	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583585
114	NC_012632	CTT	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583585
115	NC_012632	GGA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583585
116	NC_012632	ACT	2	6	7937	7942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583585
117	NC_012632	TCA	2	6	8011	8016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583585
118	NC_012632	ATA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583585
119	NC_012632	ACA	2	6	8087	8092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583585
120	NC_012632	GAA	2	6	8228	8233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583585
121	NC_012632	GGT	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583585
122	NC_012632	GGA	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583585
123	NC_012632	GGT	2	6	8336	8341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583585
124	NC_012632	AGT	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583585
125	NC_012632	TAT	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583585
126	NC_012632	GGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229583585
127	NC_012632	TAT	2	6	8541	8546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583585
128	NC_012632	TAA	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583585
129	NC_012632	AGT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583585
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131	NC_012632	CTC	2	6	8692	8697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583585
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258	NC_012632	TTA	2	6	18273	18278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583593
259	NC_012632	AAT	2	6	18284	18289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583593
260	NC_012632	AAT	2	6	18413	18418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583593
261	NC_012632	TAT	2	6	18424	18429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583593
262	NC_012632	TTC	2	6	18477	18482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
263	NC_012632	TCT	2	6	18499	18504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
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265	NC_012632	CAA	2	6	18561	18566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583593
266	NC_012632	TTC	2	6	18594	18599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
267	NC_012632	TAT	2	6	18675	18680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583593
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271	NC_012632	TGG	2	6	19116	19121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583594
272	NC_012632	TCC	2	6	19131	19136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583594
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280	NC_012632	TAT	2	6	19459	19464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583594
281	NC_012632	TGG	2	6	19485	19490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583594
282	NC_012632	ACT	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583594
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288	NC_012632	GAG	2	6	20053	20058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583594
289	NC_012632	AGG	2	6	20098	20103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583594
290	NC_012632	TGG	2	6	20109	20114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583594
291	NC_012632	AGA	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583594
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