MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW3

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012631	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	228404351
2	NC_012631	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	228404352
3	NC_012631	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	228404352
4	NC_012631	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	228404352
5	NC_012631	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	228404352
6	NC_012631	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	228404353
7	NC_012631	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	228404353
8	NC_012631	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	228404353
9	NC_012631	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	228404354
10	NC_012631	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	228404354
11	NC_012631	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	228404354
12	NC_012631	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	228404354
13	NC_012631	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	228404355
14	NC_012631	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	228404357
15	NC_012631	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	228404357
16	NC_012631	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	228404357
17	NC_012631	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	228404358
18	NC_012631	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	228404358
19	NC_012631	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	228404358
20	NC_012631	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	228404358

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.