MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW3

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012631	AT	3	6	476	481	50 %	50 %	0 %	0 %	228404351
2	NC_012631	GT	4	8	1018	1025	0 %	50 %	50 %	0 %	228404351
3	NC_012631	GA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	50 %	0 %	228404352
4	NC_012631	GT	3	6	2557	2562	0 %	50 %	50 %	0 %	228404353
5	NC_012631	AT	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	228404353
6	NC_012631	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	228404353
7	NC_012631	AT	3	6	3284	3289	50 %	50 %	0 %	0 %	228404353
8	NC_012631	AT	3	6	4391	4396	50 %	50 %	0 %	0 %	228404354
9	NC_012631	CT	3	6	4533	4538	0 %	50 %	0 %	50 %	228404354
10	NC_012631	TA	3	6	6478	6483	50 %	50 %	0 %	0 %	228404357
11	NC_012631	TC	3	6	6544	6549	0 %	50 %	0 %	50 %	228404357
12	NC_012631	AT	3	6	7145	7150	50 %	50 %	0 %	0 %	228404358
13	NC_012631	AT	6	12	7448	7459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012631	AT	6	12	7465	7476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012631	GA	4	8	7495	7502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.