MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW5

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012626	ATTG	2	8	610	617	25 %	50 %	25 %	0 %	228298556
2	NC_012626	TCTG	2	8	1448	1455	0 %	50 %	25 %	25 %	228298557
3	NC_012626	GAAA	2	8	1474	1481	75 %	0 %	25 %	0 %	228298557
4	NC_012626	AGGA	2	8	1607	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	228298557
5	NC_012626	TGTT	2	8	1940	1947	0 %	75 %	25 %	0 %	228298557
6	NC_012626	TTCT	2	8	2786	2793	0 %	75 %	0 %	25 %	228298558
7	NC_012626	GTTT	2	8	3312	3319	0 %	75 %	25 %	0 %	228298558
8	NC_012626	AGGA	2	8	3432	3439	50 %	0 %	50 %	0 %	228298558
9	NC_012626	TTTC	2	8	3692	3699	0 %	75 %	0 %	25 %	228298559
10	NC_012626	GGAT	2	8	3812	3819	25 %	25 %	50 %	0 %	228298559
11	NC_012626	TAAA	2	8	4536	4543	75 %	25 %	0 %	0 %	228298559
12	NC_012626	ATTA	2	8	4598	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	228298559
13	NC_012626	CAAA	2	8	5448	5455	75 %	0 %	0 %	25 %	228298560
14	NC_012626	ATCA	2	8	6080	6087	50 %	25 %	0 %	25 %	228298562
15	NC_012626	AATT	2	8	6295	6302	50 %	50 %	0 %	0 %	228298562
16	NC_012626	TCGG	2	8	6366	6373	0 %	25 %	50 %	25 %	228298562
17	NC_012626	AGTT	2	8	6996	7003	25 %	50 %	25 %	0 %	228298563
18	NC_012626	CCAA	2	8	7065	7072	50 %	0 %	0 %	50 %	228298563
19	NC_012626	CTTC	2	8	7220	7227	0 %	50 %	0 %	50 %	228298563
20	NC_012626	GATA	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	228298563

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.