MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW5

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012626	A	6	6	89	94	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012626	A	6	6	235	240	100 %	0 %	0 %	0 %	228298556
3	NC_012626	T	6	6	500	505	0 %	100 %	0 %	0 %	228298556
4	NC_012626	T	8	8	558	565	0 %	100 %	0 %	0 %	228298556
5	NC_012626	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	228298556
6	NC_012626	A	7	7	704	710	100 %	0 %	0 %	0 %	228298556
7	NC_012626	A	6	6	1095	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012626	T	8	8	1590	1597	0 %	100 %	0 %	0 %	228298557
9	NC_012626	A	6	6	1666	1671	100 %	0 %	0 %	0 %	228298557
10	NC_012626	T	6	6	1816	1821	0 %	100 %	0 %	0 %	228298557
11	NC_012626	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	228298557
12	NC_012626	T	7	7	2187	2193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012626	A	8	8	2750	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	228298558
14	NC_012626	A	6	6	3543	3548	100 %	0 %	0 %	0 %	228298558
15	NC_012626	A	7	7	4412	4418	100 %	0 %	0 %	0 %	228298559
16	NC_012626	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	228298559
17	NC_012626	A	6	6	4652	4657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012626	T	6	6	5429	5434	0 %	100 %	0 %	0 %	228298560
19	NC_012626	A	6	6	5586	5591	100 %	0 %	0 %	0 %	228298561
20	NC_012626	A	6	6	5780	5785	100 %	0 %	0 %	0 %	228298561
21	NC_012626	T	6	6	5881	5886	0 %	100 %	0 %	0 %	228298562
22	NC_012626	A	6	6	5961	5966	100 %	0 %	0 %	0 %	228298562
23	NC_012626	A	7	7	6098	6104	100 %	0 %	0 %	0 %	228298562
24	NC_012626	T	6	6	6484	6489	0 %	100 %	0 %	0 %	228298562
25	NC_012626	A	7	7	6670	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	228298563
26	NC_012626	T	6	6	6689	6694	0 %	100 %	0 %	0 %	228298563
27	NC_012626	A	8	8	6695	6702	100 %	0 %	0 %	0 %	228298563
28	NC_012626	A	6	6	6924	6929	100 %	0 %	0 %	0 %	228298563

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.