MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW4

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012625	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	228292901
2	NC_012625	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	228292902
3	NC_012625	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	228292902
4	NC_012625	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	228292902
5	NC_012625	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	228292902
6	NC_012625	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	228292903
7	NC_012625	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	228292903
8	NC_012625	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	228292903
9	NC_012625	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	228292904
10	NC_012625	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	228292904
11	NC_012625	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	228292904
12	NC_012625	ATTA	2	8	4620	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	228292904
13	NC_012625	CAAA	2	8	5470	5477	75 %	0 %	0 %	25 %	228292905
14	NC_012625	ATCA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	228292907
15	NC_012625	AATT	2	8	6317	6324	50 %	50 %	0 %	0 %	228292907
16	NC_012625	TCGG	2	8	6388	6395	0 %	25 %	50 %	25 %	228292907
17	NC_012625	AGTT	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	228292908
18	NC_012625	CCAA	2	8	7087	7094	50 %	0 %	0 %	50 %	228292908
19	NC_012625	CTTC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	228292908
20	NC_012625	GATA	2	8	7277	7284	50 %	25 %	25 %	0 %	228292908

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.