MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis plasmid pSW4

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012625	A	6	6	111	116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012625	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	228292901
3	NC_012625	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	228292901
4	NC_012625	T	8	8	580	587	0 %	100 %	0 %	0 %	228292901
5	NC_012625	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	228292901
6	NC_012625	A	7	7	726	732	100 %	0 %	0 %	0 %	228292901
7	NC_012625	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012625	T	8	8	1612	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	228292902
9	NC_012625	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	228292902
10	NC_012625	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	228292902
11	NC_012625	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	228292902
12	NC_012625	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012625	A	8	8	2772	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	228292903
14	NC_012625	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	228292903
15	NC_012625	A	7	7	4434	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	228292904
16	NC_012625	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	228292904
17	NC_012625	A	6	6	4674	4679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012625	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	228292905
19	NC_012625	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	228292906
20	NC_012625	A	6	6	5802	5807	100 %	0 %	0 %	0 %	228292906
21	NC_012625	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	228292907
22	NC_012625	A	6	6	5983	5988	100 %	0 %	0 %	0 %	228292907
23	NC_012625	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	228292907
24	NC_012625	T	6	6	6506	6511	0 %	100 %	0 %	0 %	228292907
25	NC_012625	A	7	7	6692	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	228292908
26	NC_012625	T	6	6	6711	6716	0 %	100 %	0 %	0 %	228292908
27	NC_012625	A	8	8	6717	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	228292908
28	NC_012625	A	6	6	6946	6951	100 %	0 %	0 %	0 %	228292908

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.