MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	TATAC	2	10	665	674	40 %	40 %	0 %	20 %	228288720
2	NC_012624	CTAGT	2	10	1167	1176	20 %	40 %	20 %	20 %	228288721
3	NC_012624	TTTCA	2	10	1508	1517	20 %	60 %	0 %	20 %	228288723
4	NC_012624	CTGAC	2	10	2503	2512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012624	GAATT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012624	TAAAA	2	10	2901	2910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012624	CATAA	2	10	4676	4685	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012624	TTTCG	2	10	5207	5216	0 %	60 %	20 %	20 %	228288727
9	NC_012624	GGGTA	2	10	6217	6226	20 %	20 %	60 %	0 %	228288728
10	NC_012624	TAATC	2	10	7287	7296	40 %	40 %	0 %	20 %	228288731
11	NC_012624	TATCT	2	10	8854	8863	20 %	60 %	0 %	20 %	228288736
12	NC_012624	GTATG	2	10	9792	9801	20 %	40 %	40 %	0 %	228288737
13	NC_012624	AGAGA	2	10	14439	14448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012624	CTATC	2	10	14818	14827	20 %	40 %	0 %	40 %	228288745
15	NC_012624	TTACT	2	10	15574	15583	20 %	60 %	0 %	20 %	228288745
16	NC_012624	ATCTA	2	10	16473	16482	40 %	40 %	0 %	20 %	228288746
17	NC_012624	TCCTC	2	10	16543	16552	0 %	40 %	0 %	60 %	228288746
18	NC_012624	TCTCT	2	10	18516	18525	0 %	60 %	0 %	40 %	228288747
19	NC_012624	CTTCT	2	10	18604	18613	0 %	60 %	0 %	40 %	228288747
20	NC_012624	CTTTA	2	10	18712	18721	20 %	60 %	0 %	20 %	228288747
21	NC_012624	TTATA	2	10	19536	19545	40 %	60 %	0 %	0 %	228288747
22	NC_012624	AGAGA	2	10	20973	20982	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012624	AAAAG	2	10	21592	21601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012624	CTTCT	2	10	22230	22239	0 %	60 %	0 %	40 %	228288748
25	NC_012624	CTTTC	2	10	22438	22447	0 %	60 %	0 %	40 %	228288748
26	NC_012624	CAATT	2	10	25767	25776	40 %	40 %	0 %	20 %	228288750
27	NC_012624	ATATA	2	10	25910	25919	60 %	40 %	0 %	0 %	228288750
28	NC_012624	CTTTT	2	10	26923	26932	0 %	80 %	0 %	20 %	228288753
29	NC_012624	TCAAC	2	10	27190	27199	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012624	ATTTA	2	10	28568	28577	40 %	60 %	0 %	0 %	228288754
31	NC_012624	TAGTT	2	10	32000	32009	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012624	CCTTA	2	10	32699	32708	20 %	40 %	0 %	40 %	228288758
33	NC_012624	CTTGA	2	10	33059	33068	20 %	40 %	20 %	20 %	228288758
34	NC_012624	ATTAG	2	10	35879	35888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012624	ACCTA	2	10	36537	36546	40 %	20 %	0 %	40 %	228288763
36	NC_012624	AAGGC	2	10	37046	37055	40 %	0 %	40 %	20 %	228288764
37	NC_012624	ACTTA	2	10	40220	40229	40 %	40 %	0 %	20 %	228288769
38	NC_012624	CTGTA	2	10	40891	40900	20 %	40 %	20 %	20 %	228288769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.