MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	GGAT	2	8	389	396	25 %	25 %	50 %	0 %	228288720
2	NC_012624	AGCA	2	8	685	692	50 %	0 %	25 %	25 %	228288720
3	NC_012624	ATTT	2	8	1208	1215	25 %	75 %	0 %	0 %	228288721
4	NC_012624	GATA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	228288722
5	NC_012624	TTGA	2	8	1949	1956	25 %	50 %	25 %	0 %	228288724
6	NC_012624	TTCT	2	8	2666	2673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012624	TTTA	2	8	2952	2959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012624	AATT	2	8	3244	3251	50 %	50 %	0 %	0 %	228288725
9	NC_012624	TCAG	2	8	3553	3560	25 %	25 %	25 %	25 %	228288726
10	NC_012624	AAAG	2	8	3793	3800	75 %	0 %	25 %	0 %	228288726
11	NC_012624	AAAT	2	8	4230	4237	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
12	NC_012624	TAAA	2	8	4509	4516	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
13	NC_012624	ACAT	2	8	5262	5269	50 %	25 %	0 %	25 %	228288727
14	NC_012624	TAAA	2	8	6346	6353	75 %	25 %	0 %	0 %	228288728
15	NC_012624	AAGA	2	8	6816	6823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012624	ATTT	2	8	7403	7410	25 %	75 %	0 %	0 %	228288731
17	NC_012624	TTTC	2	8	7514	7521	0 %	75 %	0 %	25 %	228288732
18	NC_012624	TCAT	2	8	7691	7698	25 %	50 %	0 %	25 %	228288732
19	NC_012624	AATT	2	8	8247	8254	50 %	50 %	0 %	0 %	228288734
20	NC_012624	AGTT	2	8	8391	8398	25 %	50 %	25 %	0 %	228288734
21	NC_012624	TGTA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012624	CAGA	2	8	9638	9645	50 %	0 %	25 %	25 %	228288737
23	NC_012624	TCTA	2	8	10438	10445	25 %	50 %	0 %	25 %	228288738
24	NC_012624	TTTA	2	8	11250	11257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012624	CTGA	2	8	11881	11888	25 %	25 %	25 %	25 %	228288740
26	NC_012624	CAAA	2	8	12363	12370	75 %	0 %	0 %	25 %	228288740
27	NC_012624	AGGG	2	8	12731	12738	25 %	0 %	75 %	0 %	228288741
28	NC_012624	AAAC	2	8	13067	13074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012624	TATT	2	8	13140	13147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012624	AGAA	2	8	13296	13303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012624	TCTT	2	8	13777	13784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012624	GAAA	2	8	13869	13876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012624	AAAG	2	8	14127	14134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012624	TAGA	2	8	14258	14265	50 %	25 %	25 %	0 %	228288744
35	NC_012624	TATT	2	8	14713	14720	25 %	75 %	0 %	0 %	228288745
36	NC_012624	CATC	2	8	16597	16604	25 %	25 %	0 %	50 %	228288746
37	NC_012624	CCCT	2	8	16883	16890	0 %	25 %	0 %	75 %	228288746
38	NC_012624	TGAA	2	8	16918	16925	50 %	25 %	25 %	0 %	228288746
39	NC_012624	CTTC	2	8	17422	17429	0 %	50 %	0 %	50 %	228288746
40	NC_012624	GCTT	2	8	17999	18006	0 %	50 %	25 %	25 %	228288747
41	NC_012624	ATTC	2	8	18444	18451	25 %	50 %	0 %	25 %	228288747
42	NC_012624	TACT	2	8	18489	18496	25 %	50 %	0 %	25 %	228288747
43	NC_012624	CTTC	2	8	18543	18550	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
44	NC_012624	CTAA	2	8	18893	18900	50 %	25 %	0 %	25 %	228288747
45	NC_012624	GAAT	2	8	18923	18930	50 %	25 %	25 %	0 %	228288747
46	NC_012624	ATTC	2	8	19113	19120	25 %	50 %	0 %	25 %	228288747
47	NC_012624	TACA	2	8	19465	19472	50 %	25 %	0 %	25 %	228288747
48	NC_012624	TAGT	2	8	20423	20430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012624	TAGT	2	8	20748	20755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012624	AGTA	2	8	20847	20854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012624	TAGT	2	8	20924	20931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012624	AGTA	2	8	21046	21053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012624	AACC	2	8	21504	21511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012624	TATT	2	8	21897	21904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012624	GTCT	2	8	22062	22069	0 %	50 %	25 %	25 %	228288748
56	NC_012624	TCTT	2	8	22306	22313	0 %	75 %	0 %	25 %	228288748
57	NC_012624	TCCT	2	8	22737	22744	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
58	NC_012624	ATTT	2	8	23642	23649	25 %	75 %	0 %	0 %	228288748
59	NC_012624	ATCT	2	8	23676	23683	25 %	50 %	0 %	25 %	228288748
60	NC_012624	TTGA	2	8	23899	23906	25 %	50 %	25 %	0 %	228288748
61	NC_012624	CTTT	2	8	24026	24033	0 %	75 %	0 %	25 %	228288748
62	NC_012624	TTTA	2	8	24255	24262	25 %	75 %	0 %	0 %	228288748
63	NC_012624	AATG	2	8	24301	24308	50 %	25 %	25 %	0 %	228288748
64	NC_012624	AAAT	2	8	24389	24396	75 %	25 %	0 %	0 %	228288748
65	NC_012624	TCCT	2	8	24757	24764	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
66	NC_012624	GAAG	2	8	25623	25630	50 %	0 %	50 %	0 %	228288750
67	NC_012624	AGAT	2	8	25723	25730	50 %	25 %	25 %	0 %	228288750
68	NC_012624	TAGC	2	8	26146	26153	25 %	25 %	25 %	25 %	228288751
69	NC_012624	AAGA	2	8	26670	26677	75 %	0 %	25 %	0 %	228288752
70	NC_012624	ATTG	2	8	27596	27603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012624	CCTT	2	8	27720	27727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012624	GAAT	2	8	28105	28112	50 %	25 %	25 %	0 %	228288754
73	NC_012624	AAAT	2	8	28327	28334	75 %	25 %	0 %	0 %	228288754
74	NC_012624	GGGA	2	8	28503	28510	25 %	0 %	75 %	0 %	228288754
75	NC_012624	TTTC	2	8	28684	28691	0 %	75 %	0 %	25 %	228288755
76	NC_012624	AAAG	2	8	28735	28742	75 %	0 %	25 %	0 %	228288755
77	NC_012624	CCAT	2	8	28763	28770	25 %	25 %	0 %	50 %	228288755
78	NC_012624	CATT	2	8	29064	29071	25 %	50 %	0 %	25 %	228288755
79	NC_012624	TAAG	2	8	29131	29138	50 %	25 %	25 %	0 %	228288755
80	NC_012624	ATTG	2	8	29360	29367	25 %	50 %	25 %	0 %	228288755
81	NC_012624	TTAA	2	8	29477	29484	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
82	NC_012624	ATTA	2	8	29590	29597	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
83	NC_012624	AGTA	2	8	30408	30415	50 %	25 %	25 %	0 %	228288756
84	NC_012624	GGAG	2	8	31099	31106	25 %	0 %	75 %	0 %	228288756
85	NC_012624	ATGG	2	8	31241	31248	25 %	25 %	50 %	0 %	228288756
86	NC_012624	AAAT	2	8	31316	31323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012624	ATTA	2	8	31324	31331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012624	AAAT	2	8	31367	31374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012624	CTAA	2	8	31788	31795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012624	TATC	2	8	32206	32213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012624	TAGA	2	8	32501	32508	50 %	25 %	25 %	0 %	228288758
92	NC_012624	CTCC	2	8	32552	32559	0 %	25 %	0 %	75 %	228288758
93	NC_012624	CTTT	2	8	33406	33413	0 %	75 %	0 %	25 %	228288758
94	NC_012624	TATC	2	8	33578	33585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012624	TCCT	2	8	33698	33705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012624	TCCT	2	8	34444	34451	0 %	50 %	0 %	50 %	228288759
97	NC_012624	TCTT	2	8	34466	34473	0 %	75 %	0 %	25 %	228288759
98	NC_012624	GTAA	2	8	34480	34487	50 %	25 %	25 %	0 %	228288759
99	NC_012624	TTTC	2	8	34492	34499	0 %	75 %	0 %	25 %	228288759
100	NC_012624	TTAA	2	8	35005	35012	50 %	50 %	0 %	0 %	228288759
101	NC_012624	TCAA	2	8	35184	35191	50 %	25 %	0 %	25 %	228288760
102	NC_012624	TACC	2	8	35374	35381	25 %	25 %	0 %	50 %	228288760
103	NC_012624	TGTA	2	8	35537	35544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012624	GAAA	2	8	35560	35567	75 %	0 %	25 %	0 %	228288761
105	NC_012624	AAGG	2	8	35624	35631	50 %	0 %	50 %	0 %	228288761
106	NC_012624	AGGA	2	8	35911	35918	50 %	0 %	50 %	0 %	228288762
107	NC_012624	AATT	2	8	35992	35999	50 %	50 %	0 %	0 %	228288762
108	NC_012624	CTAT	2	8	36743	36750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012624	TGAG	2	8	37104	37111	25 %	25 %	50 %	0 %	228288765
110	NC_012624	AGCA	2	8	37407	37414	50 %	0 %	25 %	25 %	228288766
111	NC_012624	AGAA	2	8	37626	37633	75 %	0 %	25 %	0 %	228288766
112	NC_012624	GTTA	2	8	37730	37737	25 %	50 %	25 %	0 %	228288766
113	NC_012624	AGTT	2	8	37812	37819	25 %	50 %	25 %	0 %	228288766
114	NC_012624	ACTC	2	8	38056	38063	25 %	25 %	0 %	50 %	228288766
115	NC_012624	AAAT	2	8	38608	38615	75 %	25 %	0 %	0 %	228288766
116	NC_012624	AGCA	2	8	38650	38657	50 %	0 %	25 %	25 %	228288766
117	NC_012624	TAAT	2	8	38850	38857	50 %	50 %	0 %	0 %	228288766
118	NC_012624	TCAG	2	8	38920	38927	25 %	25 %	25 %	25 %	228288766
119	NC_012624	TTTC	2	8	39527	39534	0 %	75 %	0 %	25 %	228288768
120	NC_012624	TTTC	2	8	39557	39564	0 %	75 %	0 %	25 %	228288768
121	NC_012624	CATA	2	8	39620	39627	50 %	25 %	0 %	25 %	228288768
122	NC_012624	CTTT	2	8	39632	39639	0 %	75 %	0 %	25 %	228288768
123	NC_012624	TTTC	2	8	39974	39981	0 %	75 %	0 %	25 %	228288768
124	NC_012624	AAGT	2	8	40385	40392	50 %	25 %	25 %	0 %	228288769
125	NC_012624	GTAA	2	8	41035	41042	50 %	25 %	25 %	0 %	228288769
126	NC_012624	ATAA	2	8	41229	41236	75 %	25 %	0 %	0 %	228288769
127	NC_012624	TATT	2	8	41537	41544	25 %	75 %	0 %	0 %	228288769
128	NC_012624	ATTA	2	8	41602	41609	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
129	NC_012624	CCAG	2	8	41659	41666	25 %	0 %	25 %	50 %	228288769
130	NC_012624	GCTA	2	8	41809	41816	25 %	25 %	25 %	25 %	228288769
131	NC_012624	TAAA	2	8	42171	42178	75 %	25 %	0 %	0 %	228288769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.