MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	228288720
2	NC_012624	CA	4	8	615	622	50 %	0 %	0 %	50 %	228288720
3	NC_012624	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	228288723
4	NC_012624	AT	3	6	2219	2224	50 %	50 %	0 %	0 %	228288724
5	NC_012624	AG	3	6	3407	3412	50 %	0 %	50 %	0 %	228288725
6	NC_012624	AG	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	228288726
7	NC_012624	TA	3	6	4176	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	228288726
8	NC_012624	AT	3	6	4904	4909	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
9	NC_012624	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
10	NC_012624	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
11	NC_012624	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	228288728
12	NC_012624	TC	3	6	6623	6628	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
13	NC_012624	CT	3	6	6649	6654	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
14	NC_012624	TC	3	6	7068	7073	0 %	50 %	0 %	50 %	228288730
15	NC_012624	TC	3	6	7295	7300	0 %	50 %	0 %	50 %	228288731
16	NC_012624	GA	3	6	7326	7331	50 %	0 %	50 %	0 %	228288731
17	NC_012624	AT	3	6	7753	7758	50 %	50 %	0 %	0 %	228288733
18	NC_012624	CT	3	6	8667	8672	0 %	50 %	0 %	50 %	228288736
19	NC_012624	AC	3	6	9464	9469	50 %	0 %	0 %	50 %	228288737
20	NC_012624	CA	3	6	9689	9694	50 %	0 %	0 %	50 %	228288737
21	NC_012624	GT	3	6	9831	9836	0 %	50 %	50 %	0 %	228288737
22	NC_012624	AG	3	6	9997	10002	50 %	0 %	50 %	0 %	228288738
23	NC_012624	TC	3	6	10955	10960	0 %	50 %	0 %	50 %	228288738
24	NC_012624	TA	3	6	11993	11998	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
25	NC_012624	AG	3	6	12226	12231	50 %	0 %	50 %	0 %	228288740
26	NC_012624	TA	3	6	12239	12244	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
27	NC_012624	CT	3	6	12789	12794	0 %	50 %	0 %	50 %	228288741
28	NC_012624	TC	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	228288742
29	NC_012624	TA	3	6	13655	13660	50 %	50 %	0 %	0 %	228288742
30	NC_012624	TC	3	6	13678	13683	0 %	50 %	0 %	50 %	228288742
31	NC_012624	AT	3	6	14221	14226	50 %	50 %	0 %	0 %	228288744
32	NC_012624	TA	3	6	15088	15093	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
33	NC_012624	TA	4	8	15315	15322	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
34	NC_012624	TA	4	8	15506	15513	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
35	NC_012624	CT	3	6	15600	15605	0 %	50 %	0 %	50 %	228288745
36	NC_012624	TA	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
37	NC_012624	AT	3	6	16736	16741	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
38	NC_012624	TC	3	6	16822	16827	0 %	50 %	0 %	50 %	228288746
39	NC_012624	AG	4	8	17049	17056	50 %	0 %	50 %	0 %	228288746
40	NC_012624	TC	3	6	17208	17213	0 %	50 %	0 %	50 %	228288746
41	NC_012624	AT	3	6	17825	17830	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
42	NC_012624	TC	3	6	18533	18538	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
43	NC_012624	TA	3	6	18732	18737	50 %	50 %	0 %	0 %	228288747
44	NC_012624	CT	3	6	19844	19849	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
45	NC_012624	CT	4	8	19958	19965	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
46	NC_012624	TA	3	6	22367	22372	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
47	NC_012624	TA	3	6	22755	22760	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
48	NC_012624	TA	3	6	22905	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
49	NC_012624	CT	3	6	22933	22938	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
50	NC_012624	TC	3	6	22958	22963	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
51	NC_012624	TA	4	8	22968	22975	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
52	NC_012624	GT	3	6	23260	23265	0 %	50 %	50 %	0 %	228288748
53	NC_012624	AT	3	6	23776	23781	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
54	NC_012624	AT	3	6	24825	24830	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
55	NC_012624	TC	3	6	25712	25717	0 %	50 %	0 %	50 %	228288750
56	NC_012624	AT	3	6	26610	26615	50 %	50 %	0 %	0 %	228288752
57	NC_012624	TC	4	8	28069	28076	0 %	50 %	0 %	50 %	228288754
58	NC_012624	AT	4	8	28155	28162	50 %	50 %	0 %	0 %	228288754
59	NC_012624	AT	3	6	28598	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
60	NC_012624	AT	3	6	29152	29157	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
61	NC_012624	TA	3	6	29685	29690	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
62	NC_012624	CA	3	6	31392	31397	50 %	0 %	0 %	50 %	228288757
63	NC_012624	TA	4	8	31512	31519	50 %	50 %	0 %	0 %	228288757
64	NC_012624	TA	3	6	32921	32926	50 %	50 %	0 %	0 %	228288758
65	NC_012624	TA	3	6	34596	34601	50 %	50 %	0 %	0 %	228288759
66	NC_012624	AT	3	6	35400	35405	50 %	50 %	0 %	0 %	228288760
67	NC_012624	AT	3	6	35762	35767	50 %	50 %	0 %	0 %	228288761
68	NC_012624	TA	3	6	36056	36061	50 %	50 %	0 %	0 %	228288763
69	NC_012624	TC	3	6	36518	36523	0 %	50 %	0 %	50 %	228288763
70	NC_012624	CA	3	6	36784	36789	50 %	0 %	0 %	50 %	228288764
71	NC_012624	AG	3	6	36865	36870	50 %	0 %	50 %	0 %	228288764
72	NC_012624	GA	3	6	37268	37273	50 %	0 %	50 %	0 %	228288765
73	NC_012624	TA	3	6	38121	38126	50 %	50 %	0 %	0 %	228288766
74	NC_012624	AC	3	6	39191	39196	50 %	0 %	0 %	50 %	228288766
75	NC_012624	TC	3	6	39306	39311	0 %	50 %	0 %	50 %	228288767
76	NC_012624	TC	3	6	39537	39542	0 %	50 %	0 %	50 %	228288768
77	NC_012624	AT	3	6	39651	39656	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
78	NC_012624	AT	4	8	39690	39697	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
79	NC_012624	AT	3	6	39832	39837	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
80	NC_012624	TC	3	6	39988	39993	0 %	50 %	0 %	50 %	228288768
81	NC_012624	AT	3	6	40489	40494	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
82	NC_012624	TG	4	8	40798	40805	0 %	50 %	50 %	0 %	228288769
83	NC_012624	GA	3	6	40872	40877	50 %	0 %	50 %	0 %	228288769
84	NC_012624	TG	3	6	40952	40957	0 %	50 %	50 %	0 %	228288769
85	NC_012624	TA	4	8	41252	41259	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
86	NC_012624	AT	3	6	41264	41269	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
87	NC_012624	AT	3	6	41927	41932	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
88	NC_012624	AT	3	6	42207	42212	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.