MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012623	TACAAA	2	12	5743	5754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012623	TGGTAT	2	12	17808	17819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012623	TAATAC	2	12	27115	27126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012623	CTTTTC	2	12	32725	32736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012623	TATTTA	2	12	38254	38265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012623	TCTAGT	2	12	48123	48134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012623	TCTAAT	2	12	53970	53981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012623	TCTTTT	2	12	54155	54166	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012623	AATAAA	2	12	71852	71863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012623	AATGTA	2	12	90428	90439	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012623	AGTTAA	2	12	90612	90623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012623	TAAAAA	2	12	102624	102635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012623	ATATTA	2	12	102906	102917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012623	TTCTTT	2	12	168915	168926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012623	CTCTAT	2	12	184875	184886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012623	AAGAGG	2	12	198715	198726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012623	ATAGTA	2	12	199667	199678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012623	CCAATT	2	12	206237	206248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012623	ATTTTT	2	12	218772	218783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012623	ATTAAA	2	12	223727	223738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012623	TAAACT	2	12	228196	228207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012623	CTTTTT	2	12	238294	238305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012623	TATTCT	2	12	269250	269261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012623	TTTGCT	2	12	270797	270808	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012623	ATAACT	2	12	271254	271265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012623	ACTAAC	2	12	292365	292376	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012623	TTATTT	2	12	295783	295794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012623	CAGCAC	2	12	308669	308680	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012623	TTCTTT	2	12	325105	325116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012623	TTTTAA	2	12	331360	331371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012623	AAGGAA	2	12	346738	346749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012623	AAAATA	2	12	394821	394832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012623	TCCCTC	2	12	401968	401979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012623	TACAAA	2	12	404023	404034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012623	TTTTAC	2	12	407209	407220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012623	CATTAA	2	12	437504	437515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012623	ATATAC	2	12	438575	438586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012623	TCTCTT	2	12	442355	442366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012623	CATAAA	2	12	447584	447595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012623	AAAGGA	2	12	474153	474164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012623	CTATTA	2	12	474215	474226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012623	AATTCC	2	12	483691	483702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012623	TAAGTT	2	12	484062	484073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012623	TACATC	2	12	507783	507794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012623	AATTAA	2	12	507847	507858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012623	ATGTTA	2	12	527195	527206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012623	TAGGGA	2	12	552245	552256	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012623	AAGGAG	2	12	552441	552452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012623	TGAAGA	2	12	665505	665516	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012623	TATAAA	2	12	690573	690584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012623	TATATT	2	12	690589	690600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012623	ATATTA	2	12	745371	745382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012623	TACTAA	2	12	791801	791812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012623	TTTATT	2	12	1015384	1015395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012623	ATTTGT	2	12	1061066	1061077	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012623	AAATTT	2	12	1075486	1075497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012623	TAAATA	2	12	1084157	1084168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012623	TTATAC	2	12	1092078	1092089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012623	CCTCAT	2	12	1092296	1092307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012623	GCTCTA	2	12	1100925	1100936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012623	TTTCAT	2	12	1101068	1101079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012623	TTATAT	2	12	1164795	1164806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012623	TTATGA	2	12	1210010	1210021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012623	GAAATA	2	12	1222556	1222567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012623	TTTTGG	2	12	1229730	1229741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012623	TAAGAA	2	12	1230646	1230657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012623	TATTCT	2	12	1230863	1230874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012623	CAATAT	2	12	1273659	1273670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012623	AATTCC	2	12	1274158	1274169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012623	TTTATA	2	12	1274461	1274472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012623	TCGCTA	2	12	1305792	1305803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012623	CTGACG	2	12	1306176	1306187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012623	TTTCAT	2	12	1403856	1403867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012623	TCTTTA	2	12	1414677	1414688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012623	GCAAGA	2	12	1438655	1438666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012623	AAAGCT	2	12	1443763	1443774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012623	CATAAT	2	12	1494432	1494443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012623	CCTAAA	2	12	1505017	1505028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012623	TAGGGA	2	12	1511078	1511089	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012623	CTCATC	2	12	1525272	1525283	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012623	GTTTCG	2	12	1553491	1553502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012623	TGTTTT	2	12	1556078	1556089	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012623	GTATTA	2	12	1585379	1585390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012623	ATATTT	2	12	1608547	1608558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012623	TTTGAT	2	12	1609882	1609893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012623	CTTATT	2	12	1629916	1629927	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012623	TAGATT	2	12	1631195	1631206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012623	AATACA	2	12	1634261	1634272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012623	TACATC	2	12	1715992	1716003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012623	TAGGGA	2	12	1726635	1726646	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012623	AGATAA	2	12	1752751	1752762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012623	ATGAAA	2	12	1753848	1753859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012623	ATATTT	2	12	1770082	1770093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012623	TAAAAT	2	12	1797158	1797169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012623	AAAATA	2	12	1802901	1802912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012623	TTTATA	2	12	1813078	1813089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012623	TTCTAT	2	12	1831123	1831134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012623	TCTAAT	2	12	1832039	1832050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012623	GCAAGA	2	12	1835885	1835896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012623	AAAGAG	2	12	1867060	1867071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012623	CTCATA	2	12	1869850	1869861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012623	AAAATT	2	12	1873200	1873211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012623	TCCAAA	2	12	1877682	1877693	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012623	ACTCTA	2	12	1886554	1886565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012623	AATGAT	2	12	1886670	1886681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012623	GGTTTG	2	12	1887995	1888006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012623	ATTGGA	2	12	1889254	1889265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012623	TTCATC	2	12	1890861	1890872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012623	CTTTTT	2	12	1896016	1896027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012623	ATATTA	2	12	1897540	1897551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012623	TAGGGA	2	12	1898592	1898603	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012623	TACAAA	2	12	1898809	1898820	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012623	TTTATC	2	12	1903679	1903690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012623	TTTCCT	2	12	1908596	1908607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012623	AGTAAA	2	12	1909633	1909644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012623	ATTTGG	2	12	1932117	1932128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012623	AAGATC	2	12	1935081	1935092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_012623	ACACTA	2	12	2006021	2006032	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012623	TCTTGC	2	12	2006550	2006561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012623	TAAATA	2	12	2039718	2039729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012623	CTCATA	2	12	2065754	2065765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012623	TTTATA	2	12	2081841	2081852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012623	CAAGAA	2	12	2086696	2086707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012623	TTATAT	2	12	2087852	2087863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012623	CTATTT	2	12	2095798	2095809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012623	AATTTT	2	12	2101762	2101773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012623	TATAAA	2	12	2111834	2111845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012623	AATACG	2	12	2113111	2113122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012623	ACTTTC	2	12	2113194	2113205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012623	TTGGAA	2	12	2121378	2121389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012623	AATTTT	2	12	2126971	2126982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012623	TATTAA	2	12	2136736	2136747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012623	TGAAAA	2	12	2142120	2142131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012623	TAAATA	2	12	2146842	2146853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012623	GATCTC	2	12	2155923	2155934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012623	TCTTTC	2	12	2161785	2161796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012623	TAAAAT	2	12	2190183	2190194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012623	GTATGA	2	12	2198451	2198462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012623	AAATTA	2	12	2199099	2199110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012623	TATTTT	2	12	2216915	2216926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012623	TATTTA	2	12	2232578	2232589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012623	GCTTTA	2	12	2249740	2249751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_012623	AGATGT	2	12	2256203	2256214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012623	AATTTT	2	12	2259456	2259467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012623	AGGTAT	2	12	2267522	2267533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_012623	CCAGAT	2	12	2268135	2268146	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_012623	AAGAAA	2	12	2298900	2298911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012623	TAAATA	2	12	2302388	2302399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012623	TAGGGA	2	12	2310962	2310973	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012623	TTTACC	2	12	2314622	2314633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_012623	AAATAT	2	12	2346411	2346422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012623	AAAAAT	2	12	2371437	2371448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012623	ATTATA	2	12	2371600	2371611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012623	TTAAAA	2	12	2374449	2374460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012623	ATTTTT	2	12	2374629	2374640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.