MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 2438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012623	GTCAC	2	10	357	366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012623	GATAA	2	10	1237	1246	60 %	20 %	20 %	0 %	229580724
3	NC_012623	AGAGG	2	10	1307	1316	40 %	0 %	60 %	0 %	229580724
4	NC_012623	TCCTT	2	10	3846	3855	0 %	60 %	0 %	40 %	229580728
5	NC_012623	CGTTA	2	10	4089	4098	20 %	40 %	20 %	20 %	229580728
6	NC_012623	CTGTG	2	10	4520	4529	0 %	40 %	40 %	20 %	229580729
7	NC_012623	GTAAT	2	10	4666	4675	40 %	40 %	20 %	0 %	229580729
8	NC_012623	GTTTT	2	10	4740	4749	0 %	80 %	20 %	0 %	229580729
9	NC_012623	CTAAA	2	10	5083	5092	60 %	20 %	0 %	20 %	229580730
10	NC_012623	CTTAT	2	10	5289	5298	20 %	60 %	0 %	20 %	229580730
11	NC_012623	TTAAA	2	10	5884	5893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012623	ATGTT	2	10	6113	6122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012623	TGTGA	2	10	6147	6156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012623	TTTTC	2	10	6768	6777	0 %	80 %	0 %	20 %	229580731
15	NC_012623	TAATT	2	10	6855	6864	40 %	60 %	0 %	0 %	229580731
16	NC_012623	TCTTA	2	10	7163	7172	20 %	60 %	0 %	20 %	229580732
17	NC_012623	ATATA	2	10	8218	8227	60 %	40 %	0 %	0 %	229580734
18	NC_012623	GAAAT	2	10	9804	9813	60 %	20 %	20 %	0 %	229580735
19	NC_012623	TTATA	2	10	10159	10168	40 %	60 %	0 %	0 %	229580736
20	NC_012623	TCTTT	2	10	13136	13145	0 %	80 %	0 %	20 %	229580738
21	NC_012623	TACAC	2	10	13647	13656	40 %	20 %	0 %	40 %	229580738
22	NC_012623	CCATG	2	10	17216	17225	20 %	20 %	20 %	40 %	229580741
23	NC_012623	TTTCC	2	10	17320	17329	0 %	60 %	0 %	40 %	229580741
24	NC_012623	TAATT	2	10	17539	17548	40 %	60 %	0 %	0 %	229580741
25	NC_012623	TGGCT	2	10	21176	21185	0 %	40 %	40 %	20 %	229580744
26	NC_012623	TGAGT	2	10	21707	21716	20 %	40 %	40 %	0 %	229580745
27	NC_012623	AAGAG	2	10	24154	24163	60 %	0 %	40 %	0 %	229580748
28	NC_012623	CTATG	2	10	25262	25271	20 %	40 %	20 %	20 %	229580750
29	NC_012623	GAAGA	2	10	26564	26573	60 %	0 %	40 %	0 %	229580751
30	NC_012623	TATTT	2	10	26920	26929	20 %	80 %	0 %	0 %	229580751
31	NC_012623	AAAAT	2	10	27152	27161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012623	CTTTT	2	10	27640	27649	0 %	80 %	0 %	20 %	229580752
33	NC_012623	ATTAT	2	10	27819	27828	40 %	60 %	0 %	0 %	229580752
34	NC_012623	AGTTA	2	10	28363	28372	40 %	40 %	20 %	0 %	229580753
35	NC_012623	TTATC	2	10	29974	29983	20 %	60 %	0 %	20 %	229580755
36	NC_012623	TATCA	2	10	30077	30086	40 %	40 %	0 %	20 %	229580755
37	NC_012623	TTTCC	2	10	30925	30934	0 %	60 %	0 %	40 %	229580755
38	NC_012623	ATATG	2	10	31945	31954	40 %	40 %	20 %	0 %	229580756
39	NC_012623	TGTGG	2	10	32254	32263	0 %	40 %	60 %	0 %	229580757
40	NC_012623	CTTCT	2	10	33579	33588	0 %	60 %	0 %	40 %	229580758
41	NC_012623	GAAGG	2	10	35051	35060	40 %	0 %	60 %	0 %	229580760
42	NC_012623	CATAC	2	10	37262	37271	40 %	20 %	0 %	40 %	229580765
43	NC_012623	ATTAG	2	10	38401	38410	40 %	40 %	20 %	0 %	229580767
44	NC_012623	CTTTT	2	10	38428	38437	0 %	80 %	0 %	20 %	229580767
45	NC_012623	TGGTG	2	10	39034	39043	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012623	TTTTA	2	10	39219	39228	20 %	80 %	0 %	0 %	229580768
47	NC_012623	ATTAT	2	10	39396	39405	40 %	60 %	0 %	0 %	229580768
48	NC_012623	TACCT	2	10	41187	41196	20 %	40 %	0 %	40 %	229580770
49	NC_012623	AAGGA	2	10	41222	41231	60 %	0 %	40 %	0 %	229580770
50	NC_012623	ATTTG	2	10	42396	42405	20 %	60 %	20 %	0 %	229580772
51	NC_012623	AAGAT	2	10	45014	45023	60 %	20 %	20 %	0 %	229580776
52	NC_012623	TGAAT	2	10	45036	45045	40 %	40 %	20 %	0 %	229580776
53	NC_012623	TCTTT	2	10	46821	46830	0 %	80 %	0 %	20 %	229580778
54	NC_012623	TTTCT	2	10	47068	47077	0 %	80 %	0 %	20 %	229580778
55	NC_012623	TATAG	2	10	47855	47864	40 %	40 %	20 %	0 %	229580778
56	NC_012623	AAAGT	2	10	49838	49847	60 %	20 %	20 %	0 %	229580781
57	NC_012623	GATAA	2	10	51629	51638	60 %	20 %	20 %	0 %	229580783
58	NC_012623	TCTTT	2	10	53258	53267	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012623	TTCAT	2	10	53662	53671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012623	ATTTA	2	10	54578	54587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012623	TTTCT	2	10	54630	54639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012623	TACCT	2	10	57060	57069	20 %	40 %	0 %	40 %	229580786
63	NC_012623	CTGTA	2	10	57319	57328	20 %	40 %	20 %	20 %	229580786
64	NC_012623	ATTTA	2	10	57573	57582	40 %	60 %	0 %	0 %	229580786
65	NC_012623	CATTT	2	10	58235	58244	20 %	60 %	0 %	20 %	229580787
66	NC_012623	TAAAT	2	10	60117	60126	60 %	40 %	0 %	0 %	229580788
67	NC_012623	TAATT	2	10	60831	60840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012623	CAACA	2	10	60934	60943	60 %	0 %	0 %	40 %	229580790
69	NC_012623	AGCTA	2	10	62718	62727	40 %	20 %	20 %	20 %	229580791
70	NC_012623	ATCCC	2	10	64779	64788	20 %	20 %	0 %	60 %	229580793
71	NC_012623	AAGCC	2	10	66415	66424	40 %	0 %	20 %	40 %	229580795
72	NC_012623	GTTTT	2	10	71868	71877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012623	AGGAT	2	10	72450	72459	40 %	20 %	40 %	0 %	229580805
74	NC_012623	ATTGA	2	10	73149	73158	40 %	40 %	20 %	0 %	229580806
75	NC_012623	GGAAT	2	10	74910	74919	40 %	20 %	40 %	0 %	229580808
76	NC_012623	ACTTT	2	10	76411	76420	20 %	60 %	0 %	20 %	229580810
77	NC_012623	CTTAT	2	10	77884	77893	20 %	60 %	0 %	20 %	229580812
78	NC_012623	TCTTT	2	10	78428	78437	0 %	80 %	0 %	20 %	229580812
79	NC_012623	ATGTG	2	10	78868	78877	20 %	40 %	40 %	0 %	229580812
80	NC_012623	TTGAG	2	10	78907	78916	20 %	40 %	40 %	0 %	229580812
81	NC_012623	CTCTT	2	10	79816	79825	0 %	60 %	0 %	40 %	229580813
82	NC_012623	TCAGC	2	10	80517	80526	20 %	20 %	20 %	40 %	229580814
83	NC_012623	ATATG	2	10	81998	82007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012623	ATTTT	2	10	84146	84155	20 %	80 %	0 %	0 %	229580817
85	NC_012623	AGATT	2	10	88827	88836	40 %	40 %	20 %	0 %	229580822
86	NC_012623	TAGCA	2	10	89232	89241	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012623	CTATT	2	10	89297	89306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012623	ATATT	2	10	89721	89730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012623	TTTAA	2	10	91746	91755	40 %	60 %	0 %	0 %	229580823
90	NC_012623	CTAAT	2	10	92447	92456	40 %	40 %	0 %	20 %	229580824
91	NC_012623	AATTA	2	10	92742	92751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012623	CTTTA	2	10	92778	92787	20 %	60 %	0 %	20 %	229580825
93	NC_012623	TTAAG	2	10	94185	94194	40 %	40 %	20 %	0 %	229580827
94	NC_012623	ACGAT	2	10	94329	94338	40 %	20 %	20 %	20 %	229580827
95	NC_012623	AACGT	2	10	94379	94388	40 %	20 %	20 %	20 %	229580827
96	NC_012623	AGTCT	2	10	95905	95914	20 %	40 %	20 %	20 %	229580829
97	NC_012623	AGTTA	2	10	96712	96721	40 %	40 %	20 %	0 %	229580830
98	NC_012623	TCCAT	2	10	96945	96954	20 %	40 %	0 %	40 %	229580830
99	NC_012623	CTATC	2	10	97320	97329	20 %	40 %	0 %	40 %	229580831
100	NC_012623	TTTAG	2	10	97742	97751	20 %	60 %	20 %	0 %	229580831
101	NC_012623	TTTCT	2	10	97901	97910	0 %	80 %	0 %	20 %	229580831
102	NC_012623	CCAAT	2	10	99382	99391	40 %	20 %	0 %	40 %	229580833
103	NC_012623	TAAGT	2	10	99618	99627	40 %	40 %	20 %	0 %	229580833
104	NC_012623	ATGAT	2	10	99827	99836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012623	TTGAG	2	10	101002	101011	20 %	40 %	40 %	0 %	229580834
106	NC_012623	AAGAG	2	10	103643	103652	60 %	0 %	40 %	0 %	229580837
107	NC_012623	TTCTA	2	10	104374	104383	20 %	60 %	0 %	20 %	229580838
108	NC_012623	TACCT	2	10	109361	109370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012623	TTATT	3	15	110941	110955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012623	AAATT	2	10	112546	112555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012623	TTTAA	2	10	114186	114195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012623	TTTCC	2	10	116574	116583	0 %	60 %	0 %	40 %	229580853
113	NC_012623	AGTTA	2	10	119492	119501	40 %	40 %	20 %	0 %	229580855
114	NC_012623	AGAGA	2	10	119876	119885	60 %	0 %	40 %	0 %	229580855
115	NC_012623	AGATT	2	10	123154	123163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012623	GTTTG	2	10	124188	124197	0 %	60 %	40 %	0 %	229580859
117	NC_012623	TAAGG	2	10	124945	124954	40 %	20 %	40 %	0 %	229580860
118	NC_012623	GAATA	2	10	125032	125041	60 %	20 %	20 %	0 %	229580860
119	NC_012623	GGATT	2	10	125089	125098	20 %	40 %	40 %	0 %	229580860
120	NC_012623	TTTTA	2	10	125555	125564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012623	AAGTA	2	10	126217	126226	60 %	20 %	20 %	0 %	229580862
122	NC_012623	AATGT	2	10	126949	126958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012623	GATAT	2	10	127167	127176	40 %	40 %	20 %	0 %	229580863
124	NC_012623	TACCT	2	10	127280	127289	20 %	40 %	0 %	40 %	229580863
125	NC_012623	TATAA	2	10	128555	128564	60 %	40 %	0 %	0 %	229580864
126	NC_012623	TCTGT	2	10	128809	128818	0 %	60 %	20 %	20 %	229580865
127	NC_012623	TTTTC	2	10	129750	129759	0 %	80 %	0 %	20 %	229580865
128	NC_012623	ATGAT	2	10	129899	129908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012623	TTGAG	2	10	131074	131083	20 %	40 %	40 %	0 %	229580867
130	NC_012623	CATTT	2	10	132972	132981	20 %	60 %	0 %	20 %	229580869
131	NC_012623	ATCTT	2	10	134587	134596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012623	ATAGT	2	10	134750	134759	40 %	40 %	20 %	0 %	229580871
133	NC_012623	CCTCT	2	10	135145	135154	0 %	40 %	0 %	60 %	229580872
134	NC_012623	CTAAT	2	10	135315	135324	40 %	40 %	0 %	20 %	229580872
135	NC_012623	GGTAA	2	10	135494	135503	40 %	20 %	40 %	0 %	229580872
136	NC_012623	AGTAA	2	10	136383	136392	60 %	20 %	20 %	0 %	229580872
137	NC_012623	TTTAT	2	10	137111	137120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012623	TACTC	2	10	140387	140396	20 %	40 %	0 %	40 %	229580875
139	NC_012623	CTTAC	2	10	140765	140774	20 %	40 %	0 %	40 %	229580876
140	NC_012623	GTATG	2	10	142370	142379	20 %	40 %	40 %	0 %	229580878
141	NC_012623	TTTCC	2	10	142733	142742	0 %	60 %	0 %	40 %	229580878
142	NC_012623	AGGGA	2	10	143005	143014	40 %	0 %	60 %	0 %	229580879
143	NC_012623	CTCTT	2	10	143510	143519	0 %	60 %	0 %	40 %	229580880
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151	NC_012623	CGATA	2	10	154276	154285	40 %	20 %	20 %	20 %	229580888
152	NC_012623	ATTCT	2	10	155912	155921	20 %	60 %	0 %	20 %	229580890
153	NC_012623	ATATC	2	10	156513	156522	40 %	40 %	0 %	20 %	229580891
154	NC_012623	CTTTC	2	10	156752	156761	0 %	60 %	0 %	40 %	229580891
155	NC_012623	TTATT	2	10	157252	157261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012623	CATCT	2	10	157789	157798	20 %	40 %	0 %	40 %	229580892
157	NC_012623	CTCTT	2	10	158342	158351	0 %	60 %	0 %	40 %	229580892
158	NC_012623	AGAAT	2	10	159662	159671	60 %	20 %	20 %	0 %	229580893
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176	NC_012623	TGGCA	2	10	177550	177559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_012623	CATCT	2	10	178398	178407	20 %	40 %	0 %	40 %	229580915
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179	NC_012623	TACTC	2	10	179573	179582	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_012623	TAATT	2	10	181537	181546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_012623	TTATG	2	10	189261	189270	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_012623	TAATT	2	10	198661	198670	40 %	60 %	0 %	0 %	229580939
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253	NC_012623	ATGAT	2	10	266270	266279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_012623	TACCT	2	10	299502	299511	20 %	40 %	0 %	40 %	229581038
273	NC_012623	TAACT	2	10	301614	301623	40 %	40 %	0 %	20 %	229581039
274	NC_012623	TGAAG	2	10	302298	302307	40 %	20 %	40 %	0 %	229581040
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276	NC_012623	AGTAT	2	10	303289	303298	40 %	40 %	20 %	0 %	229581040
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279	NC_012623	ATGTT	2	10	303913	303922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_012623	GTAAG	2	10	305477	305486	40 %	20 %	40 %	0 %	229581043
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282	NC_012623	TAAGA	2	10	309230	309239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_012623	TTTCA	2	10	309664	309673	20 %	60 %	0 %	20 %	229581045
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291	NC_012623	GAGTA	2	10	318162	318171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_012623	TGGCA	2	10	418122	418131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
385	NC_012623	TTTTA	2	10	420628	420637	20 %	80 %	0 %	0 %	229581136
386	NC_012623	TTTCA	2	10	421718	421727	20 %	60 %	0 %	20 %	229581137
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390	NC_012623	AATAA	2	10	425132	425141	80 %	20 %	0 %	0 %	229581139
391	NC_012623	TACTA	2	10	425730	425739	40 %	40 %	0 %	20 %	229581140
392	NC_012623	TTATT	2	10	429017	429026	20 %	80 %	0 %	0 %	229581142
393	NC_012623	TGAGG	2	10	430041	430050	20 %	20 %	60 %	0 %	229581143
394	NC_012623	GAAGA	2	10	431415	431424	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
395	NC_012623	TATCA	2	10	436291	436300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
396	NC_012623	ATTTT	2	10	436678	436687	20 %	80 %	0 %	0 %	229581148
397	NC_012623	TTAAA	2	10	439702	439711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_012623	ACAAT	2	10	439942	439951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
399	NC_012623	TCCCC	2	10	443566	443575	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
400	NC_012623	TCAAG	2	10	444154	444163	40 %	20 %	20 %	20 %	229581151
401	NC_012623	CTTGA	2	10	445153	445162	20 %	40 %	20 %	20 %	229581152
402	NC_012623	AGGAT	2	10	446043	446052	40 %	20 %	40 %	0 %	229581153
403	NC_012623	TTATA	2	10	447633	447642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_012623	AGAGG	2	10	448124	448133	40 %	0 %	60 %	0 %	229581154
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