MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 33174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012623	TAT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580723
2	NC_012623	TAT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580723
3	NC_012623	ATT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580723
4	NC_012623	GTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580723
5	NC_012623	GTT	2	6	646	651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580723
6	NC_012623	CTT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580723
7	NC_012623	GGT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580724
8	NC_012623	TGC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580724
9	NC_012623	GAG	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580724
10	NC_012623	TGG	2	6	1143	1148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580724
11	NC_012623	TAT	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580724
12	NC_012623	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580724
13	NC_012623	TTA	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580724
14	NC_012623	ATC	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580724
15	NC_012623	ACG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580724
16	NC_012623	AAC	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580724
17	NC_012623	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580724
18	NC_012623	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580724
19	NC_012623	AGC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580724
20	NC_012623	TGG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580724
21	NC_012623	AAG	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580724
22	NC_012623	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580724
23	NC_012623	TAA	2	6	1797	1802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580724
24	NC_012623	AGA	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580724
25	NC_012623	ATA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580724
26	NC_012623	TGG	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580724
27	NC_012623	AAG	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580724
28	NC_012623	TGA	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580724
29	NC_012623	AGA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
30	NC_012623	AGA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
31	NC_012623	CTA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580725
32	NC_012623	GGA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580725
33	NC_012623	AAG	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
34	NC_012623	AAG	3	9	2239	2247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
35	NC_012623	GAA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
36	NC_012623	AAG	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580725
37	NC_012623	ATT	2	6	2288	2293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580725
38	NC_012623	ATT	2	6	2309	2314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580725
39	NC_012623	ATT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580725
40	NC_012623	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
41	NC_012623	TAT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580726
42	NC_012623	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
43	NC_012623	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
44	NC_012623	AGA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580726
45	NC_012623	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580726
46	NC_012623	ATT	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580726
47	NC_012623	GAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580726
48	NC_012623	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
49	NC_012623	TGC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580726
50	NC_012623	AAT	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
51	NC_012623	TGC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580726
52	NC_012623	GCA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580726
53	NC_012623	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580726
54	NC_012623	ATA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580726
55	NC_012623	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580727
56	NC_012623	AAG	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580727
57	NC_012623	ATC	3	9	3438	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580727
58	NC_012623	TAT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580727
59	NC_012623	AAC	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580727
60	NC_012623	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580727
61	NC_012623	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580727
62	NC_012623	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580728
63	NC_012623	CCA	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229580728
64	NC_012623	TCC	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580728
65	NC_012623	TTA	2	6	3872	3877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580728
66	NC_012623	TTG	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580728
67	NC_012623	TAT	3	9	3957	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580728
68	NC_012623	TAA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580728
69	NC_012623	TAG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580728
70	NC_012623	TCC	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580728
71	NC_012623	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580728
72	NC_012623	AAG	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580729
73	NC_012623	CCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229580729
74	NC_012623	AAT	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580729
75	NC_012623	AGG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580729
76	NC_012623	TCT	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580730
77	NC_012623	CTT	2	6	5047	5052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580730
78	NC_012623	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580730
79	NC_012623	CCT	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580730
80	NC_012623	CAT	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580730
81	NC_012623	TCT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580730
82	NC_012623	ATC	2	6	5408	5413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580730
83	NC_012623	CTT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580730
84	NC_012623	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580730
85	NC_012623	TCA	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580731
86	NC_012623	ATC	2	6	6330	6335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580731
87	NC_012623	TTA	2	6	6416	6421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580731
88	NC_012623	GTT	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580731
89	NC_012623	GAA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580731
90	NC_012623	TAT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580731
91	NC_012623	TCT	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580731
92	NC_012623	TCT	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580731
93	NC_012623	TCT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580731
94	NC_012623	TGT	2	6	6731	6736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580731
95	NC_012623	TCA	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580731
96	NC_012623	CTA	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580731
97	NC_012623	GAT	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580731
98	NC_012623	GTA	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580732
99	NC_012623	TCC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580732
100	NC_012623	CTT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580732
101	NC_012623	TGG	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580732
102	NC_012623	TTC	2	6	7259	7264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580732
103	NC_012623	CTG	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580732
104	NC_012623	CTT	2	6	7347	7352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580733
105	NC_012623	ACT	3	9	7384	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580733
106	NC_012623	CTA	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580733
107	NC_012623	CTT	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580733
108	NC_012623	ATC	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580733
109	NC_012623	TTC	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580733
110	NC_012623	AAC	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580733
111	NC_012623	TAA	2	6	7553	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580733
112	NC_012623	TAG	2	6	7578	7583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580733
113	NC_012623	TAT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580733
114	NC_012623	ATA	2	6	7745	7750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580734
115	NC_012623	TTG	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580734
116	NC_012623	CTT	2	6	7803	7808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580734
117	NC_012623	GGA	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580734
118	NC_012623	ACT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580734
119	NC_012623	TCA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580734
120	NC_012623	ATA	2	6	8028	8033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580734
121	NC_012623	ACA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580734
122	NC_012623	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580734
123	NC_012623	GGT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580734
124	NC_012623	GGA	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580734
125	NC_012623	GGT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580734
126	NC_012623	AGT	2	6	8369	8374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580734
127	NC_012623	TAT	2	6	8387	8392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580734
128	NC_012623	GGC	2	6	8455	8460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229580734
129	NC_012623	TAT	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580734
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131	NC_012623	AGT	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580734
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258	NC_012623	TTC	2	6	18193	18198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580742
259	NC_012623	TTA	2	6	18276	18281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580742
260	NC_012623	AAT	2	6	18287	18292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580742
261	NC_012623	AAT	2	6	18416	18421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580742
262	NC_012623	TAT	2	6	18427	18432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580742
263	NC_012623	TTC	2	6	18480	18485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580742
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265	NC_012623	TGG	2	6	18520	18525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580742
266	NC_012623	CAA	2	6	18564	18569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580742
267	NC_012623	TTC	2	6	18597	18602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580742
268	NC_012623	TAT	2	6	18678	18683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580742
269	NC_012623	ATC	2	6	18818	18823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580743
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273	NC_012623	TGG	2	6	19119	19124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580743
274	NC_012623	TCC	2	6	19134	19139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580743
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280	NC_012623	CTA	2	6	19406	19411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580743
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282	NC_012623	TAT	2	6	19462	19467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580743
283	NC_012623	TGG	2	6	19488	19493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580743
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