MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012590	CATAGC	2	12	8791	8802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012590	ACGCTT	2	12	58540	58551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012590	CTTCGG	2	12	224935	224946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012590	CGGCCT	2	12	226858	226869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012590	CTTTTT	2	12	351949	351960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012590	AGCGCG	2	12	358422	358433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012590	AAAGGA	2	12	430343	430354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012590	CGAGAA	2	12	442689	442700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012590	GAAAGT	2	12	449875	449886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012590	CAGGGG	2	12	493869	493880	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012590	CAAGGT	2	12	509858	509869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012590	CAGCTC	2	12	590557	590568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012590	ATTTTC	2	12	605497	605508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012590	GATTCG	2	12	624259	624270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012590	GAGGGG	2	12	697029	697040	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012590	GAACTT	2	12	785465	785476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012590	GCAAGG	2	12	796250	796261	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012590	ATGTTC	2	12	833792	833803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012590	AGGGGG	2	12	845819	845830	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012590	ATCAGA	2	12	893702	893713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012590	GTGGAT	2	12	908455	908466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012590	CTCTAG	2	12	988520	988531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012590	GCCCCC	2	12	995572	995583	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_012590	TTCAGC	2	12	1015504	1015515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012590	CTAGGT	2	12	1015627	1015638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012590	TAGGGG	2	12	1074455	1074466	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012590	GGACGG	2	12	1124777	1124788	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012590	TTTGGC	2	12	1137835	1137846	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012590	AAGGCA	2	12	1144651	1144662	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012590	AAACTG	2	12	1202725	1202736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012590	CGGTGG	2	12	1268876	1268887	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012590	AGGAAG	2	12	1305741	1305752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012590	CTTTAG	2	12	1331446	1331457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012590	ATCAAC	2	12	1360845	1360856	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012590	TTGCTT	2	12	1371758	1371769	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012590	AGCGAG	2	12	1392250	1392261	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012590	ATATGG	2	12	1419131	1419142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012590	CCCCAC	2	12	1455045	1455056	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
39	NC_012590	AGAAAA	2	12	1484374	1484385	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012590	GCCCCA	3	18	1510278	1510295	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012590	TAAAGC	2	12	1566382	1566393	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012590	ATGCAT	2	12	1588610	1588621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012590	GCAGAA	2	12	1707496	1707507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012590	ATCCCT	2	12	1712303	1712314	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012590	AAGAGG	2	12	1728353	1728364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012590	CACGGG	2	12	1740505	1740516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012590	GGTATT	2	12	1783627	1783638	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012590	TCAAAA	2	12	1904490	1904501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012590	CTGTCG	2	12	1937684	1937695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012590	ACAGCA	2	12	2045722	2045733	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012590	GCGTGG	2	12	2046495	2046506	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012590	CGGGTT	2	12	2074636	2074647	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012590	ACCATG	2	12	2156690	2156701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012590	TCAGCC	2	12	2166108	2166119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012590	GTTGAA	2	12	2189335	2189346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012590	TCACGC	2	12	2200525	2200536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012590	GCGTGA	2	12	2200880	2200891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012590	CGCATT	2	12	2216384	2216395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012590	AAACAA	2	12	2268701	2268712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012590	CAGAAA	2	12	2307958	2307969	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012590	CAGAAA	2	12	2378713	2378724	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012590	CCGTGG	2	12	2383669	2383680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012590	CCTGTG	2	12	2391272	2391283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012590	CCACCT	2	12	2567769	2567780	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_012590	TTTTAC	2	12	2568162	2568173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012590	AAGTTT	2	12	2604488	2604499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012590	GACCAC	2	12	2633829	2633840	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012590	CTTTGC	2	12	2682627	2682638	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012590	GTCTAT	2	12	2688263	2688274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012590	CTCAGC	2	12	2766536	2766547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.