MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012588	ATGAGG	2	12	1087	1098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227826413
2	NC_012588	GTATTG	2	12	1981	1992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227826413
3	NC_012588	AATTGC	2	12	3081	3092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826415
4	NC_012588	TTTAAG	2	12	3364	3375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826416
5	NC_012588	CCTCTG	2	12	4500	4511	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227826418
6	NC_012588	ATTGAT	2	12	5008	5019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826419
7	NC_012588	TAGTCT	2	12	5319	5330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826419
8	NC_012588	CAATGG	2	12	8391	8402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227826423
9	NC_012588	TCTATA	2	12	10333	10344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826425
10	NC_012588	TATTCG	2	12	13527	13538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826427
11	NC_012588	GTATTT	2	12	18076	18087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227826431
12	NC_012588	CTATTC	2	12	18255	18266	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826431
13	NC_012588	TCCTCT	2	12	29559	29570	0 %	50 %	0 %	50 %	227826443
14	NC_012588	TTGATT	2	12	31603	31614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227826445
15	NC_012588	AGTGCA	2	12	31696	31707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227826445
16	NC_012588	TAAGAC	2	12	34591	34602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227826449
17	NC_012588	ACGTCT	2	12	34872	34883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227826449
18	NC_012588	TTTATC	2	12	36553	36564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826452
19	NC_012588	TCAGCT	2	12	38187	38198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227826455
20	NC_012588	AAGAAA	2	12	39884	39895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227826457
21	NC_012588	CATTGG	2	12	40202	40213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227826458
22	NC_012588	CTTAAA	2	12	44055	44066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227826463
23	NC_012588	ATATTC	2	12	44105	44116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826463
24	NC_012588	GGTGAG	2	12	45297	45308	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	227826465
25	NC_012588	CTTTCT	2	12	47523	47534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227826467
26	NC_012588	GTTTTC	2	12	50033	50044	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227826470
27	NC_012588	TAAAAT	2	12	50108	50119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227826470
28	NC_012588	TCTAAT	2	12	54154	54165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826474
29	NC_012588	TCTTTT	2	12	54339	54350	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227826474
30	NC_012588	CCTCGT	2	12	55603	55614	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227826475
31	NC_012588	CTTAAT	2	12	59330	59341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826478
32	NC_012588	GAGCTG	2	12	59832	59843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227826478
33	NC_012588	TGATGC	2	12	60088	60099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227826478
34	NC_012588	AAATGT	2	12	60239	60250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227826478
35	NC_012588	ATAGTC	2	12	65017	65028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826483
36	NC_012588	CTAGTA	2	12	65825	65836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826484
37	NC_012588	CCGATA	2	12	76139	76150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227826499
38	NC_012588	TTTCAT	2	12	78697	78708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826502
39	NC_012588	TAGCAT	2	12	82546	82557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826506
40	NC_012588	ACTTTT	2	12	90237	90248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826513
41	NC_012588	AATGTA	2	12	90615	90626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227826513
42	NC_012588	CTCATT	2	12	96331	96342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826520
43	NC_012588	AAAGCC	2	12	97045	97056	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227826521
44	NC_012588	TCTCTA	2	12	105006	105017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826528
45	NC_012588	GTATTA	2	12	107337	107348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826531
46	NC_012588	CCAATA	2	12	107687	107698	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227826532
47	NC_012588	TATGCT	2	12	108351	108362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826532
48	NC_012588	TTACAA	2	12	110193	110204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227826535
49	NC_012588	AGTATT	2	12	111851	111862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826536
50	NC_012588	GTTATA	2	12	113453	113464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826539
51	NC_012588	TAAACA	2	12	116243	116254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227826542
52	NC_012588	TAGAGA	2	12	116393	116404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826542
53	NC_012588	CACATC	2	12	123399	123410	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227826549
54	NC_012588	TAAGAG	2	12	124643	124654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826551
55	NC_012588	CTATCC	2	12	124747	124758	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	227826551
56	NC_012588	GTAATT	2	12	126615	126626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826553
57	NC_012588	TGGTAT	2	12	128263	128274	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227826555
58	NC_012588	GCTAAA	2	12	131572	131583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227826561
59	NC_012588	TTAGCT	2	12	136174	136185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826565
60	NC_012588	TAGGAA	2	12	138707	138718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826567
61	NC_012588	TGGTAA	2	12	140401	140412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227826569
62	NC_012588	GGTAGT	2	12	148405	148416	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227826578
63	NC_012588	CTAGAG	2	12	148997	149008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227826579
64	NC_012588	CATCTT	2	12	152733	152744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826584
65	NC_012588	TGGAAA	2	12	154772	154783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826587
66	NC_012588	AATGAT	2	12	157702	157713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227826590
67	NC_012588	ATAAGG	2	12	158315	158326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826590
68	NC_012588	TTTCTG	2	12	159266	159277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227826591
69	NC_012588	ATTTCT	2	12	167644	167655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826599
70	NC_012588	TAAGGA	2	12	171068	171079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826603
71	NC_012588	TTCCTC	2	12	173427	173438	0 %	50 %	0 %	50 %	227826606
72	NC_012588	GGAGAA	2	12	184380	184391	50 %	0 %	50 %	0 %	227826621
73	NC_012588	ATTCTC	2	12	187490	187501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826624
74	NC_012588	CAAAGG	2	12	189728	189739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227826626
75	NC_012588	GGCTAA	2	12	190061	190072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227826626
76	NC_012588	TTCTAT	2	12	190395	190406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826627
77	NC_012588	TGAGGA	2	12	191626	191637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227826628
78	NC_012588	AATGGT	2	12	192034	192045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227826628
79	NC_012588	ACTTTT	2	12	194180	194191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826632
80	NC_012588	GAATAA	2	12	197333	197344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227826638
81	NC_012588	TAATTC	2	12	203123	203134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826644
82	NC_012588	TCTATA	2	12	203206	203217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826644
83	NC_012588	AGGTTT	2	12	206152	206163	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227826648
84	NC_012588	TCCAAA	2	12	208353	208364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227826650
85	NC_012588	TTCCAG	2	12	208781	208792	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227826650
86	NC_012588	AATTAA	2	12	213749	213760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227826657
87	NC_012588	AGTTTT	2	12	216356	216367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227826660
88	NC_012588	TTTACC	2	12	219331	219342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227826661
89	NC_012588	TATTTT	2	12	219895	219906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227826662
90	NC_012588	CAGAAG	2	12	221186	221197	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227826663
91	NC_012588	GCTGGA	2	12	222455	222466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227826664
92	NC_012588	GCTATT	2	12	223884	223895	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826665
93	NC_012588	GTAATC	2	12	232318	232329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826675
94	NC_012588	GAAGAG	2	12	234068	234079	50 %	0 %	50 %	0 %	227826677
95	NC_012588	AATTAA	2	12	234081	234092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227826677
96	NC_012588	AAAGAA	2	12	239131	239142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227826682
97	NC_012588	TATAGG	2	12	240921	240932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227826684
98	NC_012588	TATGGG	2	12	241158	241169	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227826684
99	NC_012588	GTAGCG	2	12	241793	241804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227826685
100	NC_012588	TATTGT	2	12	242893	242904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227826687
101	NC_012588	GTTATA	2	12	243654	243665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227826688
102	NC_012588	TAATCT	2	12	244540	244551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826689
103	NC_012588	AAGTTG	2	12	247645	247656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227826693
104	NC_012588	TTCTAT	2	12	259323	259334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227826704
105	NC_012588	AATAGG	2	12	259649	259660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227826704
106	NC_012588	AGTTAC	2	12	262675	262686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826708
107	NC_012588	GAATAA	2	12	264137	264148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227826709
108	NC_012588	TTTTTA	2	12	268313	268324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227826712
109	NC_012588	TTCATG	2	12	271820	271831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826713
110	NC_012588	CTAATG	2	12	272181	272192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826714
111	NC_012588	AAGAGA	2	12	276673	276684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227826717
112	NC_012588	TACCGT	2	12	276955	276966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227826718
113	NC_012588	TTACTG	2	12	278479	278490	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227826719
114	NC_012588	TTAATC	2	12	282572	282583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227826724
115	NC_012588	GAGTAG	2	12	291222	291233	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227826735
116	NC_012588	AGGTTA	2	12	295364	295375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227826739
117	NC_012588	GCAATT	2	12	313304	313315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227826757
118	NC_012588	ATGAAA	2	12	313861	313872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227826757
119	NC_012588	TTTCTC	2	12	319487	319498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227826762
120	NC_012588	GTTGTC	2	12	324710	324721	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227826770
121	NC_012588	TCCCCT	2	12	327091	327102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227826773
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216	NC_012588	AAGAGG	2	12	616258	616269	50 %	0 %	50 %	0 %	227827005
217	NC_012588	AAATTT	2	12	617282	617293	50 %	50 %	0 %	0 %	227827006
218	NC_012588	GATGCT	2	12	618623	618634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227827008
219	NC_012588	TTAATG	2	12	634595	634606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227827023
220	NC_012588	ATAGGA	2	12	635971	635982	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227827024
221	NC_012588	TTGGTG	2	12	636997	637008	0 %	50 %	50 %	0 %	227827025
222	NC_012588	ATAGCT	2	12	637722	637733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227827025
223	NC_012588	GCAATA	2	12	638016	638027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227827025
224	NC_012588	CATAGG	2	12	639035	639046	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227827027
225	NC_012588	AATAGC	2	12	639214	639225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227827027
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228	NC_012588	AGGAAT	2	12	647032	647043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227827037
229	NC_012588	AGGATT	2	12	649949	649960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227827041
230	NC_012588	TAAAGT	2	12	650179	650190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227827041
231	NC_012588	GATCTT	2	12	652089	652100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227827042
232	NC_012588	ACATGG	2	12	655954	655965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227827044
233	NC_012588	CATGAG	2	12	659417	659428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227827046
234	NC_012588	ACTATT	2	12	662635	662646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227827049
235	NC_012588	TATAAG	2	12	670258	670269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227827054
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237	NC_012588	AAGGAA	2	12	682056	682067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227827067
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239	NC_012588	CTCATT	2	12	684932	684943	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227827072
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250	NC_012588	CTAATG	2	12	750950	750961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227827130
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323	NC_012588	CCCTAG	2	12	1020290	1020301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227827354
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330	NC_012588	GCTCAA	2	12	1051941	1051952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227827385
331	NC_012588	AAAGGG	2	12	1053732	1053743	50 %	0 %	50 %	0 %	227827387
332	NC_012588	TATCAA	2	12	1054741	1054752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227827389
333	NC_012588	TAGACT	2	12	1055236	1055247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227827390
334	NC_012588	AATATT	2	12	1056540	1056551	50 %	50 %	0 %	0 %	227827391
335	NC_012588	CTCACC	2	12	1056564	1056575	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	227827391
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337	NC_012588	TGTATA	2	12	1062999	1063010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227827401
338	NC_012588	ATATGT	2	12	1064581	1064592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227827405
339	NC_012588	CTTGCT	2	12	1066765	1066776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227827408
340	NC_012588	TTTTCA	2	12	1067465	1067476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227827410
341	NC_012588	TGGAAG	2	12	1070920	1070931	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227827412
342	NC_012588	GGATGA	2	12	1072430	1072441	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227827413
343	NC_012588	AACCTT	2	12	1075262	1075273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227827417
344	NC_012588	AATAGG	2	12	1076359	1076370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227827418
345	NC_012588	TGCTTT	2	12	1079160	1079171	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227827422
346	NC_012588	ATTGAT	2	12	1081942	1081953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227827425
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348	NC_012588	ATTCTT	2	12	1086815	1086826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227827429
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459	NC_012588	TACGTT	2	12	1424371	1424382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227827796
460	NC_012588	AAACTA	2	12	1430568	1430579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227827804
461	NC_012588	AAGGTA	2	12	1432724	1432735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227827807
462	NC_012588	GAAATT	2	12	1434001	1434012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227827808
463	NC_012588	TACCTA	2	12	1435321	1435332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227827809
464	NC_012588	AGCCAT	2	12	1436714	1436725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227827809
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