MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 1401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012587	AAGC	2	8	165	172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012587	GGTT	2	8	1709	1716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012587	GATC	2	8	4016	4023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012587	AAAC	2	8	4922	4929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012587	CCGC	2	8	5705	5712	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_012587	AATG	2	8	11197	11204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012587	GCAC	2	8	21485	21492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012587	CGGG	2	8	27428	27435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012587	TTTA	2	8	27700	27707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012587	TGGG	2	8	38135	38142	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012587	ACCG	2	8	40565	40572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012587	CCGC	2	8	41361	41368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_012587	GAAA	2	8	48277	48284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012587	GCCC	2	8	48364	48371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_012587	TGCC	2	8	50035	50042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012587	GACC	2	8	57544	57551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012587	CAAA	2	8	68416	68423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012587	CGGC	2	8	75031	75038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012587	TGAC	2	8	75185	75192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012587	ACGA	2	8	76165	76172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012587	AGGG	2	8	76201	76208	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012587	GTGC	2	8	78100	78107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012587	TTGT	2	8	82902	82909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012587	CGCT	2	8	83674	83681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012587	GCCA	2	8	84972	84979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012587	CTGC	2	8	86782	86789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012587	GCCG	2	8	91650	91657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012587	CCGT	2	8	91703	91710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012587	GCAC	2	8	95697	95704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012587	TGCC	2	8	97793	97800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012587	GGGC	2	8	99889	99896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012587	CATC	2	8	107761	107768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012587	CCCG	2	8	109060	109067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_012587	TTTC	2	8	109080	109087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012587	CGGC	2	8	109173	109180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012587	CGAA	2	8	111135	111142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012587	CGAA	2	8	115393	115400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012587	ATTT	2	8	117643	117650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012587	TTGA	2	8	117675	117682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012587	CGGC	2	8	121675	121682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012587	GCCT	2	8	124686	124693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012587	CCCG	2	8	124771	124778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_012587	CGCC	2	8	126687	126694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_012587	AACG	2	8	128476	128483	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012587	TCCC	2	8	128507	128514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_012587	GCAG	3	12	128632	128643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012587	AGGA	2	8	128779	128786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012587	CTAC	2	8	139480	139487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012587	TCAA	2	8	139528	139535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012587	AAAG	2	8	139771	139778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012587	CATC	2	8	139888	139895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012587	TGGG	2	8	140945	140952	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012587	TCAA	2	8	141428	141435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012587	GAAT	2	8	141779	141786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012587	CGAG	2	8	143110	143117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012587	TGCC	2	8	143625	143632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012587	GTCA	2	8	151770	151777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012587	ACTA	2	8	151875	151882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012587	TAGA	2	8	151887	151894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012587	GCGG	2	8	151946	151953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012587	GGAA	2	8	154516	154523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012587	ATGG	2	8	154924	154931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012587	GGCC	2	8	159624	159631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012587	CGGC	2	8	162264	162271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012587	AGAA	2	8	170079	170086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012587	TCCG	2	8	178457	178464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012587	CGGG	2	8	180048	180055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012587	GACC	2	8	181565	181572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012587	CAGG	2	8	181641	181648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012587	AATC	2	8	183105	183112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012587	AGCG	2	8	183267	183274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012587	CCGC	2	8	183884	183891	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_012587	CGGT	2	8	189403	189410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012587	TGAA	2	8	189521	189528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012587	CCCG	2	8	193578	193585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_012587	CGGT	2	8	193634	193641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012587	CCCG	2	8	196914	196921	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_012587	GACG	2	8	201303	201310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012587	GGGA	2	8	205663	205670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012587	GCGG	2	8	210797	210804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012587	CGGG	2	8	210894	210901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012587	CGTG	2	8	210935	210942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012587	CGAT	2	8	212226	212233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012587	TGCC	2	8	214137	214144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012587	GCCA	2	8	214249	214256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012587	GGCC	2	8	229127	229134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012587	CCTG	2	8	234187	234194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012587	GCGG	2	8	234296	234303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012587	ATCG	2	8	244926	244933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012587	CCGG	2	8	244971	244978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012587	TGAT	2	8	245008	245015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012587	GCCG	2	8	245037	245044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012587	ATCG	2	8	245695	245702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012587	CCGG	2	8	247082	247089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012587	GAAA	2	8	247098	247105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012587	CGGC	2	8	247624	247631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012587	ATTC	2	8	251760	251767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012587	GCTG	2	8	253033	253040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012587	AGGA	2	8	253438	253445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012587	GCGG	2	8	253579	253586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012587	GGAT	2	8	255028	255035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012587	CGCT	2	8	257776	257783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012587	CGCT	2	8	259317	259324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012587	ATTT	2	8	259498	259505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012587	TGCG	2	8	266239	266246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012587	TGAA	2	8	266407	266414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012587	GCCC	2	8	266702	266709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_012587	GTCG	2	8	266791	266798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012587	CAGA	2	8	271558	271565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012587	GCTG	2	8	271778	271785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012587	GCAA	2	8	280070	280077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012587	ACGC	2	8	280363	280370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012587	CCCG	2	8	280373	280380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_012587	TCGA	2	8	281624	281631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012587	TGCT	2	8	281679	281686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012587	AGCC	2	8	285238	285245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012587	TCAA	2	8	285307	285314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012587	GATG	2	8	292858	292865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012587	GTTG	2	8	293217	293224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012587	CAAG	2	8	293267	293274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012587	GGCC	2	8	301520	301527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012587	TCGA	2	8	303982	303989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012587	ACCG	2	8	304052	304059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012587	GCAA	2	8	304555	304562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012587	GCGG	2	8	304635	304642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012587	CCTC	2	8	307944	307951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_012587	CGGC	2	8	307977	307984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012587	AAGC	2	8	313430	313437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012587	CCGG	2	8	313457	313464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012587	ATTC	2	8	320975	320982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012587	AATT	2	8	323093	323100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012587	GGCG	2	8	326925	326932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012587	GCAA	2	8	344702	344709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012587	CGTC	2	8	344831	344838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012587	CGGG	3	12	344880	344891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012587	GCGG	2	8	348663	348670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012587	CGGG	2	8	353890	353897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012587	AGGA	2	8	363476	363483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012587	TACA	2	8	366842	366849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012587	CGGC	2	8	367767	367774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012587	CGGC	2	8	367778	367785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012587	GCGG	2	8	374609	374616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012587	GGCT	2	8	374628	374635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012587	CAAG	2	8	378720	378727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012587	GAGT	2	8	392444	392451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012587	AAGC	2	8	393353	393360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012587	TCGC	2	8	398709	398716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012587	ATCG	2	8	399306	399313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012587	GCAG	2	8	399633	399640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012587	CCGG	2	8	401974	401981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012587	TTGA	2	8	402326	402333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012587	GAAG	2	8	1299669	1299676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_012587	GCCG	2	8	1316661	1316668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_012587	ACGC	2	8	1318773	1318780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_012587	TCGA	2	8	1322208	1322215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_012587	CCCG	2	8	1322233	1322240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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495	NC_012587	AATC	2	8	1322294	1322301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_012587	GGGA	2	8	1323852	1323859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_012587	GTCC	2	8	1326917	1326924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_012587	TTGC	2	8	1329678	1329685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_012587	CAGG	2	8	1330080	1330087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_012587	GCCA	2	8	1334031	1334038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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