MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 40899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012586	TTG	2	6	21	26	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012586	GCC	2	6	27	32	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012586	TAA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012586	GCC	2	6	64	69	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012586	GCC	2	6	121	126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012586	GCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012586	ATG	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
8	NC_012586	AGA	2	6	345	350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818259
9	NC_012586	TCT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818259
10	NC_012586	AGA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818259
11	NC_012586	CGG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
12	NC_012586	GGC	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
13	NC_012586	CCG	2	6	523	528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
14	NC_012586	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818259
15	NC_012586	CCG	2	6	571	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
16	NC_012586	TGA	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
17	NC_012586	GAC	3	9	634	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818259
18	NC_012586	CGG	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
19	NC_012586	TCG	2	6	984	989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
20	NC_012586	CGC	2	6	1002	1007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
21	NC_012586	CGT	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
22	NC_012586	CGG	2	6	1147	1152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
23	NC_012586	TGC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
24	NC_012586	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
25	NC_012586	GCT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
26	NC_012586	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
27	NC_012586	GAG	2	6	1619	1624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818260
28	NC_012586	TCA	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
29	NC_012586	ACA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818260
30	NC_012586	GGC	2	6	1833	1838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
31	NC_012586	GGC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
32	NC_012586	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
33	NC_012586	CGA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818260
34	NC_012586	AAC	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818260
35	NC_012586	CAT	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
36	NC_012586	GGC	2	6	2038	2043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
37	NC_012586	GAT	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818260
38	NC_012586	CGT	2	6	2062	2067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
39	NC_012586	GCC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818260
40	NC_012586	ATC	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
41	NC_012586	CCT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818260
42	NC_012586	GCC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818260
43	NC_012586	TCG	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
44	NC_012586	GAC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818260
45	NC_012586	GGC	3	9	2365	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
46	NC_012586	CGT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012586	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012586	GAC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
49	NC_012586	CCG	2	6	2693	2698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
50	NC_012586	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818261
51	NC_012586	GCC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
52	NC_012586	CGC	2	6	2948	2953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
53	NC_012586	GGC	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818261
54	NC_012586	GCC	2	6	3080	3085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
55	NC_012586	AGC	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
56	NC_012586	GCT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818261
57	NC_012586	CTC	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818261
58	NC_012586	AGC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
59	NC_012586	CCA	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818261
60	NC_012586	GAT	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818261
61	NC_012586	TCA	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818261
62	NC_012586	CGC	2	6	3566	3571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
63	NC_012586	TTC	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818261
64	NC_012586	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818261
65	NC_012586	GTG	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818261
66	NC_012586	GGC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818261
67	NC_012586	GCA	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
68	NC_012586	AGG	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818261
69	NC_012586	ACT	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012586	ACC	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012586	CAT	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
72	NC_012586	CGG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818262
73	NC_012586	CCA	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818262
74	NC_012586	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
75	NC_012586	GAA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818262
76	NC_012586	CTG	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
77	NC_012586	GAG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818262
78	NC_012586	CGT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
79	NC_012586	TCT	2	6	4506	4511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
80	NC_012586	TTC	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
81	NC_012586	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
82	NC_012586	GAC	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
83	NC_012586	CGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
84	NC_012586	GAG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818262
85	NC_012586	CTT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
86	NC_012586	GCT	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
87	NC_012586	CGA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
88	NC_012586	TTG	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818262
89	NC_012586	ACG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
90	NC_012586	TCA	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
91	NC_012586	CGC	2	6	5113	5118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
92	NC_012586	TCA	3	9	5145	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
93	NC_012586	GCA	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
94	NC_012586	GCC	2	6	5171	5176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
95	NC_012586	ACG	2	6	5190	5195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
96	NC_012586	GAC	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
97	NC_012586	TTG	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818263
98	NC_012586	GTC	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
99	NC_012586	TTC	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
100	NC_012586	CGG	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
101	NC_012586	GGC	2	6	5727	5732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
102	NC_012586	TTC	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
103	NC_012586	GCT	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
104	NC_012586	GCC	2	6	5845	5850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818263
105	NC_012586	TGA	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818263
106	NC_012586	TGC	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
107	NC_012586	CCT	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818263
108	NC_012586	ATC	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818263
109	NC_012586	CGT	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
110	NC_012586	TCT	2	6	6260	6265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
111	NC_012586	GCG	2	6	6272	6277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
112	NC_012586	GGA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818263
113	NC_012586	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818263
114	NC_012586	TCC	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_012586	TGA	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012586	CCG	2	6	6755	6760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012586	TCG	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012586	CTG	2	6	6875	6880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012586	GCG	2	6	7096	7101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818264
120	NC_012586	GGC	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818264
121	NC_012586	TGC	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818264
122	NC_012586	TAG	2	6	7209	7214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818264
123	NC_012586	GAA	2	6	7271	7276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818264
124	NC_012586	GCT	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818264
125	NC_012586	TCG	2	6	7329	7334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818264
126	NC_012586	CGT	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818264
127	NC_012586	CAC	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818264
128	NC_012586	GAA	2	6	7481	7486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818264
129	NC_012586	CGA	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818264
130	NC_012586	GAC	2	6	7508	7513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818264
131	NC_012586	GCG	2	6	7621	7626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818264
132	NC_012586	GGC	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818264
133	NC_012586	TGA	2	6	7735	7740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818264
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136	NC_012586	CCG	2	6	7881	7886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_012586	GCG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012586	GCG	2	6	8036	8041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012586	CGG	2	6	8044	8049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012586	GCT	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818265
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166	NC_012586	ACG	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818266
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199	NC_012586	GGA	2	6	11257	11262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_012586	CCG	2	6	14429	14434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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253	NC_012586	GCC	2	6	14632	14637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818271
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369	NC_012586	GCC	2	6	19769	19774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818275
370	NC_012586	TCG	2	6	19964	19969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818275
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372	NC_012586	CCT	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
373	NC_012586	CCT	2	6	20262	20267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
374	NC_012586	TCA	2	6	20323	20328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818276
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376	NC_012586	CCT	2	6	20463	20468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818276
377	NC_012586	AGC	2	6	20471	20476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818276
378	NC_012586	GTG	2	6	20515	20520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818276
379	NC_012586	GAG	2	6	20527	20532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818276
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