MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	CGGTAT	2	12	8331	8342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012583	TTCATA	2	12	48319	48330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012583	AATAAA	2	12	86551	86562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012583	ACCGCC	2	12	133192	133203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012583	ACCCGT	2	12	160432	160443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012583	GTTCAT	2	12	160967	160978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012583	ATATTT	2	12	180085	180096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012583	AAGTGA	2	12	195292	195303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012583	TGTTGA	2	12	196490	196501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012583	TTATTT	2	12	202009	202020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012583	CAAGAG	2	12	249090	249101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012583	CCGGCA	2	12	272924	272935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012583	GAAGGA	2	12	278834	278845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012583	GATGGA	2	12	293563	293574	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012583	GTTTGA	2	12	363272	363283	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012583	GTTTGG	2	12	365445	365456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012583	GTTTGG	2	12	379110	379121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012583	GGTTGT	2	12	396857	396868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012583	GTTTGG	2	12	423586	423597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012583	TTTGTT	2	12	443635	443646	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012583	TCAAAA	2	12	457640	457651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012583	TGGTTT	2	12	501002	501013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012583	CAGTGT	2	12	517839	517850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012583	AGGGGG	2	12	531106	531117	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012583	GTTTGT	2	12	568368	568379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012583	TATTTG	2	12	572744	572755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012583	TTTCAG	2	12	608929	608940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012583	ATAACC	2	12	619004	619015	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012583	CCACTA	2	12	727456	727467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012583	CAATAA	2	12	850580	850591	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012583	AAATTA	2	12	871254	871265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012583	TTATTG	2	12	883853	883864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012583	GTCAAG	2	12	886709	886720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012583	TATCTC	2	12	950488	950499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012583	AATCAC	2	12	979512	979523	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012583	TAGAAA	2	12	1025390	1025401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012583	AAAATT	2	12	1054774	1054785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012583	AAAATG	2	12	1067003	1067014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012583	TCCGCT	2	12	1078433	1078444	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.