MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	227119190
2	NC_012583	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	227119190
3	NC_012583	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	227119190
4	NC_012583	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	227119191
5	NC_012583	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	227119195
6	NC_012583	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	227119196
7	NC_012583	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	227119196
8	NC_012583	TTCAC	2	10	10194	10203	20 %	40 %	0 %	40 %	227119198
9	NC_012583	ACGCG	2	10	16436	16445	20 %	0 %	40 %	40 %	227119200
10	NC_012583	GTGGC	2	10	16692	16701	0 %	20 %	60 %	20 %	227119200
11	NC_012583	GTTAG	2	10	17178	17187	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012583	TGGTG	2	10	18195	18204	0 %	40 %	60 %	0 %	227119201
13	NC_012583	GGTTT	2	10	18632	18641	0 %	60 %	40 %	0 %	227119201
14	NC_012583	AGATG	2	10	19888	19897	40 %	20 %	40 %	0 %	227119202
15	NC_012583	ACCAC	2	10	21973	21982	40 %	0 %	0 %	60 %	227119203
16	NC_012583	GATCC	2	10	24331	24340	20 %	20 %	20 %	40 %	227119205
17	NC_012583	CCACC	2	10	27114	27123	20 %	0 %	0 %	80 %	227119206
18	NC_012583	AAAGA	2	10	27178	27187	80 %	0 %	20 %	0 %	227119206
19	NC_012583	CCAAT	2	10	29816	29825	40 %	20 %	0 %	40 %	227119209
20	NC_012583	CGCGA	2	10	30040	30049	20 %	0 %	40 %	40 %	227119209
21	NC_012583	TTTGT	2	10	32812	32821	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012583	AAGCG	2	10	33894	33903	40 %	0 %	40 %	20 %	227119212
23	NC_012583	AATGC	2	10	34775	34784	40 %	20 %	20 %	20 %	227119212
24	NC_012583	GCAAA	2	10	35764	35773	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012583	GCTTA	2	10	36701	36710	20 %	40 %	20 %	20 %	227119214
26	NC_012583	AAGCT	2	10	37138	37147	40 %	20 %	20 %	20 %	227119214
27	NC_012583	ACTCA	2	10	37257	37266	40 %	20 %	0 %	40 %	227119214
28	NC_012583	GCGGA	2	10	37696	37705	20 %	0 %	60 %	20 %	227119215
29	NC_012583	GAGCT	2	10	38262	38271	20 %	20 %	40 %	20 %	227119215
30	NC_012583	ACATG	2	10	39950	39959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012583	CCACT	2	10	40514	40523	20 %	20 %	0 %	60 %	227119217
32	NC_012583	GGTTG	2	10	41149	41158	0 %	40 %	60 %	0 %	227119217
33	NC_012583	GTGAA	2	10	41957	41966	40 %	20 %	40 %	0 %	227119217
34	NC_012583	GCTGA	2	10	42939	42948	20 %	20 %	40 %	20 %	227119218
35	NC_012583	TGGGT	2	10	43483	43492	0 %	40 %	60 %	0 %	227119219
36	NC_012583	CTTGG	2	10	43552	43561	0 %	40 %	40 %	20 %	227119219
37	NC_012583	ACTGA	2	10	43615	43624	40 %	20 %	20 %	20 %	227119219
38	NC_012583	TTCAA	2	10	45770	45779	40 %	40 %	0 %	20 %	227119221
39	NC_012583	GTTGC	2	10	47431	47440	0 %	40 %	40 %	20 %	227119224
40	NC_012583	CAATC	2	10	47602	47611	40 %	20 %	0 %	40 %	227119224
41	NC_012583	CATTT	2	10	49970	49979	20 %	60 %	0 %	20 %	227119225
42	NC_012583	ATTCA	2	10	50901	50910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012583	TACCT	2	10	55193	55202	20 %	40 %	0 %	40 %	227119230
44	NC_012583	GAACA	2	10	55778	55787	60 %	0 %	20 %	20 %	227119230
45	NC_012583	TGGTT	2	10	55806	55815	0 %	60 %	40 %	0 %	227119230
46	NC_012583	GCTTG	2	10	57527	57536	0 %	40 %	40 %	20 %	227119232
47	NC_012583	CATGC	2	10	57807	57816	20 %	20 %	20 %	40 %	227119232
48	NC_012583	AGTTG	2	10	61195	61204	20 %	40 %	40 %	0 %	227119234
49	NC_012583	CCATG	2	10	61823	61832	20 %	20 %	20 %	40 %	227119235
50	NC_012583	CAATT	2	10	62029	62038	40 %	40 %	0 %	20 %	227119235
51	NC_012583	GTACA	2	10	62267	62276	40 %	20 %	20 %	20 %	227119236
52	NC_012583	TGGTT	2	10	64097	64106	0 %	60 %	40 %	0 %	227119239
53	NC_012583	GATTT	2	10	64237	64246	20 %	60 %	20 %	0 %	227119239
54	NC_012583	AATGG	2	10	69132	69141	40 %	20 %	40 %	0 %	227119244
55	NC_012583	GCAAG	2	10	71037	71046	40 %	0 %	40 %	20 %	227119245
56	NC_012583	GACAA	2	10	72083	72092	60 %	0 %	20 %	20 %	227119245
57	NC_012583	TTGAC	2	10	73211	73220	20 %	40 %	20 %	20 %	227119246
58	NC_012583	CGCTA	2	10	73772	73781	20 %	20 %	20 %	40 %	227119246
59	NC_012583	TGTGG	2	10	74622	74631	0 %	40 %	60 %	0 %	227119246
60	NC_012583	TGCGC	2	10	74901	74910	0 %	20 %	40 %	40 %	227119246
61	NC_012583	AACCA	2	10	74992	75001	60 %	0 %	0 %	40 %	227119246
62	NC_012583	GCACC	2	10	76836	76845	20 %	0 %	20 %	60 %	227119248
63	NC_012583	ACAGG	2	10	76958	76967	40 %	0 %	40 %	20 %	227119248
64	NC_012583	ATTGG	2	10	77757	77766	20 %	40 %	40 %	0 %	227119249
65	NC_012583	TGGCG	2	10	80606	80615	0 %	20 %	60 %	20 %	227119252
66	NC_012583	ACCCA	2	10	82457	82466	40 %	0 %	0 %	60 %	227119254
67	NC_012583	ATTTC	2	10	83007	83016	20 %	60 %	0 %	20 %	227119255
68	NC_012583	GATCA	2	10	83791	83800	40 %	20 %	20 %	20 %	227119255
69	NC_012583	CTTCA	2	10	87053	87062	20 %	40 %	0 %	40 %	227119259
70	NC_012583	GTTTT	2	10	92642	92651	0 %	80 %	20 %	0 %	227119263
71	NC_012583	AGCAC	2	10	92946	92955	40 %	0 %	20 %	40 %	227119263
72	NC_012583	CTAAG	2	10	96690	96699	40 %	20 %	20 %	20 %	227119266
73	NC_012583	TTGTT	2	10	97211	97220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012583	TACCA	2	10	98789	98798	40 %	20 %	0 %	40 %	227119269
75	NC_012583	GCTTG	2	10	100370	100379	0 %	40 %	40 %	20 %	227119272
76	NC_012583	TGCAA	2	10	100913	100922	40 %	20 %	20 %	20 %	227119273
77	NC_012583	AACCA	2	10	101282	101291	60 %	0 %	0 %	40 %	227119273
78	NC_012583	ATATA	2	10	101714	101723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012583	AATTA	2	10	102289	102298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012583	GGATT	2	10	109276	109285	20 %	40 %	40 %	0 %	227119282
81	NC_012583	CTTTT	2	10	112708	112717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012583	CAATG	2	10	113499	113508	40 %	20 %	20 %	20 %	227119285
83	NC_012583	GCTCA	2	10	113928	113937	20 %	20 %	20 %	40 %	227119285
84	NC_012583	TTAAT	2	10	114884	114893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012583	ACTCA	2	10	117306	117315	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_012583	TTTCA	2	10	117988	117997	20 %	60 %	0 %	20 %	227119288
87	NC_012583	TGAAC	2	10	118687	118696	40 %	20 %	20 %	20 %	227119288
88	NC_012583	CCGAT	2	10	120232	120241	20 %	20 %	20 %	40 %	227119290
89	NC_012583	CGTCC	2	10	120275	120284	0 %	20 %	20 %	60 %	227119290
90	NC_012583	TGGGG	2	10	120599	120608	0 %	20 %	80 %	0 %	227119290
91	NC_012583	GGTAC	2	10	120975	120984	20 %	20 %	40 %	20 %	227119290
92	NC_012583	GTGAT	2	10	121284	121293	20 %	40 %	40 %	0 %	227119291
93	NC_012583	TCCTG	2	10	126787	126796	0 %	40 %	20 %	40 %	227119295
94	NC_012583	GCTGA	2	10	127691	127700	20 %	20 %	40 %	20 %	227119295
95	NC_012583	CTGCT	2	10	128478	128487	0 %	40 %	20 %	40 %	227119295
96	NC_012583	CAATC	2	10	129079	129088	40 %	20 %	0 %	40 %	227119296
97	NC_012583	ACCCT	2	10	130132	130141	20 %	20 %	0 %	60 %	227119296
98	NC_012583	AGCTG	2	10	130499	130508	20 %	20 %	40 %	20 %	227119297
99	NC_012583	CAGTG	2	10	131206	131215	20 %	20 %	40 %	20 %	227119298
100	NC_012583	AGCAC	2	10	131227	131236	40 %	0 %	20 %	40 %	227119298
101	NC_012583	CGATG	2	10	132359	132368	20 %	20 %	40 %	20 %	227119298
102	NC_012583	GCGTC	2	10	135524	135533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_012583	GATCA	2	10	135574	135583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012583	TGATC	2	10	136868	136877	20 %	40 %	20 %	20 %	227119299
105	NC_012583	AGCCA	2	10	138188	138197	40 %	0 %	20 %	40 %	227119301
106	NC_012583	TGCTT	2	10	138464	138473	0 %	60 %	20 %	20 %	227119301
107	NC_012583	CGGAG	2	10	139373	139382	20 %	0 %	60 %	20 %	227119301
108	NC_012583	GGCGC	2	10	139590	139599	0 %	0 %	60 %	40 %	227119301
109	NC_012583	GAGCT	2	10	142574	142583	20 %	20 %	40 %	20 %	227119306
110	NC_012583	ACTGA	2	10	143027	143036	40 %	20 %	20 %	20 %	227119306
111	NC_012583	GCGTG	2	10	143068	143077	0 %	20 %	60 %	20 %	227119306
112	NC_012583	GATTG	2	10	147296	147305	20 %	40 %	40 %	0 %	227119310
113	NC_012583	GTTTG	2	10	147888	147897	0 %	60 %	40 %	0 %	227119311
114	NC_012583	TTCTT	2	10	148183	148192	0 %	80 %	0 %	20 %	227119311
115	NC_012583	GCGAT	2	10	154492	154501	20 %	20 %	40 %	20 %	227119318
116	NC_012583	TTGCC	2	10	154729	154738	0 %	40 %	20 %	40 %	227119318
117	NC_012583	GCGCT	2	10	157152	157161	0 %	20 %	40 %	40 %	227119319
118	NC_012583	CGGTG	2	10	158220	158229	0 %	20 %	60 %	20 %	227119320
119	NC_012583	AGTGA	2	10	158803	158812	40 %	20 %	40 %	0 %	227119320
120	NC_012583	GTTTG	2	10	158862	158871	0 %	60 %	40 %	0 %	227119320
121	NC_012583	AAACG	2	10	164670	164679	60 %	0 %	20 %	20 %	227119325
122	NC_012583	GGTGT	2	10	165481	165490	0 %	40 %	60 %	0 %	227119325
123	NC_012583	CGTTT	2	10	165953	165962	0 %	60 %	20 %	20 %	227119325
124	NC_012583	AACCA	2	10	172348	172357	60 %	0 %	0 %	40 %	227119332
125	NC_012583	AATCC	2	10	174269	174278	40 %	20 %	0 %	40 %	227119334
126	NC_012583	ATGGA	2	10	175007	175016	40 %	20 %	40 %	0 %	227119334
127	NC_012583	TGGCT	2	10	176568	176577	0 %	40 %	40 %	20 %	227119336
128	NC_012583	CTGAA	2	10	177508	177517	40 %	20 %	20 %	20 %	227119337
129	NC_012583	TCTGC	2	10	179615	179624	0 %	40 %	20 %	40 %	227119338
130	NC_012583	CGCTT	2	10	180667	180676	0 %	40 %	20 %	40 %	227119339
131	NC_012583	AGAGA	2	10	185274	185283	60 %	0 %	40 %	0 %	227119344
132	NC_012583	AATTG	2	10	185304	185313	40 %	40 %	20 %	0 %	227119344
133	NC_012583	GCTGC	2	10	185676	185685	0 %	20 %	40 %	40 %	227119345
134	NC_012583	CCAAG	2	10	185988	185997	40 %	0 %	20 %	40 %	227119345
135	NC_012583	ATGGC	2	10	186400	186409	20 %	20 %	40 %	20 %	227119345
136	NC_012583	GATTG	2	10	189326	189335	20 %	40 %	40 %	0 %	227119347
137	NC_012583	GAGCT	2	10	192075	192084	20 %	20 %	40 %	20 %	227119350
138	NC_012583	CGGCA	2	10	195416	195425	20 %	0 %	40 %	40 %	227119353
139	NC_012583	GTTCA	2	10	195827	195836	20 %	40 %	20 %	20 %	227119353
140	NC_012583	AGGAC	2	10	196458	196467	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012583	AAACG	2	10	198797	198806	60 %	0 %	20 %	20 %	227119355
142	NC_012583	TTTGC	2	10	201008	201017	0 %	60 %	20 %	20 %	227119357
143	NC_012583	TAGTG	2	10	201951	201960	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012583	GCATC	2	10	204664	204673	20 %	20 %	20 %	40 %	227119361
145	NC_012583	TGGCT	2	10	205137	205146	0 %	40 %	40 %	20 %	227119362
146	NC_012583	AAACC	2	10	206819	206828	60 %	0 %	0 %	40 %	227119365
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149	NC_012583	ATCAC	2	10	215153	215162	40 %	20 %	0 %	40 %	227119373
150	NC_012583	ATGCA	2	10	218212	218221	40 %	20 %	20 %	20 %	227119378
151	NC_012583	AACCA	2	10	219716	219725	60 %	0 %	0 %	40 %	227119381
152	NC_012583	AAACC	2	10	222086	222095	60 %	0 %	0 %	40 %	227119386
153	NC_012583	TTGGT	2	10	222879	222888	0 %	60 %	40 %	0 %	227119386
154	NC_012583	AGCGA	2	10	223786	223795	40 %	0 %	40 %	20 %	227119386
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156	NC_012583	GAGTG	2	10	228842	228851	20 %	20 %	60 %	0 %	227119395
157	NC_012583	CATCG	2	10	233735	233744	20 %	20 %	20 %	40 %	227119399
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160	NC_012583	CATGG	2	10	235180	235189	20 %	20 %	40 %	20 %	227119402
161	NC_012583	ACTCA	2	10	236062	236071	40 %	20 %	0 %	40 %	227119402
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164	NC_012583	CGGTA	2	10	238521	238530	20 %	20 %	40 %	20 %	227119409
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168	NC_012583	AACCC	2	10	240322	240331	40 %	0 %	0 %	60 %	227119411
169	NC_012583	CAGCA	2	10	241802	241811	40 %	0 %	20 %	40 %	227119413
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175	NC_012583	AGAAA	2	10	252934	252943	80 %	0 %	20 %	0 %	227119422
176	NC_012583	GATAT	2	10	255084	255093	40 %	40 %	20 %	0 %	227119424
177	NC_012583	GGCTG	2	10	256365	256374	0 %	20 %	60 %	20 %	227119425
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181	NC_012583	GGCTT	2	10	258736	258745	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_012583	TTCCT	2	10	259600	259609	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_012583	TCTGC	2	10	270274	270283	0 %	40 %	20 %	40 %	227119438
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191	NC_012583	AAATT	2	10	271865	271874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012583	ACTCA	2	10	272311	272320	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_012583	AGCTG	2	10	272659	272668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_012583	ATTTG	2	10	274664	274673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012583	TCATT	2	10	275597	275606	20 %	60 %	0 %	20 %	227119439
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197	NC_012583	CTTCT	2	10	276842	276851	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_012583	GACCA	2	10	279622	279631	40 %	0 %	20 %	40 %	227119442
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201	NC_012583	TGATC	2	10	284376	284385	20 %	40 %	20 %	20 %	227119446
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234	NC_012583	GTACG	2	10	344720	344729	20 %	20 %	40 %	20 %	227119509
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249	NC_012583	ATTGC	2	10	367679	367688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
250	NC_012583	AGAGT	2	10	367914	367923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
251	NC_012583	TGAAT	2	10	370426	370435	40 %	40 %	20 %	0 %	227119552
252	NC_012583	TGCGT	2	10	370588	370597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_012583	AGAGT	2	10	370866	370875	40 %	20 %	40 %	0 %	227119553
254	NC_012583	GCAAA	2	10	380253	380262	60 %	0 %	20 %	20 %	227119566
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256	NC_012583	CTCGA	2	10	381101	381110	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_012583	GTGTT	2	10	382020	382029	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012583	TTATG	2	10	382250	382259	20 %	60 %	20 %	0 %	227119569
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260	NC_012583	CTCGA	2	10	386580	386589	20 %	20 %	20 %	40 %	227119575
261	NC_012583	TCGCT	2	10	393338	393347	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_012583	TGGAA	2	10	393454	393463	40 %	20 %	40 %	0 %	227119588
263	NC_012583	CGTGT	2	10	395873	395882	0 %	40 %	40 %	20 %	227119592
264	NC_012583	AATAA	2	10	397526	397535	80 %	20 %	0 %	0 %	227119594
265	NC_012583	AAAAT	2	10	398296	398305	80 %	20 %	0 %	0 %	227119595
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267	NC_012583	TTGAT	2	10	400109	400118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_012583	ACTTC	2	10	416111	416120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
282	NC_012583	CATCC	2	10	416512	416521	20 %	20 %	0 %	60 %	227119625
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