MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 2999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	227119189
2	NC_012583	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	227119189
3	NC_012583	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012583	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012583	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	227119190
6	NC_012583	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	227119190
7	NC_012583	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	227119190
8	NC_012583	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	227119190
9	NC_012583	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	227119190
10	NC_012583	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	227119190
11	NC_012583	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	227119190
12	NC_012583	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	227119190
13	NC_012583	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	227119190
14	NC_012583	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012583	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	227119191
16	NC_012583	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	227119191
17	NC_012583	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012583	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	227119193
19	NC_012583	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	227119193
20	NC_012583	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	227119194
21	NC_012583	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	227119194
22	NC_012583	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	227119194
23	NC_012583	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	227119195
24	NC_012583	GTCT	2	8	6195	6202	0 %	50 %	25 %	25 %	227119195
25	NC_012583	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	227119195
26	NC_012583	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	227119195
27	NC_012583	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	227119196
28	NC_012583	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	227119196
29	NC_012583	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	227119196
30	NC_012583	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	227119196
31	NC_012583	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	227119196
32	NC_012583	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	227119196
33	NC_012583	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012583	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012583	AGTG	2	8	8482	8489	25 %	25 %	50 %	0 %	227119197
36	NC_012583	GCAA	2	8	8718	8725	50 %	0 %	25 %	25 %	227119197
37	NC_012583	AATG	2	8	9250	9257	50 %	25 %	25 %	0 %	227119198
38	NC_012583	TGGT	2	8	9408	9415	0 %	50 %	50 %	0 %	227119198
39	NC_012583	GAAG	2	8	9625	9632	50 %	0 %	50 %	0 %	227119198
40	NC_012583	CTAG	2	8	9837	9844	25 %	25 %	25 %	25 %	227119198
41	NC_012583	TCAA	2	8	10011	10018	50 %	25 %	0 %	25 %	227119198
42	NC_012583	GATT	2	8	10501	10508	25 %	50 %	25 %	0 %	227119198
43	NC_012583	CCAA	2	8	10550	10557	50 %	0 %	0 %	50 %	227119198
44	NC_012583	AGTT	2	8	10747	10754	25 %	50 %	25 %	0 %	227119198
45	NC_012583	GAGC	2	8	10984	10991	25 %	0 %	50 %	25 %	227119198
46	NC_012583	GTTG	2	8	11104	11111	0 %	50 %	50 %	0 %	227119198
47	NC_012583	CACG	2	8	11176	11183	25 %	0 %	25 %	50 %	227119198
48	NC_012583	AATC	2	8	11912	11919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012583	TCAC	2	8	12133	12140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012583	GTTT	2	8	12723	12730	0 %	75 %	25 %	0 %	227119199
51	NC_012583	ACCA	2	8	13346	13353	50 %	0 %	0 %	50 %	227119199
52	NC_012583	GAGT	2	8	13384	13391	25 %	25 %	50 %	0 %	227119199
53	NC_012583	GTGC	2	8	13463	13470	0 %	25 %	50 %	25 %	227119199
54	NC_012583	GCTG	2	8	13692	13699	0 %	25 %	50 %	25 %	227119199
55	NC_012583	ATGG	2	8	14297	14304	25 %	25 %	50 %	0 %	227119199
56	NC_012583	CGAT	2	8	14861	14868	25 %	25 %	25 %	25 %	227119200
57	NC_012583	ATTG	2	8	15224	15231	25 %	50 %	25 %	0 %	227119200
58	NC_012583	GAAG	2	8	16484	16491	50 %	0 %	50 %	0 %	227119200
59	NC_012583	AGCC	2	8	16979	16986	25 %	0 %	25 %	50 %	227119200
60	NC_012583	TATG	2	8	18873	18880	25 %	50 %	25 %	0 %	227119201
61	NC_012583	GGAT	2	8	19127	19134	25 %	25 %	50 %	0 %	227119201
62	NC_012583	CAAG	2	8	19600	19607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012583	TCAT	2	8	19739	19746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012583	ATTC	2	8	19866	19873	25 %	50 %	0 %	25 %	227119202
65	NC_012583	GGAA	2	8	20412	20419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012583	TGCC	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	227119203
67	NC_012583	GCGG	2	8	21048	21055	0 %	0 %	75 %	25 %	227119203
68	NC_012583	CGGG	2	8	21605	21612	0 %	0 %	75 %	25 %	227119203
69	NC_012583	GGGC	2	8	21691	21698	0 %	0 %	75 %	25 %	227119203
70	NC_012583	TTTC	2	8	21748	21755	0 %	75 %	0 %	25 %	227119203
71	NC_012583	TTGA	2	8	21960	21967	25 %	50 %	25 %	0 %	227119203
72	NC_012583	CAAC	2	8	22043	22050	50 %	0 %	0 %	50 %	227119203
73	NC_012583	GCAG	2	8	22308	22315	25 %	0 %	50 %	25 %	227119203
74	NC_012583	TGGC	2	8	23625	23632	0 %	25 %	50 %	25 %	227119205
75	NC_012583	ATTG	2	8	23701	23708	25 %	50 %	25 %	0 %	227119205
76	NC_012583	CAAA	2	8	23723	23730	75 %	0 %	0 %	25 %	227119205
77	NC_012583	ATTT	2	8	24179	24186	25 %	75 %	0 %	0 %	227119205
78	NC_012583	ATGA	2	8	25303	25310	50 %	25 %	25 %	0 %	227119205
79	NC_012583	ATCG	2	8	25827	25834	25 %	25 %	25 %	25 %	227119205
80	NC_012583	ATGG	2	8	26271	26278	25 %	25 %	50 %	0 %	227119205
81	NC_012583	TTAT	2	8	26711	26718	25 %	75 %	0 %	0 %	227119206
82	NC_012583	ATTT	2	8	26808	26815	25 %	75 %	0 %	0 %	227119206
83	NC_012583	TGGG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	75 %	0 %	227119206
84	NC_012583	TGTT	2	8	27028	27035	0 %	75 %	25 %	0 %	227119206
85	NC_012583	GCGG	2	8	27073	27080	0 %	0 %	75 %	25 %	227119206
86	NC_012583	AAGA	2	8	27130	27137	75 %	0 %	25 %	0 %	227119206
87	NC_012583	ATTG	2	8	27156	27163	25 %	50 %	25 %	0 %	227119206
88	NC_012583	ATTT	2	8	27526	27533	25 %	75 %	0 %	0 %	227119207
89	NC_012583	AATG	2	8	27678	27685	50 %	25 %	25 %	0 %	227119207
90	NC_012583	TGAC	2	8	28215	28222	25 %	25 %	25 %	25 %	227119208
91	NC_012583	ACAA	2	8	28482	28489	75 %	0 %	0 %	25 %	227119208
92	NC_012583	TTGA	2	8	28763	28770	25 %	50 %	25 %	0 %	227119208
93	NC_012583	TAAA	2	8	28948	28955	75 %	25 %	0 %	0 %	227119208
94	NC_012583	TGGT	2	8	31073	31080	0 %	50 %	50 %	0 %	227119210
95	NC_012583	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	227119210
96	NC_012583	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	227119210
97	NC_012583	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	227119211
98	NC_012583	TTGG	2	8	32322	32329	0 %	50 %	50 %	0 %	227119211
99	NC_012583	GCAA	2	8	32569	32576	50 %	0 %	25 %	25 %	227119211
100	NC_012583	AATC	2	8	32793	32800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012583	ATCG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
102	NC_012583	TATG	2	8	34411	34418	25 %	50 %	25 %	0 %	227119212
103	NC_012583	TACG	2	8	34706	34713	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
104	NC_012583	CAGT	2	8	35337	35344	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
105	NC_012583	GGCA	2	8	35470	35477	25 %	0 %	50 %	25 %	227119212
106	NC_012583	AAGT	2	8	35518	35525	50 %	25 %	25 %	0 %	227119212
107	NC_012583	TTGA	2	8	36126	36133	25 %	50 %	25 %	0 %	227119213
108	NC_012583	AATC	2	8	36942	36949	50 %	25 %	0 %	25 %	227119214
109	NC_012583	GTCA	2	8	37224	37231	25 %	25 %	25 %	25 %	227119214
110	NC_012583	GTTG	2	8	37436	37443	0 %	50 %	50 %	0 %	227119214
111	NC_012583	TGCA	2	8	37522	37529	25 %	25 %	25 %	25 %	227119214
112	NC_012583	TGAT	2	8	37552	37559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012583	TGGT	2	8	37840	37847	0 %	50 %	50 %	0 %	227119215
114	NC_012583	GGTT	2	8	38123	38130	0 %	50 %	50 %	0 %	227119215
115	NC_012583	TATG	2	8	38405	38412	25 %	50 %	25 %	0 %	227119215
116	NC_012583	AACG	2	8	39041	39048	50 %	0 %	25 %	25 %	227119215
117	NC_012583	TGAG	2	8	39803	39810	25 %	25 %	50 %	0 %	227119216
118	NC_012583	AGTG	2	8	40377	40384	25 %	25 %	50 %	0 %	227119217
119	NC_012583	GCAA	2	8	40577	40584	50 %	0 %	25 %	25 %	227119217
120	NC_012583	ACGT	2	8	40739	40746	25 %	25 %	25 %	25 %	227119217
121	NC_012583	TGGA	2	8	41434	41441	25 %	25 %	50 %	0 %	227119217
122	NC_012583	TCGT	2	8	41687	41694	0 %	50 %	25 %	25 %	227119217
123	NC_012583	TGTT	2	8	42035	42042	0 %	75 %	25 %	0 %	227119217
124	NC_012583	CAAG	2	8	43680	43687	50 %	0 %	25 %	25 %	227119219
125	NC_012583	TTTC	2	8	43760	43767	0 %	75 %	0 %	25 %	227119219
126	NC_012583	GTCG	2	8	44139	44146	0 %	25 %	50 %	25 %	227119220
127	NC_012583	CAAA	2	8	44237	44244	75 %	0 %	0 %	25 %	227119220
128	NC_012583	CCGC	2	8	44275	44282	0 %	0 %	25 %	75 %	227119220
129	NC_012583	AGTA	2	8	44450	44457	50 %	25 %	25 %	0 %	227119220
130	NC_012583	AAGT	2	8	45446	45453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012583	AGAA	2	8	46072	46079	75 %	0 %	25 %	0 %	227119221
132	NC_012583	CTTT	2	8	46123	46130	0 %	75 %	0 %	25 %	227119222
133	NC_012583	TGGT	2	8	46296	46303	0 %	50 %	50 %	0 %	227119222
134	NC_012583	TGGG	2	8	46930	46937	0 %	25 %	75 %	0 %	227119223
135	NC_012583	TTTC	2	8	47487	47494	0 %	75 %	0 %	25 %	227119224
136	NC_012583	CATA	2	8	47679	47686	50 %	25 %	0 %	25 %	227119224
137	NC_012583	CAGG	2	8	47721	47728	25 %	0 %	50 %	25 %	227119224
138	NC_012583	TGAG	2	8	48366	48373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012583	TGGG	2	8	48889	48896	0 %	25 %	75 %	0 %	227119225
140	NC_012583	GTTG	2	8	49513	49520	0 %	50 %	50 %	0 %	227119225
141	NC_012583	CTTT	2	8	49927	49934	0 %	75 %	0 %	25 %	227119225
142	NC_012583	ATCT	2	8	50931	50938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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