MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 13646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012583	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119189
3	NC_012583	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119189
4	NC_012583	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012583	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012583	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012583	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012583	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012583	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012583	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012583	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012583	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012583	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012583	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012583	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012583	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012583	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012583	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119190
19	NC_012583	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119190
20	NC_012583	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
21	NC_012583	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
22	NC_012583	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
23	NC_012583	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
24	NC_012583	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
25	NC_012583	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
26	NC_012583	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
27	NC_012583	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119190
28	NC_012583	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119190
29	NC_012583	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119190
30	NC_012583	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
31	NC_012583	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
32	NC_012583	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
33	NC_012583	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119190
34	NC_012583	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119190
35	NC_012583	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
36	NC_012583	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
37	NC_012583	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
38	NC_012583	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119190
39	NC_012583	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
40	NC_012583	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119190
41	NC_012583	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012583	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012583	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012583	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119191
45	NC_012583	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119191
46	NC_012583	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119191
47	NC_012583	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119191
48	NC_012583	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119191
49	NC_012583	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119191
50	NC_012583	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119192
51	NC_012583	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119192
52	NC_012583	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119192
53	NC_012583	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119192
54	NC_012583	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119192
55	NC_012583	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119193
56	NC_012583	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012583	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119194
58	NC_012583	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119194
59	NC_012583	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119194
60	NC_012583	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119194
61	NC_012583	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119194
62	NC_012583	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119194
63	NC_012583	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119194
64	NC_012583	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119194
65	NC_012583	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119194
66	NC_012583	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119194
67	NC_012583	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119195
68	NC_012583	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119195
69	NC_012583	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119195
70	NC_012583	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119195
71	NC_012583	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119195
72	NC_012583	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119195
73	NC_012583	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119195
74	NC_012583	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119195
75	NC_012583	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012583	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119196
77	NC_012583	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
78	NC_012583	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119196
79	NC_012583	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
80	NC_012583	TGC	2	6	7071	7076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
81	NC_012583	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119196
82	NC_012583	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
83	NC_012583	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119196
84	NC_012583	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119196
85	NC_012583	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119196
86	NC_012583	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
87	NC_012583	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
88	NC_012583	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
89	NC_012583	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119196
90	NC_012583	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119196
91	NC_012583	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
92	NC_012583	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
93	NC_012583	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
94	NC_012583	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
95	NC_012583	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
96	NC_012583	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
97	NC_012583	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
98	NC_012583	TAA	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012583	CAT	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119197
100	NC_012583	CAA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119197
101	NC_012583	CAA	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119197
102	NC_012583	GCC	2	6	8613	8618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119197
103	NC_012583	TGC	2	6	8629	8634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119197
104	NC_012583	ACC	2	6	8855	8860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119197
105	NC_012583	TGA	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119197
106	NC_012583	TAG	2	6	8988	8993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119198
107	NC_012583	CTT	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
108	NC_012583	TGG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
109	NC_012583	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
110	NC_012583	GTG	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
111	NC_012583	AGC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
112	NC_012583	CAG	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
113	NC_012583	TGC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
114	NC_012583	ATC	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
115	NC_012583	GTT	2	6	9689	9694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119198
116	NC_012583	AGC	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
117	NC_012583	GCA	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
118	NC_012583	TGC	2	6	10002	10007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
119	NC_012583	TGC	2	6	10086	10091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
120	NC_012583	CTG	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
121	NC_012583	CAT	2	6	10154	10159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
122	NC_012583	GGT	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
123	NC_012583	TGG	2	6	10351	10356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
124	NC_012583	GCT	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
125	NC_012583	GCA	2	6	10453	10458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
126	NC_012583	TGA	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119198
127	NC_012583	GGC	3	9	10652	10660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119198
128	NC_012583	CAT	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
129	NC_012583	TCG	2	6	10902	10907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
130	NC_012583	CTT	2	6	10921	10926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
131	NC_012583	TGC	2	6	11004	11009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
132	NC_012583	GTC	2	6	11121	11126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
133	NC_012583	ACC	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
134	NC_012583	TCA	2	6	11289	11294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
135	NC_012583	GGT	2	6	11302	11307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
136	NC_012583	CAC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
137	NC_012583	TTA	2	6	11445	11450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119198
138	NC_012583	GCA	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
139	NC_012583	ATC	2	6	11498	11503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
140	NC_012583	ACC	2	6	11512	11517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
141	NC_012583	TGG	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
142	NC_012583	CGG	2	6	11572	11577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119198
143	NC_012583	TGC	2	6	11613	11618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
144	NC_012583	TCT	2	6	11695	11700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
145	NC_012583	TCT	2	6	11859	11864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012583	TAC	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012583	AAC	2	6	11975	11980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012583	ATT	2	6	11987	11992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012583	GGT	2	6	12074	12079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012583	CTC	3	9	12170	12178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_012583	TGA	2	6	12184	12189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012583	GGA	2	6	12198	12203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012583	AAG	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
154	NC_012583	ACA	2	6	12353	12358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119199
155	NC_012583	ACG	2	6	12419	12424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119199
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158	NC_012583	CAT	2	6	12618	12623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
159	NC_012583	GGT	2	6	12632	12637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119199
160	NC_012583	GCC	2	6	12650	12655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119199
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172	NC_012583	CTG	2	6	13406	13411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119199
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223	NC_012583	TGA	2	6	16586	16591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119200
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228	NC_012583	AAG	2	6	17026	17031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
229	NC_012583	TCC	2	6	17051	17056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
230	NC_012583	CAA	2	6	17227	17232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_012583	TGG	2	6	17351	17356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119201
232	NC_012583	GGC	2	6	17398	17403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119201
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243	NC_012583	ACC	2	6	18710	18715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119201
244	NC_012583	GTG	2	6	18787	18792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119201
245	NC_012583	TGA	2	6	18828	18833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119201
246	NC_012583	GCA	2	6	18837	18842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119201
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248	NC_012583	TTG	2	6	19228	19233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119201
249	NC_012583	CAG	2	6	19305	19310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119201
250	NC_012583	GCT	2	6	19329	19334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119201
251	NC_012583	GCC	2	6	19344	19349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119201
252	NC_012583	GTG	2	6	19524	19529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_012583	TTG	2	6	19638	19643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012583	CTG	2	6	19848	19853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119202
255	NC_012583	CAG	2	6	19904	19909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119202
256	NC_012583	CGT	2	6	19918	19923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119202
257	NC_012583	CTG	2	6	20018	20023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119202
258	NC_012583	CTT	2	6	20107	20112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119202
259	NC_012583	ATC	2	6	20138	20143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119202
260	NC_012583	TGA	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119202
261	NC_012583	GGC	2	6	20334	20339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_012583	TGG	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119203
263	NC_012583	CTG	2	6	20593	20598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119203
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265	NC_012583	CAT	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119203
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271	NC_012583	GCT	2	6	21329	21334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119203
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289	NC_012583	CGT	2	6	22268	22273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119203
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362	NC_012583	GTT	2	6	27982	27987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
363	NC_012583	GTG	2	6	28081	28086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119208
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500	NC_012583	ATC	2	6	40709	40714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119217

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